Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,116,752 | G→A | 5.3% | R302H (CGT→CAT) | lpd → | dihydrolipoyl dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,116,752 | 0 | G | A | 5.3% | 291.4 / 4.2 | 94 | R302H (CGT→CAT) | lpd | dihydrolipoyl dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/41); new base A (2/3); total (50/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.08e-01 |
GAGCCTGCCGCCGGGGGTACCGCAGAATCGCTGCAAGCCGATTACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCTCATCCCTGGCGTGAT > NC_002947/6116604‑6116899 | gAGCCTGCCGCCGGGGGTACCGCAGAATCGCTGCAAGCCGATTACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGt > 2:308235/1‑150 (MQ=255) gCCTGCCGCCGGGGGTACCGCAGAATCGCTGCAAGCCGATTACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTAc < 2:1244029/150‑1 (MQ=255) gccgccGGGGGTACCGCAGAATCGCTGCAAGCCGATTACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCa < 2:256215/150‑1 (MQ=255) cGCAGAATCGCTGCAAGCCGATTACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTg > 1:152587/1‑150 (MQ=255) cAGAATCGCTGCAAGCCGATTACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTggg < 1:160668/150‑1 (MQ=255) cAGAATCGCTGCAAGCCGATTACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGCGGCGGTAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTggg > 1:761603/1‑150 (MQ=255) aGAATCGCTGCAAGCCGATTACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGt < 1:1571262/150‑1 (MQ=255) aGAATCGCTGCAAGCCGATTACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGt < 1:190163/150‑1 (MQ=255) aGAATCGCTGCAAGCCGATTACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGt < 1:2109754/150‑1 (MQ=255) tGCAAGCCGATTACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCg > 2:624727/1‑150 (MQ=255) aaGCCGATTACGTGTTGGTTGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAATAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACg < 2:1038542/150‑1 (MQ=255) aGCCGATTACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGt > 1:2180704/1‑150 (MQ=255) ttACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGt > 2:642759/1‑144 (MQ=255) ttACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGt < 1:642759/144‑1 (MQ=255) ttACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTc < 1:624727/150‑1 (MQ=255) cGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCggg < 2:1849237/150‑1 (MQ=255) gtgtTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGAc < 2:2251686/138‑1 (MQ=255) gtgtTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGAc > 1:2251686/1‑138 (MQ=255) gtgtTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGc < 1:719571/150‑1 (MQ=255) tgtTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGcc > 2:303288/1‑150 (MQ=255) gtggCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATg > 1:638709/1‑150 (MQ=255) tATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTc > 2:1971384/1‑130 (MQ=255) tATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTc < 1:1971384/130‑1 (MQ=255) tATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGgc < 1:308235/150‑1 (MQ=255) cGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGca > 1:359442/1‑150 (MQ=255) gCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGcaca > 1:582763/1‑150 (MQ=255) ccGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTg < 1:1922748/116‑1 (MQ=255) ccGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTg > 2:1922748/1‑116 (MQ=255) gTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGa < 1:1869771/111‑1 (MQ=255) gTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGa > 2:1869771/1‑111 (MQ=255) gTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAgg < 2:2112693/150‑1 (MQ=255) gTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAgg > 1:526688/1‑150 (MQ=255) gTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCATACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAgg < 2:2028458/150‑1 (MQ=255) gCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCg > 1:518544/1‑150 (MQ=255) cccTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCATACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGa > 1:1597296/1‑150 (MQ=255) ccTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGCCCGGCTCCGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGaa < 1:760339/150‑1 (MQ=255) ccTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTg > 2:2352874/1‑135 (MQ=255) ccTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTg < 1:2352874/135‑1 (MQ=255) ttATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGc < 1:1942560/109‑1 (MQ=255) ttATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGc > 2:1942560/1‑109 (MQ=255) ttATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGa > 2:690379/1‑150 (MQ=255) cAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCATACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAg < 2:1597296/150‑1 (MQ=255) aaaaGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGc > 1:1826190/1‑150 (MQ=255) aGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGt < 2:1826190/150‑1 (MQ=255) gCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGGACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGc < 1:933622/150‑1 (MQ=255) gCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGc < 2:152587/150‑1 (MQ=255) gCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGc > 1:378523/1‑150 (MQ=255) tAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCt > 1:1296757/1‑150 (MQ=255) tAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCt > 1:2185554/1‑150 (MQ=255) acgtGGAGAGCGTGGGCCGGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCGAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTa < 2:650985/147‑1 (MQ=255) aCCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTa < 2:2207835/150‑1 (MQ=255) aCCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTa < 1:1105611/150‑1 (MQ=255) cTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATc > 2:1253982/1‑150 (MQ=255) cTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGCTGTCTGGGTGATTAGAGACGTCACTTCGAGCCCAATGCTGGAACACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATc > 2:811714/1‑150 (MQ=255) tGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGgt < 2:513299/74‑1 (MQ=255) tGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGgt > 1:513299/1‑74 (MQ=255) gAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGaa < 2:582763/150‑1 (MQ=255) 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aaGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAg < 2:761603/150‑1 (MQ=255) aGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCg > 1:2114918/1‑44 (MQ=255) aGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCg < 2:2114918/44‑1 (MQ=255) cgGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCaa < 2:359442/150‑1 (MQ=255) gCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACt > 2:492158/1‑150 (MQ=255) gCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACaa > 1:1907881/1‑150 (MQ=255) cTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCAACGAGGTCAACTACAAc > 2:568159/1‑150 (MQ=255) tCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTATGTCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTAAAATACAAcc > 1:1719929/1‑150 (MQ=255) caacaaCGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCt > 2:1927713/1‑150 (MQ=255) caacaaCGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCt > 2:1926898/1‑150 (MQ=255) aacaacGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGcc < 2:202342/102‑1 (MQ=255) aacaacGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGcc > 1:202342/1‑102 (MQ=255) aacGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCgg < 1:628284/94‑1 (MQ=255) aacGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCgg > 2:628284/1‑94 (MQ=255) aacGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCTCATc > 2:1318124/1‑150 (MQ=255) acGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCTCATcc > 1:8474/1‑150 (MQ=255) cGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGgc > 1:2275870/1‑69 (MQ=255) cGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGgc < 2:2275870/69‑1 (MQ=255) gAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCTCATCCCt > 2:1889304/1‑150 (MQ=255) gCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCTCATCCCTgg > 2:1579576/1‑150 (MQ=255) caccacCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCTCATCCCTGGc > 2:619909/1‑150 (MQ=255) accaccGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCTCATCCCTGGCg > 2:40167/1‑150 (MQ=255) caccGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCTCATCCCTGGCGTg > 2:971476/1‑150 (MQ=255) accGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCTCATCCCTGGCGTGa > 1:5067/1‑150 (MQ=255) ccGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCTCATCCCTGGCGTGAt < 2:2344783/150‑1 (MQ=255) ccGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCTCATCCCTGGCGTGAt < 1:971476/150‑1 (MQ=255) | GAGCCTGCCGCCGGGGGTACCGCAGAATCGCTGCAAGCCGATTACGTGTTGGTGGCTATCGGCCGTCGCCCTTATACAAAAGGGCTAAACCTGGAAAGCGTGGGCCTGGAAGCCGACAAGCGCGGCATGCTCAACAACGAGCACCACCGTACCTCAGTGCCGGGTGTCTGGGTGATTGGCGACGTCACTTCGGGCCCAATGCTGGCGCACAAGGCCGAAGACGAAGCGGTGGCCTGTATCGAACGCATCGCCGGCAAGCCCCACGAGGTCAACTACAACCTCATCCCTGGCGTGAT > NC_002947/6116604‑6116899 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |