| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 910,154 | A→G | 6.6% | Q220R (CAG→CGG) | fruB → | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 910,154 | 0 | A | G | 6.6% | 323.0 / 8.7 | 105 | Q220R (CAG→CGG) | fruB | PTS fructose transporter subunit EI/HPr/IIA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (58/40); new base G (2/5); total (60/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.35e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CCGCCTGCTGCAACGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTG > NC_002947/910005‑910300 | ccGCCTGCTGCAACGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCgcagca > 1:1791564/1‑150 (MQ=255) gCCTGCTGCAACGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCagcagc < 1:832659/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGCAACGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGcc > 2:1940755/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGCAACGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGcc > 1:1938890/1‑150 (MQ=255) tgctgcAACGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGc > 2:790294/1‑150 (MQ=255) cAACGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGGCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCGGCTGCTGCgg < 2:348861/150‑2 (MQ=255) aaCGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCGGCTGCTGCggg < 1:242991/150‑3 (MQ=255) aaCGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCGGCTGCTGCggg < 1:1966306/150‑3 (MQ=255) aaCGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGtt < 2:1938890/150‑1 (MQ=255) aCGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCGGCTGCTGCgggg < 1:1015205/150‑4 (MQ=255) aCGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCGGCTGCTGCgggg < 2:1450183/150‑4 (MQ=255) cGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGCGGGCATGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCTAGGTTCGTCAGAAAGGCCTGGCCTTAATCGCCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTAc < 2:1952441/150‑1 (MQ=255) tGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACcg > 1:2119606/1‑150 (MQ=255) ccGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACcgcg > 2:1113070/1‑150 (MQ=255) cGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGa < 1:1113070/150‑1 (MQ=255) tgtgTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAg > 1:93986/1‑150 (MQ=255) tCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGACgt < 2:2211862/150‑2 (MQ=255) gTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACg < 2:2032791/150‑1 (MQ=255) gTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACg < 1:1118494/150‑1 (MQ=255) tGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACgg > 1:467245/1‑150 (MQ=255) tGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACgg > 2:2017905/1‑150 (MQ=255) gCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTc < 2:2119606/150‑1 (MQ=255) cTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCt < 1:376097/150‑1 (MQ=255) tttGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGCCCAGCCGCTCAACGGTCTg < 1:573104/150‑1 (MQ=255) ccgccgTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCTTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCCCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCt < 1:1950995/150‑1 (MQ=255) cgccgTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTg < 1:1109085/150‑1 (MQ=255) gcacgttgcAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGcc > 2:1246921/7‑150 (MQ=255) cgTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGAc < 2:2166330/124‑1 (MQ=255) cgTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGAc > 1:2166330/1‑124 (MQ=255) ctgcAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACgg > 2:1928660/1‑134 (MQ=255) ctgcAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGc > 1:485306/1‑149 (MQ=255) tgcAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCa < 1:168337/150‑1 (MQ=255) tgcAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCa > 2:736661/1‑150 (MQ=255) tgcAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCAGTTCTGCCTGGccc > 2:1117715/1‑149 (MQ=255) cagcagGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGc > 1:765475/1‑150 (MQ=255) gcagGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCt > 2:1182377/1‑150 (MQ=255) agGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTg < 2:2386939/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGgc > 2:156750/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGgc > 2:861079/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGgc > 2:731468/1‑150 (MQ=255) gccgctgccgctGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGcgccgc > 1:254500/1‑150 (MQ=255) gccgctgccgctGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGcgccgc > 1:1124253/1‑150 (MQ=255) gccgctgGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCtgtatt < 1:1179089/150‑6 (MQ=255) ggCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAg < 2:775120/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGc > 2:306854/1‑150 (MQ=255) tggtggCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCtg > 2:1211242/1‑150 (MQ=255) ggtggCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTg > 2:2095291/1‑107 (MQ=255) ggtggCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTg < 1:2095291/107‑1 (MQ=255) gtggCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCtgtg > 1:663634/1‑150 (MQ=255) cTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGaa < 2:663634/150‑1 (MQ=255) tGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAg > 1:2331580/1‑150 (MQ=255) acaGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGc < 1:1296162/150‑1 (MQ=255) acaGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGCCTGTGCGAAGTGc > 2:441686/1‑150 (MQ=255) caGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCt < 2:93986/150‑1 (MQ=255) cAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGc > 1:2207473/1‑150 (MQ=255) cAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGc > 1:1061577/1‑150 (MQ=255) aGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGcc > 2:1218130/1‑150 (MQ=255) gTTGGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGCAGGCCGt < 2:1010719/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGt > 2:1685078/1‑150 (MQ=255) ttCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTg < 1:1182377/150‑1 (MQ=255) cGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTggg < 2:254500/150‑1 (MQ=255) tCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGTCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCa > 2:2276579/1‑150 (MQ=255) tCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGaa < 2:1313062/127‑1 (MQ=255) tCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGaa > 1:1313062/1‑127 (MQ=255) tCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCa > 1:1762780/1‑150 (MQ=255) cAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTACTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAg < 1:1940755/150‑1 (MQ=255) aGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAgg > 2:562933/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTg > 2:195549/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCTGGCCTTCACCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTg < 1:1319619/150‑1 (MQ=255) cAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGc > 2:1753056/1‑150 (MQ=255) ggcctggcctTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGctc < 1:877511/150‑1 (MQ=255) gcctggcctTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGctct > 1:1844519/1‑150 (MQ=255) ctggcctTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGAGCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTAc > 1:139386/1‑150 (MQ=255) ctggcctTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTAc > 1:275933/1‑150 (MQ=255) tggcctTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTAcc > 1:715161/1‑150 (MQ=255) gcctTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCaa > 1:789592/1‑150 (MQ=255) gcctTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCATGGCGCCGCTCACGAGTCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCaa < 1:296267/150‑1 (MQ=255) ctTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGa < 1:1004818/99‑1 (MQ=255) ctTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGa > 2:1004818/1‑99 (MQ=255) ctTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCCAGc > 1:484993/1‑150 (MQ=255) ctTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGc > 2:358433/1‑150 (MQ=255) ttCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGcc > 1:235852/1‑150 (MQ=255) ttCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGcc > 1:1294293/1‑150 (MQ=255) catcaCCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTGGAAGCACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGccac < 1:1210352/150‑1 (MQ=255) catcaCCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGccac < 2:139386/150‑1 (MQ=255) tcaCCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAgg < 2:2096945/121‑1 (MQ=255) tcaCCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCAGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAgg > 1:2096945/1‑121 (MQ=255) ggtaacGCAGCGGCTGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGTCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACcag > 1:539766/6‑150 (MQ=255) cccGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAg < 2:510921/91‑1 (MQ=255) cccGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAg > 1:510921/1‑91 (MQ=255) cccGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCg < 1:1589996/93‑1 (MQ=255) cccGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCg > 2:1589996/1‑93 (MQ=255) cccGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACcagcag > 2:1322766/1‑150 (MQ=255) cccGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACcag > 2:913810/1‑147 (MQ=255) ccGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCagcagc > 1:599315/1‑150 (MQ=255) ccGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCagcagc > 1:929680/1‑150 (MQ=255) cGCAGCGGCTGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGcc > 2:1417756/1‑150 (MQ=255) cGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGcc > 2:2352426/1‑150 (MQ=255) cagcagCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGt < 1:2017905/150‑1 (MQ=255) agcagcCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACcagcacaggac < 2:1844519/150‑7 (MQ=255) | CCGCCTGCTGCAACGTGCCGACTGTGTCGACAGTGGCTTTGCCGCCGTGCTGCAGCAGGCCGAGCCGCTGCCGCTGGGTGAGGGCCTGTGGTGGCTGCACAGCGAGCGCCAGGTTCGTCAGCCAGGCCTGGCCTTCATCACCCCGCAGCAGCCGCTGCGTTACCGCGACCAGCCGCTCAACGGTCTGTTCTGCCTGGCCAGCCTTGGCGCCGCTCACGAGGCCCTGCTCGAGCGGCTGTGCGAAGTGCTGATCGAAGGCCGTGGGCAGGTGCTCTACCAAGCCACCAGCAGCCGTG > NC_002947/910005‑910300 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |