| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 77,503 | A→T | 10.4% | V14E (GTG→GAG) | rsmB ← | ribosomal RNA small subunit methyltransferase B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 77,503 | 0 | A | T | 10.4% | 344.2 / 25.8 | 115 | V14E (GTG→GAG) | rsmB | ribosomal RNA small subunit methyltransferase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (57/46); new base T (6/6); total (63/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.17e-01 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GCAGCAGCTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTCAGGGCTT > NC_002947/77357‑77652 | gcagcaGCTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAg > 1:1634063/1‑150 (MQ=255) gcTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTGATCTACCTTGGCCAGCTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCa < 1:2192003/150‑1 (MQ=255) gcTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGTGCTCAGCGGcaa < 2:2233513/150‑3 (MQ=255) gcTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGTGCTCAGCGGcaa < 2:1593755/150‑3 (MQ=255) gcTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCa < 2:1880390/150‑1 (MQ=255) cTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGTGCTCAGCGGCAAg < 1:137328/150‑1 (MQ=255) tgtgCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAATGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTGGCCGCTGTGCTCAGCGGCAAgg < 2:1364272/150‑2 (MQ=255) tgtgCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGTGCTCAGCGGCAAgg < 1:314004/150‑2 (MQ=255) cGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCAc > 1:1116237/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACg < 2:941195/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGggcggcggc > 2:1815644/1‑150 (MQ=255) cGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGa > 1:607283/1‑150 (MQ=255) gAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAg > 2:1389506/1‑150 (MQ=255) ggCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGc > 2:1284586/1‑150 (MQ=255) gTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTg > 2:2309551/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTGATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTc > 2:1418522/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTc > 2:1606422/1‑150 (MQ=255) cAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGTTTCAtt < 1:1418522/150‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCAtt < 1:1781538/150‑1 (MQ=255) cAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCAtt > 1:1840858/1‑150 (MQ=255) gCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGTCTTGCCGCTGCGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTgg < 2:80444/150‑1 (MQ=255) gCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTgg < 1:1514740/150‑1 (MQ=255) gtcaaggTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAACGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGc > 2:132897/6‑150 (MQ=255) gTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGcc < 2:624334/150‑1 (MQ=255) ccGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCt > 1:2112150/1‑150 (MQ=255) gAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTg > 1:827936/1‑150 (MQ=255) aaCGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCGGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGc < 2:1248105/150‑1 (MQ=255) aaCGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTgg < 2:85474/137‑1 (MQ=255) aaCGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGc > 1:21156/1‑150 (MQ=255) cAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCcgggg > 1:705340/1‑148 (MQ=255) cAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCcggcg < 1:667438/150‑1 (MQ=255) aGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGGACCt < 2:1989003/141‑1 (MQ=255) aGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCcggcgg < 2:383888/150‑1 (MQ=255) aGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCcggcgg > 2:954992/1‑150 (MQ=255) gTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGgcggcg > 2:1200305/1‑150 (MQ=255) tCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACg > 1:2060089/1‑101 (MQ=255) tCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACg < 2:2060089/101‑1 (MQ=255) ccTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGaa < 2:472067/150‑1 (MQ=255) cTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGTGCTCAGCGGcaa > 2:619631/1‑90 (MQ=255) cTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAAc > 1:1285248/1‑150 (MQ=255) tGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACt > 1:118603/1‑150 (MQ=255) gTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGggcggcg < 1:2346781/91‑1 (MQ=255) tCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGGTCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTAAGCACAGCAACAAGCGCACGGGCGGCGGCGGTGCGTGGGTTCATGAGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGt > 2:148032/1‑150 (MQ=255) tCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGGCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCAGTGGAC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGt < 2:172645/150‑1 (MQ=255) tCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGt < 1:1780658/150‑1 (MQ=255) gTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTgg > 1:1996019/1‑97 (MQ=255) gTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTgg < 2:1996019/97‑1 (MQ=255) gTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGaa > 2:1030008/1‑150 (MQ=255) gTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGaa > 2:2022889/1‑150 (MQ=255) ttCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAAc < 1:213439/150‑1 (MQ=255) ttCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAAc < 2:662081/150‑1 (MQ=255) tCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTAGCGGCGGCTGTTGAACa > 2:1189644/1‑150 (MQ=255) aTCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAgg > 1:1347858/1‑150 (MQ=255) aTCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATCGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAgg > 1:16828/1‑150 (MQ=255) tCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGt < 1:1815644/150‑1 (MQ=255) tCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCAGCCGGGCACAGCGGCCAGAGCACGGGCGGCGGCGAGGGGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGGGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGTACTgga > 2:467908/1‑149 (MQ=255) tACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCa > 1:2317711/1‑150 (MQ=255) cTTGTCCAGTTGCGCCTGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGCCGGCTGtt < 1:2178200/137‑1 (MQ=255) cTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTg > 2:578619/1‑150 (MQ=255) cTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGCCGGCTGtt > 2:2178200/1‑137 (MQ=255) ttGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCACTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGa < 2:1740868/150‑1 (MQ=255) tCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGTTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAAc > 1:1133732/1‑116 (MQ=255) tCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAAc < 2:1133732/116‑1 (MQ=255) tCCAGGTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGtt < 1:489426/133‑1 (MQ=255) ccAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCt < 1:1606422/150‑1 (MQ=255) cAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCa > 2:1087159/1‑141 (MQ=255) cAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCa < 1:1087159/141‑1 (MQ=255) aGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCa < 2:607283/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAAt < 2:1116237/150‑1 (MQ=255) cgcCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGcc > 1:648207/1‑150 (MQ=255) ggCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTgc > 1:1755938/1‑150 (MQ=255) gAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAg < 1:1580671/150‑1 (MQ=255) gAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAg > 2:1408215/1‑150 (MQ=255) gAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAg < 1:642962/150‑1 (MQ=255) gAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAg > 2:2117852/1‑150 (MQ=255) gCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGc > 2:2161124/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGt < 1:98009/150‑1 (MQ=255) ttCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGCTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGtt < 2:1495042/150‑1 (MQ=255) aGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAAt > 1:408978/1‑128 (MQ=255) aGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAAt < 2:408978/128‑1 (MQ=255) gCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAg > 1:569970/1‑150 (MQ=255) cGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCAtt > 2:159661/1‑61 (MQ=255) cGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCAtt < 1:159661/61‑1 (MQ=255) cGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTgccgc > 1:75100/1‑136 (MQ=255) cGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTgccgc < 2:75100/136‑1 (MQ=255) aaGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCt < 2:332905/128‑1 (MQ=255) aaGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCt > 1:332905/1‑128 (MQ=255) ttGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCa > 1:1138205/1‑150 (MQ=255) ttGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCCTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACGGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCa > 2:1616892/1‑150 (MQ=255) tggCCGCTGTGCTCAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCa > 2:1222772/3‑150 (MQ=255) tggCCGCTGTGCTCAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGT‑AAATCAGTCTCCTTCAAACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCa > 2:593538/3‑150 (MQ=255) tggCCGCAGTGCTCACCGGACAGAGAACGGGCGTCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑GAGCAGCTAGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCGCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCa > 2:398541/3‑150 (MQ=255) ggCCGCTGTGCTCAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAg > 2:2087990/2‑150 (MQ=255) gCCGCTGTGCTCAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCCgg > 1:1841387/1‑150 (MQ=255) cTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTCa < 1:2022889/150‑1 (MQ=255) cTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTCa < 1:1492372/150‑1 (MQ=255) cTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTCa < 1:1284586/150‑1 (MQ=255) gAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTCAgg > 1:2080554/1‑150 (MQ=255) acaGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTCAGGGCtt < 1:2309551/150‑1 (MQ=255) acaGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTCAGGGCtt < 1:1030008/150‑1 (MQ=255) | GCAGCAGCTGTGCGGCCAGCAGGTCGAGGCGTGGCTGCCAGCGTGCGGTACCGAACGCCAGGTCCTGGGTCAGGCCGCGGTCGCGTTCATCTACCTTGTCCAGTTGCGCCGGCAGCGAGCTGTTCAGCGAAGCCTTGCCGCTGAGCACAGCGGCCAGCGCACGGGCGGCGGCGAGGCGTGGGTTCATTGGCC‑CAGCACCTTGCCGGCGGCGAACTTCTCGCGGCGGCTGTTGAACAGGTCACTGAAGCTCAATGCCTTGCCGCCAGGCAGTTGCAGGCGGGTCAGGCTCAGGGCTT > NC_002947/77357‑77652 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |