| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 930,220 | C→A | 5.2% | K5135N (AAG→AAT) | PP_0806 ← | surface adhesion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 930,220 | 0 | C | A | 5.2% | 300.9 / 4.0 | 95 | K5135N (AAG→AAT) | PP_0806 | surface adhesion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (46/44); new base A (3/2); total (49/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.56e-01 | |||||||||||
TTGATGCCGTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACTGGCCGTTGTTCT > NC_002947/930071‑930368 | ttGATGCCGTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGccc < 2:1459282/150‑1 (MQ=255) gATGCCGTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCtt > 1:2147742/1‑150 (MQ=255) aTGCCGTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTg > 2:1415372/1‑150 (MQ=255) gCCGTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCAACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGcc < 2:1113699/150‑1 (MQ=255) tgctgacggtggtgtccaccgatgatgccggcaacgcttcggtggctgtcccttaccagaccaacgacacctcgccacccgacctggtgaccaacctggcgatcaacaacaccttcaacgtgctgacTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCa > 2:547568‑M1/128‑150 (MQ=255) gTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCa < 2:1226932/148‑1 (MQ=255) gTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCa > 1:1226932/1‑148 (MQ=255) gTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCATCGTCTCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGt > 1:1620724/1‑150 (MQ=255) tgacggtggtgtccaccgatgatgccggcaacgcttcggtggctgtcccttaccagaccaacgacacctcgccacccgacctggtgaccaacctggcgatcaacaacaccttcaacgtgctgacTGGCATTGGCTTCGACCTTGCCAGTc > 1:552450‑M1/125‑150 (MQ=255) tCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTc < 1:1415372/150‑1 (MQ=255) gACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGc < 2:1025379/150‑1 (MQ=255) tCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGa > 1:1285054/1‑150 (MQ=255) tCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGa > 2:2206858/1‑150 (MQ=255) aCTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCCACGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg < 1:1234656/150‑1 (MQ=255) aCTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg > 1:1239637/1‑150 (MQ=255) ttCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGaa > 1:865756/1‑147 (MQ=255) ttCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGaa < 2:865756/147‑1 (MQ=255) ttCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg < 2:1386435/148‑1 (MQ=255) ttCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg > 1:1386435/1‑148 (MQ=255) ttCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg < 2:534279/148‑1 (MQ=255) ttCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg > 1:534279/1‑148 (MQ=255) accgatgatgccggcaacgcttcggtggctgtcccttaccagaccaacgacacctcgccacccgacctggtgaccaacctggcgatcaacaacaccttcaacgtgctgacTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCa < 2:77285‑M1/23‑1 (MQ=255) accgatgatgccggcaacgcttcggtggctgtcccttaccagaccaacgacacctcgccacccgacctggtgaccaacctggcgatcaacaacaccttcaacgtgctgacTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCa > 1:77285‑M1/111‑133 (MQ=255) gagTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGtgttgt < 2:1285054/150‑1 (MQ=255) tGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGa > 1:189465/1‑150 (MQ=255) tGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTCGCCAGCGCAATCCAACACGCCCGTACAGATCACGTCTCCGTCGAAGCGGATGGCTATCGGTGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGCCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGa > 2:1478068/1‑150 (MQ=255) gagcgagcCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg > 2:396830/1‑136 (MQ=255) gagcgagcCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg < 1:396830/136‑1 (MQ=255) gagcgagcCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGc > 2:2328278/1‑150 (MQ=255) gagcCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAgg < 2:2376067/150‑1 (MQ=255) gcCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGtt > 2:2088384/1‑150 (MQ=255) gcCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGtt < 2:2147742/150‑1 (MQ=255) ccACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTgg > 1:1900155/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCa < 1:2088384/150‑1 (MQ=255) actaGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCg > 1:2402359/4‑150 (MQ=255) aCCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCa < 2:187153/102‑1 (MQ=255) aCCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCa > 1:187153/1‑102 (MQ=255) ccAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCgg > 1:1434763/1‑150 (MQ=255) ccAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCgg < 2:1049511/150‑1 (MQ=255) cAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCggg > 2:2251196/1‑150 (MQ=255) gtgtTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGtgttgt < 2:1511001/120‑1 (MQ=255) gtgtTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGtgttgt > 1:1511001/1‑120 (MQ=255) aTTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAg > 2:236165/1‑150 (MQ=255) tttGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGATGCCTGCCGCGACGCCGGCGAAGCTGCCAGTGACCGTCGCCTCGGCTACCTGATCGTCAGTCAGCACGATGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGAGACCAGGACGGGGTGCGAgg > 1:2350369/1‑150 (MQ=255) ttGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGaa > 1:1964095/1‑105 (MQ=255) ttGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGaa < 2:1964095/105‑1 (MQ=255) ttGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGccggtt < 2:2402359/150‑6 (MQ=255) tcggAAGTTGCCATCTTGATCTACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACTGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGgt < 2:1117961/148‑1 (MQ=255) acgacacctcgccacccgacctggtgaccaacctggcgatcaacaacaccttcaacgtgctgacTGGCATTGGCTTCGCCCTtgcta < 2:1974401‑M1/23‑3 (MQ=255) acgacacctcgccacccgacctggtgaccaacctggcgatcaacaacaccttcaacgtgctgacTGGCATTGGCTTCGCCCTtgcta > 1:1974401‑M1/65‑85 (MQ=255) gTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGtt < 2:1076372/150‑1 (MQ=255) ctcgccacccgacctggtgaccaacctggcgatcaacaacaccttcaacgtgctgacTGGCATTGGCTTCGCCCTTGc > 2:568035‑M1/58‑78 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accacGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACa > 1:1865092/1‑150 (MQ=255) accacGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACa > 1:132999/1‑150 (MQ=255) acGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACa > 1:1824999/1‑147 (MQ=255) acGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACa < 2:1824999/147‑1 (MQ=255) acGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGcc > 1:154481/1‑150 (MQ=255) gCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCAc < 2:1865092/150‑1 (MQ=255) gTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGaa < 2:1526517/150‑1 (MQ=255) cGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGt > 1:1754227/1‑150 (MQ=255) tCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGc < 2:1239637/150‑1 (MQ=255) tctcCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg < 2:933452/63‑1 (MQ=255) tctcCGTCGAAGCTGACGGTGACAGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAg > 1:933452/1‑63 (MQ=255) ctcCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGaa < 1:1092492/61‑1 (MQ=255) 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gACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTGGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGGCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGacac < 1:1478068/150‑1 (MQ=255) aCGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGt < 2:1772702/97‑1 (MQ=255) aCGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGt > 1:1772702/1‑97 (MQ=255) ggTGACCTTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGAcaccac > 2:1658755/1‑150 (MQ=255) cGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAg > 2:2349084/1‑150 (MQ=255) TGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAg < 2:938912‑M1/80‑1 (MQ=255) TGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAg > 1:938912‑M1/1‑80 (MQ=255) TGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGAGCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCa > 2:1620724‑M1/1‑150 (MQ=255) CATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACt < 1:1608397‑M1/150‑1 (MQ=255) ttCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACTGGCCgtt < 2:454910/150‑1 (MQ=255) ttCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACTGGCCgtt > 1:731677/1‑150 (MQ=255) ttCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACTGGCCgtt > 1:2115340/1‑150 (MQ=255) ttCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGACACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGGGGACACCATCGTCAGTATCTAGCCgtt < 2:1900155/150‑1 (MQ=255) ccTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACTGGCCGTTGTTCt > 1:1808467/1‑150 (MQ=255) | TTGATGCCGTCGGACTGTGTCACTTCCAGAGTGGCGAGCGAGCCCACCGCTGGCACCAGTGTTATTTGGAAGTTGCCAGCGCCATCCACCACGCCGGTACCGATCACGTCTCCGTCGAAGCTGACGGTGACCGTGGCATTGGCTTCGCCCTTGCCAGTCAGCACGTTGAAGGTGTTGTTGATCGCCAGGTTGGTCACCAGGTCGGGTGGCGAGGTGTCGTTGGTCTGGTAAGGGACAGCCACCGAAGCGTTGCCGGCATCATCGGTGGACACCACCGTCAGCAACTGGCCGTTGTTCT > NC_002947/930071‑930368 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |