| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_002947 | 1,097,043 | G→C | 5.3% | A150G (GCC→GGC) | PP_0954 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 1,097,043 | 0 | G | C | 5.3% | 361.9 / 9.4 | 114 | A150G (GCC→GGC) | PP_0954 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (53/54); new base C (3/3); total (57/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
ACAGGCTGACATCACGTACTACCTGCCGCCCCTTGTAGCTCTTTGCCAGGTGCTGGGCTTTGAGGGTTGCCATTTACTCGGCCTTCTTCTTGGGCTGGATCACCATGTCGATGCGCTGACGGGGTGTTGTCACATTGCCACCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAATGACCAAGTCCTTCTGCGACTGGTACTGGATGGTTACGCCCCAGCCTTTCATCTTGT > NC_002947/1096894‑1097190 | aCAGGCTGACATCACGTACTACCTGCCGCCCCTTGTAGCTCTTTGCCAGGTGCTGGGCTTTGAGGGTTGCCATTTACTCGGCCTTCTTCTTGGGCTGGATCACCATGTCGATGCGCTGACGGGGTGTTGTCACATTGCCACCGCGACcgg > 1:2391467/1‑150 (MQ=255) tCACGTACTACCTGCCGCCCCTTGTAGCTCTTTGCCAGGTGCTGGGCTTTGAGGGTTGCCATTTACTCGGCCTTCTTCTTGGGCTGGATCACCATGTCGATGCGCTGACGGGGTGTTGTCACATTGCCACCGCGACCGCCGGTCGcggtg < 1:2093661/150‑5 (MQ=255) aCGTACTACCTGCCGCCCCTTGTAGCTCTTTGCCAGGTGCTGGGCTTTGAGGGTTGCCATTTACTCGGCCTTCTTCTTGGGCTGGATCACCATGTCGATGCGCTGACGGGGTGTTGTCACATTGCCACCGCGACCGGCGGTCGCCACctg > 2:2402142/1‑150 (MQ=255) 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acaTTGCCACCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAATGACCAAGTCCTTCTGCGACTGGTACTGGATGGTTACGccc > 1:2092145/1‑150 (MQ=255) aTTGCCACCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAAt > 2:1039854/1‑108 (MQ=255) aTTGCCACCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAAt < 1:1039854/108‑1 (MQ=255) tGCCACCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAATGACCAAGTCCTTCTGCGACTGGTACTGGATGGTTACGCCCCAGc < 2:707254/150‑1 (MQ=255) tGCCACCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAATGACCAAGCCCTTCTGCGACTGGTACTGGATGGTTACGCCCCAGc < 2:831933/150‑1 (MQ=255) ccACCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTa > 2:1515191/1‑66 (MQ=255) ccACCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTa < 1:1515191/66‑1 (MQ=255) ccACCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAATGACCAAGTCCTTCTGCGACTGGTACTGGATGGTTACGCCCCAGCCt > 1:1789864/1‑150 (MQ=255) aggtggcgACCGCCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAATGACCAAGTCCTTCTGCGACTGGTACTGGATGGTTACGCCCCAGCCt > 2:450430/6‑150 (MQ=255) cACCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAATGACCAAGTCCTTCTGCGACTGGTACTGGATGGTTACGCCCCAGCCtt > 2:1551023/1‑150 (MQ=255) aCCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAATGACCAAGt > 1:2311886/1‑110 (MQ=255) aCCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAATGACCAAGt < 2:2311886/110‑1 (MQ=255) aCCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAATGACCAAGTCCTTCTGCGACTGGTACTGGATGGTTACGCCCCAGCCttt > 1:1996155/1‑150 (MQ=255) ccGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACg < 2:1356269/36‑1 (MQ=255) ccGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACg > 1:1356269/1‑36 (MQ=255) cggcggTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAATGACCAAGTCCTTCTGCGACTGGTACTGGATGGTTACGCCCCAGCCTTTCATCTTGt > 1:1797560/1‑150 (MQ=255) ggcggTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTg < 1:329400/76‑1 (MQ=255) ggcggTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CATTCGCTCTCGACCTTg > 2:329400/1‑76 (MQ=255) | ACAGGCTGACATCACGTACTACCTGCCGCCCCTTGTAGCTCTTTGCCAGGTGCTGGGCTTTGAGGGTTGCCATTTACTCGGCCTTCTTCTTGGGCTGGATCACCATGTCGATGCGCTGACGGGGTGTTGTCACATTGCCACCGCGACCGGCGGTCGCCACCTGGGTCTGGGTGTTGTAGACGATCTTTTCGCCTTCGGTGGTATTG‑CCTTCGCTCTCGACCTTGGCGCGGTCGGTGAGAATGACCAAGTCCTTCTGCGACTGGTACTGGATGGTTACGCCCCAGCCTTTCATCTTGT > NC_002947/1096894‑1097190 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |