| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 604,827 | C→T | 6.4% | T46I (ACC→ATC) ‡ | thiL → | thiamin monophosphate kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 604,827 | 0 | C | T | 6.4% | 265.5 / 4.0 | 89 | T46I (ACC→ATC) ‡ | thiL | thiamin monophosphate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/43); new base T (4/2); total (44/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.34e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGCTGCCTGGCCATGGGTGAGTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGC > NC_002947/604678‑604967 | gcgcTGCCTGGCCATGGGTGAGTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTcgac < 1:961980/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCCATGGGTGAGTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGaca < 1:2181339/150‑1 (MQ=255) cTGGCCATGGGTGAGTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGTGCAGTGGGCAGGGCGGCGAGGCCTTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGGTCGACAcc < 2:573079/150‑1 (MQ=255) tGGCCATGGGTGAGTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACAccc < 1:1765991/150‑1 (MQ=255) gCCATGGGTGAGTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTg > 1:1297770/1‑150 (MQ=255) gTGAGTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCg > 1:1345331/1‑150 (MQ=255) tGAGTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTc < 1:407648/145‑1 (MQ=255) tGAGTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTc > 2:407648/1‑145 (MQ=255) tGAGTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCgg > 2:1798479/1‑150 (MQ=255) gTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGTACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGt < 1:540211/150‑1 (MQ=255) gTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGt < 1:1260084/150‑1 (MQ=255) tCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCAGGTACGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGc < 1:1268845/150‑1 (MQ=255) gAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCAc > 2:43680/1‑150 (MQ=255) tGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTc < 2:55601/150‑1 (MQ=255) tGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCACTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTc < 2:102828/150‑1 (MQ=255) gATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCt > 1:1177134/1‑129 (MQ=255) gATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCt < 2:1177134/129‑1 (MQ=255) tCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCctg < 1:2258583/150‑1 (MQ=255) aaCCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCctgct < 1:837950/150‑1 (MQ=255) aaCCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCctgct < 2:1345331/150‑1 (MQ=255) aaCCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCctgct < 2:1447518/150‑1 (MQ=255) ccATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGt > 1:2030817/1‑150 (MQ=255) cATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGtt > 1:1136050/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGAt > 1:2053999/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGAt > 2:2395534/1‑150 (MQ=255) ccgcAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGt > 1:2146034/1‑150 (MQ=255) ccgcCCTGCGCACAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTtgctg > 1:85148/2‑150 (MQ=255) ccTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCttt < 2:1297770/150‑2 (MQ=255) cTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGtt > 2:2403214/1‑141 (MQ=255) cTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGtt < 1:2403214/141‑1 (MQ=255) cTGTGCGCAGGACGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCACCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTgg > 1:2370684/1‑150 (MQ=255) tgtgCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGc > 2:1135071/1‑150 (MQ=255) tgCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCa < 2:790915/150‑1 (MQ=255) tgCGCAGGGCGGCGAGGGCATGGCCCTGGCTATCAGCTACTACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCGGCGGCCGGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCa < 1:43680/150‑1 (MQ=255) gcAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGcg > 2:456437/1‑150 (MQ=255) aGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACCGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGACGGTGTCGACCGACCCCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGCTTCGTTGCTGCTTTGACAGcact > 2:383714/1‑147 (MQ=255) gggCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGcgttc < 1:456437/150‑1 (MQ=255) gggCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGcgttc < 2:2146034/150‑1 (MQ=255) gggCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGcgttc < 2:1136050/150‑1 (MQ=255) gcggcgAGGGCGTGTCGCTGGGTACCGGCGACGACTGCGCCCTTCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCAACACCTTGCTCGCCGGGGTGCCCTGGCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGcgttcgt < 2:85148/150‑1 (MQ=255) ggcgAGGGCGTGGCTCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACAccc < 1:163288/88‑1 (MQ=255) ggcgAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACAccc > 2:163288/1‑88 (MQ=255) ggCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCtgtg > 1:668302/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCGCTGCTGGACCTTCCCCCCGCTGAGCAACTTGCTGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGCGTGCCCTTTCCTGCTGTTTGGGATCCGTTGCTTCTTGGCCAGCGTTCGTTGCCttcttcag < 2:1296930/150‑8 (MQ=255) ggTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGAc < 2:1094094/150‑1 (MQ=255) gTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTg > 2:2164432/1‑71 (MQ=255) gTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTg < 1:2164432/71‑1 (MQ=255) tCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGtt > 2:2048688/1‑106 (MQ=255) tCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGtt < 1:2048688/106‑1 (MQ=255) tCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTgg < 1:1798479/150‑1 (MQ=255) cGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGc > 2:2282106/1‑150 (MQ=255) ggCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTtg < 1:887877/105‑1 (MQ=255) ggCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTtg > 2:887877/1‑105 (MQ=255) gCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTGGATCGGGGGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGTGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCGGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGGAGCGGCCAGTGACCTGGCAg > 1:675986/1‑150 (MQ=255) acaacgcgcCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCAt < 1:2394355/145‑1 (MQ=255) gacTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGc < 1:1982589/90‑1 (MQ=255) gacTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGc > 2:1982589/1‑90 (MQ=255) acTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATgg < 1:383714/150‑1 (MQ=255) tGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTg > 1:147302/1‑57 (MQ=255) tGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTg < 2:147302/57‑1 (MQ=255) tGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGgc > 1:2284138/1‑150 (MQ=255) tGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGgc > 2:1748167/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGgc < 1:686084/145‑1 (MQ=255) ccTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGgc > 2:686084/1‑145 (MQ=255) ccTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGAc > 2:2345695/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGAc > 1:1206108/1‑150 (MQ=255) ggACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAAt > 1:177563/1‑150 (MQ=255) ccTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCgg > 1:1535838/1‑150 (MQ=255) ttCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTTGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGGCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGAGCGACTGCAATCGGCt > 1:627914/1‑150 (MQ=255) ccccGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCAc > 1:1047705/1‑150 (MQ=255) cccGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTg < 2:1382220/82‑1 (MQ=255) cccGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTg > 1:1382220/1‑82 (MQ=255) ccGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCAccc < 1:1135071/150‑1 (MQ=255) ccGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACACTGGTCGCCGGGGTATCGCGGGCTGGTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGTGACTGCAATCGGCTTCAccc < 2:675986/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTc < 2:668302/150‑1 (MQ=255) aGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCAc < 2:1535838/150‑1 (MQ=255) gCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTggc > 2:951333/1‑96 (MQ=255) gCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTggc < 1:951333/96‑1 (MQ=255) aaCTGGCGGTGTCAACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGa > 1:1284872/1‑150 (MQ=255) gaccagggTGTCGGTCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATTGTCGCTACTGTATTCGGCTTCCACCTCGCACTGAc > 2:998780/7‑150 (MQ=255) aCTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGGGGCCAGTGCCCAAGCAGTCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGAc < 2:1667586/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCtt > 2:1285003/1‑68 (MQ=255) tGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCtt < 1:1285003/68‑1 (MQ=255) cagggTGTCGGTCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTg > 2:1991896/4‑68 (MQ=38) cagggTGTCGGTCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTg < 1:1991896/65‑1 (MQ=255) cagggTGTCGGTCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGTTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACcct > 1:752439/4‑150 (MQ=255) cagggTGTCGGTCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACcct > 1:1292110/4‑150 (MQ=255) cGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACcctgc < 1:2395534/150‑1 (MQ=255) gtgtCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCa > 1:2245862/1‑130 (MQ=255) gtgtCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCa < 2:2245862/130‑1 (MQ=255) gaccgacACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGAc < 1:156844/138‑1 (MQ=255) gaccgacACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGAc > 2:156844/1‑138 (MQ=255) | GCGCTGCCTGGCCATGGGTGAGTTCGAGCTGATCAACCATTACTTCGCCGCAGCGCCCTGTGCGCAGGGCGGCGAGGGCGTGGCGCTGGGTATCGGCGACGACTGCGCCCTGCTGGACCTTCCCCCCGGTGAGCAACTGGCGGTGTCGACCGACACCCTGGTCGCCGGGGTGCACTTTCCTGCTGTTTGCGATCCGTTGCTGCTTGGCCAGCGTTCGTTGGCTGTGGCGGCCAGTGACCTGGCAGCCATGGGCGCGACTGCAATCGGCTTCACCCTCGCACTGACCCTGC > NC_002947/604678‑604967 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |