| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,089,810 | G→C | 6.0% | Q222H (CAG→CAC) | fumC‑I → | class 2 fumarate hydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,089,810 | 0 | G | C | 6.0% | 373.9 / 11.1 | 116 | Q222H (CAG→CAC) | fumC‑I | class 2 fumarate hydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (63/46); new base C (2/5); total (65/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.47e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
ACATCAATACGTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTGGCTT > NC_002947/1089663‑1089958 | gatctaaTACGTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGTGAT‑CTCGACAGTGGAGATCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAggg < 2:1268865/145‑1 (MQ=255) cATCAATACGTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGc > 2:2280558/1‑150 (MQ=255) aTACGTGAAGACCGGTCGTACTCACGGCCGTCGCGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGACTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGcagatc > 1:1268865/1‑145 (MQ=255) tACGTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAAcc < 1:754053/150‑1 (MQ=255) cGTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTTCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAAccgc < 2:772033/150‑1 (MQ=255) gTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAAccgcc > 1:5767/1‑150 (MQ=255) gTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAAccgcc > 1:1145594/1‑150 (MQ=255) gTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCCCGCTGCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAAGTGTGTATCCTGTCTTGTAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAAccgcc > 1:1738357/1‑150 (MQ=255) tGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAAccgccg > 1:2234800/1‑150 (MQ=255) aGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCACGGCGGTTCCGCCCTgg < 1:984618/150‑1 (MQ=255) aGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCACGGCGGTTCCGCCCTgg < 2:176180/150‑1 (MQ=255) aCCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACCTGCAGGCGCTGGCCCAg > 2:2289147/1‑132 (MQ=255) ggTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTAcc < 1:113150/150‑1 (MQ=255) tACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCAt < 2:1438498/150‑1 (MQ=255) tCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCaa > 1:1005256/1‑150 (MQ=255) cACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAAc < 1:347170/150‑1 (MQ=255) aCCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACg < 1:1283802/150‑1 (MQ=255) cTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGcc > 1:1187756/1‑150 (MQ=255) cTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCAGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGcc > 1:1949236/1‑150 (MQ=255) tGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGGTGCTGGACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGccc > 1:398113/1‑150 (MQ=255) tGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCGAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAAc < 1:1943456/146‑1 (MQ=255) tGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCGAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAAc > 2:1943456/1‑146 (MQ=255) ggACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATcc > 1:1265516/1‑150 (MQ=255) gACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCg > 2:766858/1‑150 (MQ=255) aCGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGc > 1:1037497/1‑150 (MQ=255) cgcgATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCa < 2:2234800/150‑1 (MQ=255) gATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGtt > 2:828801/1‑150 (MQ=255) ccGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGCTCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTg > 2:924824/1‑150 (MQ=255) ccGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCa > 2:1307226/1‑142 (MQ=255) actggcg‑cATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCa < 1:1307226/138‑1 (MQ=255) gcg‑cATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCgg > 1:368433/1‑150 (MQ=255) g‑cATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTg > 2:610096/1‑110 (MQ=255) g‑cATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTg < 1:610096/110‑1 (MQ=255) g‑cATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGtt > 2:471471/1‑150 (MQ=255) cATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGttt < 2:1265516/150‑1 (MQ=255) aTGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAggg < 1:1523330/95‑1 (MQ=255) aTGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAggg > 2:1523330/1‑95 (MQ=255) aTGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTtc > 1:2276486/1‑150 (MQ=255) gcacccAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCACGGCGGTTCCGCCCTgg < 2:2016065/104‑1 (MQ=255) gcacccAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCACGGCGGTTCCGCCCTgg > 1:2016065/5‑108 (MQ=255) gCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTGGAAGAACGAAGGTGCGCTGCCGCACTTGCACGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTtcgctc > 2:1081422/1‑150 (MQ=255) gCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATc > 2:929365/1‑119 (MQ=255) gCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATc < 1:929365/119‑1 (MQ=255) tGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCa > 1:949126/1‑150 (MQ=255) gATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGt < 1:718973/150‑1 (MQ=255) aTGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTg < 2:2285428/150‑1 (MQ=255) aTGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTg > 1:391374/1‑150 (MQ=255) gctgggctgCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGGACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGcc < 1:2087748/150‑1 (MQ=255) tgggctgCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTg > 1:653404/1‑150 (MQ=255) tgggctgCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTg > 2:2015678/1‑150 (MQ=255) ggctgCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGAc < 1:766858/150‑1 (MQ=255) ggctgCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGAc < 2:2276486/150‑1 (MQ=255) ggctgCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGAc > 1:918608/1‑150 (MQ=255) gcgcAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAg < 2:391374/150‑1 (MQ=255) gcgcAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAg < 2:1145594/150‑1 (MQ=255) gATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTc > 2:2228117/1‑148 (MQ=255) gATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTc < 1:2228117/148‑1 (MQ=255) gATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGa < 1:828801/150‑1 (MQ=255) aTCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCAAGGGCGACACCGCGGCAGACATCGGCATTACCGCTCTTTCGCAGTTCTCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAg < 1:295456/150‑1 (MQ=255) tgcCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGcc > 2:981829/1‑150 (MQ=255) ccAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTc < 1:792901/101‑1 (MQ=255) ccAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTc > 2:792901/1‑101 (MQ=255) aaGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCAt > 2:334096/1‑74 (MQ=255) aaGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCAt < 1:334096/74‑1 (MQ=255) aaGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCg > 1:1247907/1‑94 (MQ=255) aaGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCg < 2:1247907/94‑1 (MQ=255) aaGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGc > 2:1865848/1‑150 (MQ=255) gCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGaa > 2:244449/1‑150 (MQ=255) gCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGaa > 2:1692342/1‑150 (MQ=255) gCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGaa < 1:1865848/150‑1 (MQ=255) acaTCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCAGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAAcc > 2:422296/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTc > 1:123842/1‑150 (MQ=255) aaGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTAGGTTTTCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCg > 1:636251/1‑150 (MQ=255) ggTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCa < 1:244449/150‑1 (MQ=255) ggTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCa < 1:981829/150‑1 (MQ=255) tgctgcCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGAGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCACATCAGCAATGCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGa > 2:1479174/1‑150 (MQ=255) gctgcCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGAt < 1:2152098/150‑1 (MQ=255) ctgcCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGAt < 2:2107141/149‑1 (MQ=255) cACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTg > 2:1733274/1‑70 (MQ=255) cTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCa < 2:5767/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCAc < 2:498646/113‑1 (MQ=255) ttGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCAc > 1:498646/1‑113 (MQ=255) aGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGaca > 1:524397/1‑150 (MQ=255) aGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGaca > 1:1477705/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGt > 2:2140290/1‑85 (MQ=255) ggCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGt < 1:2140290/85‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGcc < 1:1725304/150‑1 (MQ=255) tGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCg > 2:779094/1‑150 (MQ=255) ggCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGt < 2:1187756/150‑1 (MQ=255) ggCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCAGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGt < 1:422296/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTg > 1:2089145/1‑150 (MQ=255) acccAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTg < 1:1690056/149‑1 (MQ=255) cccAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTgg < 2:1738357/150‑1 (MQ=255) ccAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTGGc > 1:1769588/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTGGc > 2:664719/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTGGc < 2:1037497/150‑1 (MQ=255) ccACGGCGGTTCCGCCCTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAg > 2:1634980/1‑136 (MQ=255) cAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGc > 1:2087627/1‑129 (MQ=255) cAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGc < 2:2087627/129‑1 (MQ=255) aGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTGGCtt > 2:1193045/1‑150 (MQ=255) | ACATCAATACGTGAAGACCGGTCGTACTCACCTGATGGACGCGATGCCCGTGCG‑CATGAGCCAGGTGCTGGATGGCTGGGCTGCGCAGATCAATGCTGCCAAGTCGCACATCGAAGGTGTGCTGCCGCACTTGCAGGCGCTGGCCCAGGGCGGAACCGCCGTGGGTACCGGCATCAACGCCCATCCGCAGTTCGCTGTCGGTTTCGCTCGCCAGCTCAGTGGCCTGACCAAGGTCGAGTTCACGCCCGGCCAGAACCTGTTCGCACTGATCGGCTCGCAGGACACTGCCGTGGCTT > NC_002947/1089663‑1089958 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |