| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,074,712 | A→T | 5.3% | L50Q (CTG→CAG) | gatA ← | glutamyl‑tRNA(Gln) amidotransferase subunit A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,074,712 | 0 | A | T | 5.3% | 423.2 / 9.6 | 131 | L50Q (CTG→CAG) | gatA | glutamyl‑tRNA(Gln) amidotransferase subunit A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (58/66); new base T (5/2); total (63/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.60e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.69e-01 | |||||||||||
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
AGGGCGCCTTGAAGTTGTCGAGCATCTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCA > NC_002947/1074563‑1074859 | aGGGCGCCTTGAAGTTGTCGAGCATCTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCa < 2:245177/150‑1 (MQ=255) ggCGCCTTGAAGTTGTCGAGCATCTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAgg < 1:183567/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGTTGTCGAGCATCTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAg < 2:217732/144‑1 (MQ=255) cTTGAAGTTGTCGAGCATCTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAg < 1:535996/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGTTGTCGAGCATCTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAg > 2:1411323/1‑150 (MQ=255) cTTGAAGTTGTCGAGCATCTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAg < 2:1359609/150‑1 (MQ=255) gAAGTTGTCGAGCATCTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTc > 1:2283384/1‑150 (MQ=255) ttGTCGAGCATCTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCg < 1:1547657/150‑1 (MQ=255) tGTCGAGCATCTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCgg < 2:2157879/150‑1 (MQ=255) tGTCGAGCATCTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCgg < 2:2283384/150‑1 (MQ=255) tCGAGCAACTTCGCGACGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTg < 2:1947636/150‑1 (MQ=255) aTCTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCtg > 2:883944/1‑150 (MQ=255) cTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCtgat < 1:883944/150‑1 (MQ=255) ttCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCtgatg > 1:341395/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCtgatg > 1:2362415/1‑150 (MQ=255) gAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCa < 2:2106362/121‑1 (MQ=255) gAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCa > 1:2106362/1‑121 (MQ=255) aGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGc < 2:2177728/150‑1 (MQ=255) gCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCt > 1:14548/1‑150 (MQ=255) gCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCt > 2:1841759/1‑150 (MQ=255) tGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCt < 1:1911645/150‑1 (MQ=255) gTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCtgt < 2:311602/150‑1 (MQ=255) gTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCtgt < 2:1278778/150‑1 (MQ=255) gCGTGCCCCGTTGCTGCGGAACGGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACTCTCATGAAGGTGTTGATCTGTgg < 2:155627/150‑1 (MQ=255) gCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTgg < 1:1605042/150‑1 (MQ=255) cGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGa < 1:1247176/150‑1 (MQ=255) gCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAg < 1:1887120/150‑1 (MQ=255) cGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAgct > 2:1546134/1‑150 (MQ=255) ggTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATTGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCtt < 1:1218766/150‑1 (MQ=255) 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gggCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGAt < 1:2164015/133‑1 (MQ=255) gggCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGAt > 2:2164015/1‑133 (MQ=255) gggCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGgcgc > 1:1432526/1‑150 (MQ=255) gggCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGgcgc > 1:110568/1‑150 (MQ=255) gCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCg < 1:2393687/150‑1 (MQ=255) gCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCg < 2:955611/150‑1 (MQ=255) tCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCa < 1:1304910/150‑1 (MQ=255) gTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGCAGCTGTTGCTCTATGGGTCGATCCGCTGGATGCCCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGct > 2:634181/1‑150 (MQ=255) cccAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCg > 2:919809/1‑150 (MQ=255) cccAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCACCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCg < 1:634181/150‑1 (MQ=255) 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gaagaccTGGCCCTGGGCCAGGCCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGc > 2:1104713/6‑123 (MQ=255) aCGCGCCTGGCCCAGGGCCAGTTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCcgc < 1:2405832/131‑1 (MQ=255) aCGCGCCTGGCCCAGGGCCAGTTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCcgc > 2:2405832/1‑131 (MQ=255) aCGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGt > 2:1512626/1‑150 (MQ=255) aCGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGCCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGt > 1:2204688/1‑150 (MQ=255) cgcgCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCcagcag > 2:1403986/1‑83 (MQ=255) gcgcCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCa > 1:792229/1‑93 (MQ=255) gcgcCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCa < 2:792229/93‑1 (MQ=255) gcCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGAt > 2:134417/1‑111 (MQ=255) gcCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGAt < 1:134417/111‑1 (MQ=255) gcCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAAt < 1:320598/150‑1 (MQ=255) accTGGCCCTGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAAt > 1:1436720/2‑150 (MQ=255) ccTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAAtt < 1:1897493/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCTGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGct < 1:330725/92‑1 (MQ=255) gCCCAGGGCCATGGCGTTGGTGGCCCTGATGTAGCTCTTGATCTGTGGGGCGAGCTGTTTGATGCGCGCCAGCATGGCGCCAGTCAGCTCTTCGGACAAAAACGATTTTTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATg < 2:434932/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATg > 1:2229342/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCtgtg < 1:1877325/45‑1 (MQ=255) ccAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCtgtg > 2:1877325/1‑45 (MQ=255) ccAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCATGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGc > 1:1375288/1‑112 (MQ=255) ccAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGAt > 1:1394253/1‑104 (MQ=255) ccAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGAt < 2:1394253/104‑1 (MQ=255) ccAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGc < 2:1375288/112‑1 (MQ=255) ccAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAgg < 2:387448/137‑1 (MQ=255) ccAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAgg > 1:387448/1‑137 (MQ=255) ccAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCa > 2:120286/1‑150 (MQ=255) cAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATg < 2:389505/147‑1 (MQ=255) cAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATg > 1:389505/1‑147 (MQ=255) | AGGGCGCCTTGAAGTTGTCGAGCATCTTCGAGCCGCAGCTGGTGCGTACGCCGTTGGTGCAGAACAGGTCTTTGTGGGCGATCGGTGCACCCAGCAGCGCGCTGGTTTCGCCCGCGGCGCGACGGGCATCGGCGGCACGCGCCTGGCCCAGGGCCAGGTCTTCGGTGACGCTGATGAAGCTGTTGATCTGTGGGTCGAGCTGCTTGATGCGCGCCAGCAGGGCGCCGGTCAGCTCTTCGGAAGAAAACGATTTGTCGGCGAGTCCGCGGGCGATCTCGGCCAGGGTCAATTGATGCA > NC_002947/1074563‑1074859 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |