Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 646,605 | C→T | 6.0% | A75A (GCC→GCT) | acoR → | acetoin catabolism regulatory protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 646,605 | 0 | C | T | 6.0% | 291.6 / 6.3 | 100 | A75A (GCC→GCT) | acoR | acetoin catabolism regulatory protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/43); new base T (2/4); total (52/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.19e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.66e-01 |
GCCGGTACCACCGCTGATCCTCGATTCATGGCGCCGCTCCATGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACCGGGTCGAGTCGGCCATCCGCAACGACTGTCGCAAGGCCGGGCTGTATCTGGGGA > NC_002947/646458‑646750 | gcCGGTACCACCGCTGATCCTCGATTCATGGCGCCGCTCCATGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAg < 1:821307/150‑1 (MQ=255) ccaccGCTGATCCTCGATTCATGGCGCCGCTCCATGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGAGTGCAGCGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGcagatcg > 1:24061/1‑144 (MQ=255) caccGCTGATCCTCGATTCATGGCGCCGCTCCATGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCg > 2:746478/1‑150 (MQ=255) accGCTGATCCTCGATTCATGGCGCCGCTCCATGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCTGGCGATGcgca < 1:2183958/150‑4 (MQ=255) accGCTGATCCTCGATTCATGGCGCCGCTCCATGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCTGGCGATGcgca < 1:1592866/150‑4 (MQ=255) accGCTGATCCTCGATTCATGGCGCCGCTCCATGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGt > 1:1169947/1‑150 (MQ=255) ccGCTGATCCTCGATTCATGGCGCCGCTCCATGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCTGGCGATGcgcag < 1:2186255/150‑5 (MQ=255) tccATGGAGCGGCGCCATGGATGTGTACCGCCTAGACCCCGATTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGTGCGCTTGCATGa > 1:1068619/3‑150 (MQ=255) gcgcCGCTCCATGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGt < 1:1639246/150‑1 (MQ=255) gccgcTCCATGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGt < 1:1953092/148‑1 (MQ=255) gccgcTCCATGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTgc > 1:2281544/1‑150 (MQ=255) gccgcTCCATGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCCCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGt > 2:1953092/1‑148 (MQ=255) aTGGGTGTGTACCGCCTCGACCCCAGTTCCCAGAAGGGGCCGAGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGGGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCAGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCt > 2:865605/1‑150 (MQ=255) aTGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCt > 2:1150478/1‑150 (MQ=255) aTGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCt < 2:1169947/150‑1 (MQ=255) ggATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGa < 1:1630358/150‑1 (MQ=255) tgtACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGactact > 2:843294/1‑150 (MQ=255) gtACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACTCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGGGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTg > 2:1830970/1‑150 (MQ=255) tACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCGTCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGt < 1:1951274/131‑1 (MQ=255) tACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGt > 2:1951274/1‑131 (MQ=255) tACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGc > 2:716934/1‑150 (MQ=255) tACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGc > 2:2247139/1‑150 (MQ=255) tACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGc > 2:2335078/1‑150 (MQ=255) aCCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCg < 1:746478/150‑1 (MQ=255) ccGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGt > 2:1754063/1‑150 (MQ=255) cGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCTTCGAGGGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCAAGCGATTCCGTGGCTCTCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGtg < 1:1150478/150‑1 (MQ=255) cGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGtg < 1:233079/150‑1 (MQ=255) gCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGtgc > 2:1331468/1‑150 (MQ=255) ccTCGACCCCGGTTCCCAGCCGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTGCACGAATGCCGCAAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGGTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGtgct > 1:817849/1‑150 (MQ=255) tCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGtgctgc < 1:776171/150‑1 (MQ=255) ccccGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGt > 1:481350/1‑99 (MQ=255) ccccGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGt < 2:481350/99‑1 (MQ=255) ccccGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTAc < 1:1239679/150‑1 (MQ=255) cccGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATTGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTAcc < 2:295789/150‑1 (MQ=255) cccGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTAcc > 2:1687234/1‑150 (MQ=255) ccGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCAt > 1:1347972/1‑110 (MQ=255) ccGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCAt < 2:1347972/110‑1 (MQ=255) ccGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGAAAAACGCGGGCTACTGCGTGCTGCTTACCg > 1:194/1‑150 (MQ=255) cGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTg > 2:1918188/1‑97 (MQ=255) cGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTg < 1:1918188/97‑1 (MQ=255) agcagGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAgg > 2:2113886/1‑150 (MQ=255) agcagGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAgg > 1:1604719/1‑150 (MQ=255) gggCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGgcgc > 2:323428/1‑150 (MQ=255) gcgTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCgg < 1:1331875/97‑1 (MQ=255) gcgTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCgg > 2:1331875/1‑97 (MQ=255) gcgTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTATTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCAt < 2:699422/150‑1 (MQ=255) gcgTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAgg < 2:1954988/140‑1 (MQ=255) gcgTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCAt > 2:1044681/1‑150 (MQ=255) gcgTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGCGTATGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAgg > 1:1954988/1‑140 (MQ=255) cgTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATc < 2:817849/150‑1 (MQ=255) cgTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATc < 2:1362360/150‑1 (MQ=255) gTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCg > 1:905318/1‑150 (MQ=255) tATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGa < 2:2281544/150‑1 (MQ=255) tATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGa < 1:2113886/150‑1 (MQ=255) aTCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGTGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGAt < 2:1068619/150‑1 (MQ=255) aTCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGAt < 2:905318/150‑1 (MQ=255) 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gCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACCGGGTCGAGTCGGCCATCCGCAACGACTGTCGCAAGGCCgg < 1:785465/150‑1 (MQ=255) cTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGGCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGGGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACCGGGTCGAGTCGGCCATCCGCAACGACTGTCGCAAGGCCggg < 2:317069/150‑1 (MQ=255) ttCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGtgctg > 1:574979/1‑72 (MQ=255) ttCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGtgctg < 2:574979/72‑1 (MQ=255) cacggcATCGCTGGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCAt < 1:2246532/91‑1 (MQ=255) cacggcATCGCTGGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCAt > 2:2246532/5‑95 (MQ=255) cTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAggg < 1:1970104/86‑1 (MQ=255) cTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAggg > 2:1970104/1‑86 (MQ=255) cTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAg < 2:1043073/84‑1 (MQ=255) cTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAg > 1:1043073/1‑84 (MQ=255) tGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACCGGGTCGAGTCGGCCATCCGCAACGACTGTCGCaa < 2:543718/136‑1 (MQ=255) tGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACCGGGTCGAGTCGGCCATCCGCAACGACTGTCGCaa > 1:543718/1‑136 (MQ=255) gcgcATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACCGGGTCGAGTCGGCCATCTGCAACGACTGTCGCAAGGCCGGGCTGTATCt < 1:1044681/150‑1 (MQ=255) ggcATCGCTGGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACCGGGTCGAGTCGGCCATCCGCAACGACTGTCGCAAGGCCGGGCTGTATCTg > 2:1664262/2‑150 (MQ=255) cgcATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACCGGGTCGAGTCCGCCATACATATCCACCAGCGCAAGGCCGGCCGGTaggtg > 2:2322481/1‑146 (MQ=255) gcATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACCGGGTCGAGTCGGCCATCCGCAACGACTGTCGCAAGGCCGGGCTGTATCTgg < 2:1393815/150‑1 (MQ=255) gcATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACCGGGTCGAGTCGGCCATCCGCAACGACTGTCGCAAGGCCGGGCTGTATCTgg > 2:993837/1‑150 (MQ=255) cATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACCGGGTCGAGTCGGCCATCCGCAACGACTGTCGCAAGGCCGGGCTGTATCTggg < 1:1687234/150‑1 (MQ=255) aTCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACGGGGTCGAGTCGGCCATCCGCAACGACTGTCGCAAGGCCGGGCTGTATCTgggg > 2:535722/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACCGGGTCGAGTCGGCCATCCGCAACGACTGTCGCAAGGCCGGGCTGTATCTGGGGa < 1:1331468/150‑1 (MQ=255) | GCCGGTACCACCGCTGATCCTCGATTCATGGCGCCGCTCCATGGATGTGTACCGCCTCGACCCCGGTTCCCAGCAGGGGCCGCGTATCCTTTCCCAAAGCCTGCTCAACGAATGCCGCGAACGCGCCGAGCTGTTCCTGCGCATCGCCAGCGATGCCGTGGCGCGCTTGCATGAGCGGGTGCGCGGCGCTGACTACTGCGTGCTGCTTACCGATGCCCAGGGGCGCACCATCGATTACCGGGTCGAGTCGGCCATCCGCAACGACTGTCGCAAGGCCGGGCTGTATCTGGGGA > NC_002947/646458‑646750 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |