| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 853,765 | 0 | G | A | 8.9% | 345.2 / 18.0 | 123 | R62H (CGT→CAT) ‡ | prmC | release factor‑(glutamine‑N5) methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (51/61); new base A (7/4); total (58/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.46e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.02e-01 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
GTTGCCTGAATCGCCCACTGAGCGCCTGGATGCCGAACTGCTGCTGGCTGCGGCCATCGGTAAATCGCGCAGCTACCTGCATACCTGGCCCGAGCGTATTGTCAGCAGCGAAGATGCCGAGACCTATGCCGGCTACCTGAAGCGCCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAG > NC_002947/853616‑853913 | gTTGCCTGAATCGCCCACTGAGCGCCTGGATGCCGAACTGCTGCTGGCTGCGGCCATCGGTAAATCGCGCAGCTACCTGCATACCTGGCCCGAGCGTATTGTCAGCAGCGAAGATGCCGAGACCTATGCCGGCTACCTGAAGCGccgccg > 2:719961/1‑150 (MQ=255) cTGAATCGCCCACTGAGCGCCTGGATGCCGAACTGCTGCTGGCTGCGGCCATCGGTAAATCGCGCAGCTACCTGCATACCTGGCCCGAGCGTATTGTCAGCAGCGAAGATGCCGAGACCTATGCCGGCTACCTGAAGCGCCGCCGTggcg > 2:803259/1‑150 (MQ=255) cTGAATCGCCCACTGAGCGCCTGGATGCCGAACTGCTGCTCGCTGCGGCCATCGGTAAATCGCGCAGCTACCTGCATACCTGGCCCGAGCGTATTGCCAGCAGCGAAGATGCCGAGACCTATGCCGGCTACCTGAAGCGCCGCCGTggcg > 1:2299626/1‑150 (MQ=255) 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cGGCTACCTGAAGCGCCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGAcc < 2:451217/77‑1 (MQ=255) cGGCTACCTGAAGCGCCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGAcc > 1:451217/1‑77 (MQ=255) ggCTACCTGAAGCGCCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCaa < 2:892560/150‑1 (MQ=255) gCTACCTGAAGCGCCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAAc < 1:1245931/150‑1 (MQ=255) gCTACCGGAAGCGCCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAAc < 1:380308/150‑1 (MQ=255) cTACCTGAAGCGCCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAAcc < 1:1441097/150‑1 (MQ=255) aCCTGAAGCGCCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCg > 2:2175042/1‑150 (MQ=255) ccTGAAGCGCCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGcgcc < 2:712253/84‑1 (MQ=255) actggctcgccgcCACGGTGGCGCTTCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCTACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGc > 1:109515/8‑150 (MQ=255) tGAAGCGCCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCtt > 2:510189/1‑150 (MQ=255) tGAAGCGCCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCtt > 2:168084/1‑150 (MQ=255) ctcgccgcCACGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTcgc > 1:314092/3‑150 (MQ=255) aGCGCCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTcgc < 1:926560/150‑1 (MQ=255) tcgccgcCACGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAg < 2:1367210/108‑1 (MQ=255) tcgccgcCACGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTcgcc > 1:1390557/2‑150 (MQ=255) tcgccgcCACGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTcgcc > 1:1713525/2‑150 (MQ=255) gcgcCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCtt > 2:383189/1‑130 (MQ=255) cgccgcCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTcgccc < 1:1370083/150‑1 (MQ=255) cgTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAg < 1:691124/150‑1 (MQ=255) | GTTGCCTGAATCGCCCACTGAGCGCCTGGATGCCGAACTGCTGCTGGCTGCGGCCATCGGTAAATCGCGCAGCTACCTGCATACCTGGCCCGAGCGTATTGTCAGCAGCGAAGATGCCGAGACCTATGCCGGCTACCTGAAGCGCCGCCGTGGCGGCGAGCCAGTGGCCTATATCCTTGGGCTGCAGGGCTTCTGGAAGATCGACCTGGAGGTCGCGCCGCATACCCTGATCCCGCGGCCGGATACCGAGCTGCTGGTCGAGACGGCGCTTGAACTGCAACCCGCTTCGCCCGCCAAG > NC_002947/853616‑853913 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |