| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,108,391 | G→C | 6.6% | W23C (TGG→TGC) | PP_5358 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,108,391 | 0 | G | C | 6.6% | 278.3 / 6.5 | 89 | W23C (TGG→TGC) | PP_5358 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (46/37); new base C (2/4); total (48/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 | |||||||||||
GCAGCGCAGTATGAACTTGATTGCTACCTGTACGACAGGCCAGGAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGACGATGCCGTAGCGCTCAAGCGTATCGCCTTTGTCCGGGATGCCAATGGCCGCAAGCGCCTGG > NC_002947/6108244‑6108530 | gcagcgcagTATGAACTTGATTGCTACCTGTACGACAGGCCAGGAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGca > 1:2318159/1‑150 (MQ=255) agTATGAACTTGATTGCTACCTGTACGACAGGCCAGGAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCCGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGCCACAACCag < 2:161583/150‑2 (MQ=255) tATGAACTTGATTGCTACCTGTACGACAGGCCAGGAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATgg < 1:1744114/150‑1 (MQ=255) tATGAACTTGATTGCTACCTGTACGACAGGCCAGGAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGCCACAACCaggc < 1:1902886/150‑4 (MQ=255) gAACTTGATTGCTACCTGTACGACAGGCCAGGAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCT‑CGTCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGtt < 1:640597/150‑1 (MQ=255) aaattGATTGCTACCTGTACGACAGGCCAGGAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTg > 1:326756/4‑150 (MQ=255) ttGATTGCTACCTGTACCATAGGCCAGGAACTAAGTTACGCTTGATCTACCAGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGGACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCAAAACCATGGGTTGCGt < 2:461333/150‑1 (MQ=255) tGTACGACAGGCCAGGAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGc < 1:594812/136‑1 (MQ=255) tGTACGACAGGCCAGGAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGc > 2:594812/1‑136 (MQ=255) tACGACAGGCCAGGAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGa > 1:869238/1‑150 (MQ=255) aCGACAGGCCAGGAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGaa < 1:2182218/150‑1 (MQ=255) aGGCCAGGAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGt > 2:1854931/1‑150 (MQ=255) gAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACgg > 2:917793/1‑141 (MQ=255) gAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACgg < 1:917793/141‑1 (MQ=255) gAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTAATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGAGCCTTGTGGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGGCAAACAg > 1:544372/1‑150 (MQ=255) cGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCAt > 2:1392729/1‑150 (MQ=255) gCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGATTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCAtt < 1:1855334/150‑1 (MQ=255) ttAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGGGGCACAAAAATGGGTGGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTgcgc < 2:84757/150‑1 (MQ=255) aGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCt < 1:1868131/123‑1 (MQ=255) aGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCt > 2:1868131/1‑123 (MQ=255) aGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACgg > 1:179365/1‑130 (MQ=255) aGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACgg < 2:179365/130‑1 (MQ=255) aGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCaa > 1:2037660/1‑150 (MQ=255) cTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCAt < 1:1204358/101‑1 (MQ=255) cTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCAt > 2:1204358/1‑101 (MQ=255) cTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAAc > 1:789500/1‑150 (MQ=255) gATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCg < 1:1392729/150‑1 (MQ=255) aCCTGTTTTGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGccccg > 2:335379/1‑148 (MQ=255) aCCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGt < 1:2180731/97‑1 (MQ=255) aCCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGt > 2:2180731/1‑97 (MQ=255) aCCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTg > 1:1573137/1‑150 (MQ=255) aCCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTg > 1:89561/1‑150 (MQ=255) aCCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTg < 2:2037660/150‑1 (MQ=255) ccTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTgg > 2:353264/1‑150 (MQ=255) cTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACgg > 2:19197/1‑118 (MQ=255) cTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACgg < 1:235108/118‑1 (MQ=255) cTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACgg > 2:235108/1‑118 (MQ=255) cTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACgg < 1:19197/118‑1 (MQ=255) cTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGa > 2:306024/1‑150 (MQ=255) tGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAg > 2:1867322/1‑150 (MQ=255) tGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCCGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAAATCGACCTGGAg > 1:2277968/1‑150 (MQ=255) gCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGa < 2:230971/150‑1 (MQ=255) cATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGAc < 2:326756/150‑1 (MQ=255) cATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGAc < 2:789500/150‑1 (MQ=255) atatGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGACg < 1:1867322/150‑1 (MQ=255) tGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCAt < 1:1844774/77‑1 (MQ=255) tGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCAt > 2:1844774/1‑77 (MQ=255) tGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTgc < 1:1528566/119‑1 (MQ=255) tGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTgc > 2:1528566/1‑119 (MQ=255) gCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTTAAAAGGCCCTGGAACgg < 2:2394531/103‑1 (MQ=255) gCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACgg > 1:2394531/1‑103 (MQ=255) aaaTGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCAt > 2:2376782/1‑74 (MQ=255) aaaTGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCAt < 1:2376782/74‑1 (MQ=255) aaaTGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTgcg > 1:1958354/1‑117 (MQ=255) aaaTGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTgcg < 2:1958354/117‑1 (MQ=255) gtGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGACGATGCCGTa > 2:1648220/2‑150 (MQ=255) gTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGGCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGACGATGCCGTAgc < 1:70925/150‑1 (MQ=255) ccTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGt > 1:1895474/1‑73 (MQ=255) ccTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGt < 2:1895474/73‑1 (MQ=255) agaACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGAAATGGCACGGGTATAAAGTCGCAACACTGGTTGCCACTGGGAGTTTCTTGACGATGCCGTAGCGCTCAAGCGTa < 1:1854931/150‑1 (MQ=255) ccTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGccc > 2:435184/1‑74 (MQ=255) ccTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGccc < 1:435184/74‑1 (MQ=255) 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ctTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTTCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGACGATGCCGTAGCGCTCAAGCGTATCGCCtt > 2:888832/1‑150 (MQ=255) gtgcTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGACGATGCCGTAGCGCTCAAGCGTATCGCCTTTGTc > 1:2403101/4‑150 (MQ=255) cTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGACGATGCCGTAGCGCTCAAGCGTATCGCCTTTGTCCgg < 2:1573137/150‑1 (MQ=255) aTGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTgc > 1:1386196/1‑84 (MQ=255) aTGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTgc < 2:1386196/84‑1 (MQ=255) aTGCTGGTAGACA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGACGATGCCGTAGCACTCAAGCGTATCGCCTTTGTCCGAGAt > 1:838602/1‑150 (MQ=255) 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ccatGGTTGTGCCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGACGATGCCGTAGCGCTCAAGCGTATCGCCTTTGTCCGGGAt > 2:2009424/4‑129 (MQ=255) catGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGACGATGCCGTAGCGCTCAAGCGTATCGCCTTTGTCCGGGATGCCAATAGACGCAAGCGCCTgg > 2:2244280/3‑150 (MQ=255) catGGTTGTGCCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGACGATGCCGTAGCGCTCAAGCGTATCGCCTTTGTCCGGGATGCCAAt < 1:2076031/132‑1 (MQ=255) catGGTTGTGCCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGACGATGCCGTAGCGCTCAAGCGTATCGCCTTTGTCCGGGATGCCAAt > 2:2076031/3‑134 (MQ=255) gCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACgg > 1:1546339/1‑37 (MQ=255) gCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACgg < 2:1546339/37‑1 (MQ=255) | GCAGCGCAGTATGAACTTGATTGCTACCTGTACGACAGGCCAGGAACGCAGTTAAGCTGGATCTACCTGTTTGGAGCATATGCAAATGTTGACCCTGGAGAACCTCTTCGTCCTGATGCTGGTAGCCA‑CGGCAGGCGCCTGGTTGTGGCACAACCATGGGTTGCGTGAAAAGGCCCTGGAACGGGTCAAACAGCATTGCGCCAAACTCGACCTGGAGTTGCTTGACGATGCCGTAGCGCTCAAGCGTATCGCCTTTGTCCGGGATGCCAATGGCCGCAAGCGCCTGG > NC_002947/6108244‑6108530 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |