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> 1:393149/1‑94 (MQ=255) gCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTATTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGaa < 2:393149/94‑1 (MQ=255) cGGGGCCCGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTg < 1:1207492/150‑1 (MQ=255) tGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTgc > 2:2239711/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGAGGGTAGG‑AT‑GCAGTGGAGATGGACGAGACGGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTgc > 1:909679/1‑150 (MQ=255) cTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTg > 2:1893253/1‑150 (MQ=255) ctgcccGCCCTGGCACGGCGGGTAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGa > 1:133790/4‑150 (MQ=255) ctgcccGCCCTGGCACGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGgaagaa < 1:311639/118‑1 (MQ=255) ctgcccGCCCTGGCACGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGgaagaa > 2:311639/4‑121 (MQ=255) tgcccGCCGTGCCAGGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGAt > 2:2103166/3‑150 (MQ=255) aCCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCga < 2:534464/93‑1 (MQ=255) aCCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCga > 1:534464/1‑93 (MQ=255) aCCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGATg > 1:2361947/1‑150 (MQ=255) cccGCCGTGCCAGGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGaa < 2:594153/76‑1 (MQ=255) cccGCCGTGCCAGGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGaa > 1:594153/1‑76 (MQ=255) cctccgTGCCCGGGCGGGCCGG‑CT‑ACGGTGCAATTGCTCAAGGCAGGTTTTCTTG‑AACTGGCTGAACAGCTGTAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGATGGc < 2:446670/147‑1 (MQ=255) ccgccgTGCCAGGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTAGGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGATGGc > 1:446670/1‑150 (MQ=255) | AGGAAGCGTGACAGGCGGGACTGTGCCTCAGCTTCACCGGCTGGCCAGTGGTCGCGCAATGCGGGCGTGGTTTTTCCGAACCCCTCTACATGTTGCGGGATTGGGTCGCTGCCGATGTTCAGCGGGGCCTGGCGCTTCACCCGCCGTGCCAGGGCGGGCAGG‑CT‑GCGGTGCAGATGCTCAAGGCAGGTCTTCTTG‑AACTGGCTGAACACCTGGAAGTAATCGCCACTGCGAGTGAGTACGGTGCCCGGACGGAAGAACAGCTGGTCGAGGTGGCTGTGCGCCTGGATGGC > NC_002947/858177‑858466 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |