Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,075,803 | G→C | 5.3% | A272G (GCC→GGC) | PP_5328 ← | phosphate ABC transporter permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,075,803 | 0 | G | C | 5.3% | 357.3 / 9.3 | 113 | A272G (GCC→GGC) | PP_5328 | phosphate ABC transporter permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (56/51); new base C (3/3); total (59/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.85e-01 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ACTGGGCCAGCCCCCCCTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACC > NC_002947/6075654‑6075952 | aCTGGGCCAGCCCCCCCTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGGTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGACTGAACACGTCGGCCgggg > 1:357412/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCCCCCTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACgga < 2:646363/150‑2 (MQ=255) cccccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAATCGGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGCCACGGCCgac < 1:138824/150‑3 (MQ=255) ccccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATATCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACAAGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTg > 1:736993/1‑150 (MQ=255) cccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGa > 1:533571/1‑150 (MQ=255) cccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGa > 1:1539194/1‑150 (MQ=255) cccccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGa < 2:1094681/150‑1 (MQ=255) ccccTTGGAGTCACCGATGATCAGAGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGCGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGCCGGCCGTGGCACGGCCGTTGAt > 2:120330/1‑150 (MQ=255) cccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGtt < 1:1321107/146‑1 (MQ=255) cccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGtt > 2:1321107/1‑146 (MQ=255) cccTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATc > 2:1840174/1‑150 (MQ=255) cTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCAc < 2:1827033/150‑1 (MQ=255) gTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAg > 1:985120/1‑150 (MQ=255) cGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGt > 2:1958745/1‑150 (MQ=255) cGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGt > 2:1916392/1‑150 (MQ=255) atgatCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGGCGGCCGTGGCACGGcc < 2:457259/128‑1 (MQ=255) gatCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTg < 2:1625575/150‑1 (MQ=255) tCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCCCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGc > 1:922295/1‑150 (MQ=255) gCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTg > 1:1721774/1‑150 (MQ=255) cGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTgg < 1:1030748/150‑1 (MQ=255) aaaTGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGt < 2:786814/150‑1 (MQ=255) gccgccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGAt > 2:742864/1‑150 (MQ=255) cgccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTAGATGa > 1:1418922/1‑150 (MQ=255) gccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGaa > 1:1484402/1‑150 (MQ=255) gccAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGaa < 1:1840174/150‑1 (MQ=255) cAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGa > 1:1126333/1‑150 (MQ=255) aaCCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTg > 2:140447/1‑132 (MQ=255) aaCCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGat > 1:408746/1‑150 (MQ=255) ggCCGTGGCGGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCag < 2:981403/150‑2 (MQ=255) gTGGCAGTAATTTCGGTGTAGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGtc > 2:191299/1‑150 (MQ=255) tGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGtct > 2:181675/1‑150 (MQ=255) ggCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGtctc < 1:181675/150‑1 (MQ=255) aGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATAACGTACAGCCAGTGCTGCCGTGTGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGt > 2:266785/1‑150 (MQ=255) aTTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCAtt < 2:1126333/150‑1 (MQ=255) tCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGc < 2:736993/150‑1 (MQ=255) tCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTATCGGTcgtgtgg > 2:1713803/1‑144 (MQ=255) ggTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTggg > 1:1699448/1‑112 (MQ=255) tgtCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCa > 1:2347750/1‑150 (MQ=255) cGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTTTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGtt < 1:1654547/150‑1 (MQ=255) gcgcTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCCCCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCg > 2:1788519/1‑150 (MQ=255) gcgcTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCg > 1:1069294/1‑150 (MQ=255) gcTATAAGATGACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCGTGTAGCGCAGGCGGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGAt < 2:357412/150‑1 (MQ=255) aTCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGata > 1:108754/1‑112 (MQ=255) aTCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGata < 2:108754/112‑1 (MQ=255) aGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGtt > 2:1641031/1‑150 (MQ=255) aGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTAAAGCCAGTGATGGCGTGGGTAAATAAAAAAACGCTTCACCGTCTCGGTCGGTTGCTGCAGTTCGATGCGGtt > 2:148593/1‑150 (MQ=255) aaCTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATc < 1:167201/69‑1 (MQ=255) aaCTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATc > 2:167201/1‑69 (MQ=255) aaCTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGc > 2:2229407/1‑150 (MQ=255) cTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTc > 1:1865720/1‑150 (MQ=255) ttGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTTAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGtt > 1:936535/1‑133 (MQ=255) ttGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCCCTTAATAAGGGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCg > 1:419474/1‑150 (MQ=255) ttGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGa > 2:1679893/1‑94 (MQ=255) ttGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGa < 1:1679893/94‑1 (MQ=255) ttGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGtt < 2:936535/133‑1 (MQ=255) tAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTc > 2:139172/1‑131 (MQ=255) tAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTc < 1:139172/131‑1 (MQ=255) tAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCggtg < 2:1413456/150‑1 (MQ=255) ggCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCTGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGa > 1:1615466/1‑150 (MQ=255) ggCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTc < 1:1540341/142‑1 (MQ=255) ggCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTc > 2:1540341/1‑142 (MQ=255) aGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGCTCGCGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCg < 1:148593/150‑1 (MQ=255) aGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATAttct > 2:1362981/1‑91 (MQ=255) aGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATAttct < 1:1362981/91‑1 (MQ=255) aGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGgtggtg < 2:1897692/141‑1 (MQ=255) aGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGgtggtg > 1:1897692/1‑141 (MQ=255) aGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTAGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGCTGCGGTTCTTGGCGTTGGTGACCTCTTCg < 2:1418922/150‑1 (MQ=255) gCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATAtt > 2:410463/1‑87 (MQ=255) gCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATAtt < 1:410463/87‑1 (MQ=255) gCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCggtgg > 1:1820532/1‑137 (MQ=255) gCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCggtgg < 2:1820532/137‑1 (MQ=255) gCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGt > 2:3600/1‑150 (MQ=255) ctctTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCAGTGGCACGGCCGTTGACCACGTACAGCCGGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGTTGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGtc < 2:879009/150‑1 (MQ=255) ctattttCGCGCAGGCTGAACAAGTCGGCCGTGGCACGGCCGACACGACCGTCCAGCCAGTTCTGGGGTTGTGCGGTGTAGATATTGTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGtc < 2:879313/144‑1 (MQ=255) tctTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGtca > 2:575322/1‑150 (MQ=255) ttGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGc > 1:1215249/1‑118 (MQ=255) ttGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGc < 2:1215249/118‑1 (MQ=255) gTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTcatcat < 1:742864/150‑1 (MQ=255) gTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTcatcat > 1:632119/1‑150 (MQ=255) gcAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGa > 1:1555454/1‑129 (MQ=255) gcAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGa < 2:1555454/129‑1 (MQ=255) cAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTc < 1:1378487/150‑1 (MQ=255) aGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTcc < 1:1958745/150‑1 (MQ=255) aGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTCTcc < 1:1916392/150‑1 (MQ=255) gCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTc > 2:1268443/1‑112 (MQ=255) cTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTg < 2:632119/150‑1 (MQ=255) tGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGc > 1:1779181/1‑150 (MQ=255) aaCACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCggtg < 1:864595/117‑1 (MQ=255) acGGCCGTGCCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCAt < 1:140082/79‑1 (MQ=255) acGGCCGTGCCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCAt > 2:140082/2‑80 (MQ=255) acGGCCGTGCCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTcatcat < 2:1888518/130‑1 (MQ=255) acGGCCGTGCCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTcatcat > 1:1888518/2‑131 (MQ=255) ggCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTc > 1:157636/1‑150 (MQ=255) ggCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTc < 2:2347750/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTACACAACCGTCAACTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCg > 2:1191777/1‑150 (MQ=255) gCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCATGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCg > 1:2293381/1‑150 (MQ=255) cGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGac < 1:3600/150‑1 (MQ=255) ggCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGaccac < 1:120330/150‑1 (MQ=255) ggCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGGCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGaccac < 2:922295/150‑1 (MQ=255) gCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGaccacc > 1:281718/1‑150 (MQ=255) | ACTGGGCCAGCCCCCCCTTGGAGTCACCGATGATCAGCGAAATGCCGCCAACCAGCTGGGCCGTGGCAGTAATTTCGGTGTCGGCGCTATCAGACAACTTGTAACGGCCGTTGAGGCTCTTGTCGCGCAGGCTGAACACGTCGGCCGTGGCACGGCCGTTGATCACGTACAGCCAGTGCTGGCGTGGGTCGATGAAGATATTCTTCACCGTCTCGGTCATTTGCGGCAGTTCGATGCGGTTCTGCTCGGTGGTGACCTCTTCGGTCATCATGTTTTCCGTGCGGGTCAGCTCGACCACC > NC_002947/6075654‑6075952 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |