Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,033,811 | G→C | 7.1% | R143P (CGG→CCG) | PP_0891 → | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,033,811 | 0 | G | C | 7.1% | 319.4 / 12.8 | 99 | R143P (CGG→CCG) | PP_0891 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (47/44); new base C (4/3); total (51/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.67e-01 |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGTGCTGATCTTCACTGC > NC_002947/1033664‑1033958 | ccACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCgcggc < 2:1136236/150‑1 (MQ=255) cacaGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCGTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGTTACAGTGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCAGGATGCgcggcg > 2:541470/1‑150 (MQ=255) cacaGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCgcggcg > 1:1395345/1‑150 (MQ=255) caGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGATGAGGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCt > 2:805139/1‑150 (MQ=255) ggCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGCTGCGTTCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAggt < 1:2371895/150‑1 (MQ=255) gCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAggtg < 2:1395345/150‑1 (MQ=255) cacaGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAggtgg < 1:1844985/150‑1 (MQ=255) cacaGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAggt < 1:2172078/148‑1 (MQ=255) cacaGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAggt > 2:2172078/1‑148 (MQ=255) cacaGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAggcgg < 2:642570/150‑1 (MQ=255) gATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGAc > 2:2121351/1‑150 (MQ=255) aTCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGAcc > 1:1782429/1‑150 (MQ=255) tCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGAccc < 2:1277345/150‑1 (MQ=255) gACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCCCCTGGATGCGCTGCGCTTCCAGGTGGTGACCCtt < 2:1234678/150‑1 (MQ=255) aCCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTg > 1:713048/1‑150 (MQ=255) tGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGc > 2:1784409/1‑150 (MQ=255) cGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTgg < 2:1356225/150‑1 (MQ=255) gATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGt > 1:987213/1‑150 (MQ=255) gATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGt > 1:1288312/1‑150 (MQ=255) aTCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGtg > 1:1805055/1‑150 (MQ=255) aTCAATGACCTGGCCGACGGTGCAACGCTCGAGTTGCGGCTGGCGCTCACGTTCGCCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCCCCCCCCTGGCTGCGCGGTGCTTTCTGGTGCTGAGTCGGGAGCctcttttg < 2:529742/150‑5 (MQ=255) aaTGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTAAAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGtgctg > 2:1399694/1‑150 (MQ=255) gACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAggtg > 2:21732/1‑123 (MQ=255) gACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAggtg < 1:21732/123‑1 (MQ=255) gCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTgg > 1:1861630/1‑136 (MQ=255) gCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTgg < 2:1861630/136‑1 (MQ=255) gACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGAt > 1:1615178/1‑150 (MQ=255) tGCACAGATCTAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTgg < 1:715346/150‑1 (MQ=255) tGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTgg < 1:905426/150‑1 (MQ=255) acaGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCtt > 2:2342485/1‑150 (MQ=255) acaGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCtt > 2:289757/1‑150 (MQ=255) acaGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGAAGCGCCGCGCATCCAggc < 1:1051258/105‑2 (MQ=255) acaGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGAAGCGCCGCGCATCCAggc > 2:1051258/1‑104 (MQ=255) acaGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACACTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCtt < 2:570366/150‑1 (MQ=255) aTCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTtgctg > 2:268841/1‑150 (MQ=255) aTCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTtgctg > 2:222218/1‑150 (MQ=255) tCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTg < 1:754930/141‑1 (MQ=255) tCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTg > 2:754930/1‑141 (MQ=255) tCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTtgctgc < 1:268841/150‑1 (MQ=255) aaTTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCgg < 2:1261524/150‑1 (MQ=255) aTTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTTTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCggg < 1:1949609/150‑1 (MQ=255) cgcCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTg > 2:1456765/1‑150 (MQ=255) cgcCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTg < 1:222218/150‑1 (MQ=255) gcCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTgg < 1:361550/133‑1 (MQ=255) gcCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTgg > 2:361550/1‑133 (MQ=255) gcCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTgg > 1:2181929/1‑150 (MQ=255) gcCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTgg > 1:2036692/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGCTCACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGa < 1:1309133/150‑1 (MQ=255) cTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGaa > 1:1722395/1‑150 (MQ=255) cTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGaa > 2:1962722/1‑150 (MQ=255) tGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTgc < 1:1089210/150‑1 (MQ=255) ggTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAATCCTGCGCaa < 2:713048/150‑1 (MQ=255) aCCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTc < 2:2181929/150‑1 (MQ=255) ccTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGAccc < 2:1052253/80‑1 (MQ=255) ccTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGAccc > 1:1052253/1‑80 (MQ=255) tGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCa < 2:374395/150‑1 (MQ=255) 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1:977596/1‑91 (MQ=255) cTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAg > 1:1625576/1‑98 (MQ=255) cTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAg < 2:1625576/98‑1 (MQ=255) ggCCACCCGCATGGATGCGCGGCTCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAgcgc > 2:595213/1‑150 (MQ=255) gCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGcgcg > 2:503320/1‑150 (MQ=255) tcaccaccTGGAAGCGCCGCGCATCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGt > 2:322132/7‑150 (MQ=255) cACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGaaa < 2:888404/92‑1 (MQ=255) cACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGaaa > 1:888404/1‑92 (MQ=255) cACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTcc > 2:1687875/1‑121 (MQ=255) caccTGGAAGCGCCGCGCATCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGTGCTg > 2:2287344/3‑150 (MQ=255) gCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCaa < 1:1635407/121‑1 (MQ=255) gCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCaa > 2:1635407/1‑121 (MQ=255) ccTGGAAGCGCCGCGCATCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGTGCTGAt < 1:322132/150‑1 (MQ=255) ccTGGAAGCGCCGCGCATCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGTGCTGAt > 2:737947/1‑150 (MQ=255) cTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGc > 1:1817876/1‑87 (MQ=255) gATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGTGCTGATCTTc > 2:445693/1‑150 (MQ=255) gATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTCCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGTTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGTGCTGATCTTc > 2:86114/1‑150 (MQ=255) aTGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGTGCTGATCTTCa < 2:1288312/150‑1 (MQ=255) tGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGTGCTGATCTTCAc > 1:910991/1‑150 (MQ=255) gcgcGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGTGCTGATCTTCACt < 1:1399694/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCGCATCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGTGCTGATCTTCACt < 1:737947/150‑1 (MQ=255) gcggcgCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTGTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGTGCTGATCTTCACTgc > 1:1047716/1‑150 (MQ=255) gcggcgCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTc < 2:1538313/117‑1 (MQ=255) gcggcgCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTc > 1:1538313/1‑117 (MQ=255) gcggcgCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGTGCTGATCTTCACTgc > 1:1093433/1‑150 (MQ=255) | CCACAGTGAAGGCACAGATCGACCTGCAGCCGATCAATGACCTGGCCGACGGTGCACAGATCGAATTGCGCCTGCCGCTGACGGTCACCCTGCATGGCCAGTCGCACAGCTACAATGTCCTGTTGCTGGCCACCCGCCTGGATGCGCGGCGCTTCCAGGTGGTGACCCTTGAGCCTCTGGTGCTGCGCGCCGAAGATTTTGGCTTGCTGCCGGGGCTGGAAAGCCTGCGCAAGTTCGCCAGGTTGAAGTCCATCAACCCGTCGGTACCGGTTAGCGCGGTGCTGATCTTCACTGC > NC_002947/1033664‑1033958 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |