| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,121,449 | C→T | 11.4% | V295V (GTC→GTT) | PP_0982 → | YjgP/YjgQ family permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,121,449 | 0 | C | T | 11.4% | 245.9 / 19.0 | 97 | V295V (GTC→GTT) | PP_0982 | YjgP/YjgQ family permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/46); new base T (5/6); total (45/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.64e-01 | |||||||||||
GCCGAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGTTCC > NC_002947/1121300‑1121597 | gCCGAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTc > 1:621340/1‑150 (MQ=255) cGAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCaa < 2:220261/150‑1 (MQ=255) gAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCTCTG‑‑TCGCGGGTCAAc > 2:121590/1‑150 (MQ=255) aaGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTTGACCcgc < 2:860098/150‑1 (MQ=255) aaGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTTGACCcgc < 2:1551416/150‑1 (MQ=255) gTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCgcgc > 1:2379659/1‑150 (MQ=255) cctaGCTCGAAGCGCGTCCCGCCTCCGAACTGATCTGCAAGGATGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAg‑g < 1:1102448/147‑1 (MQ=255) ccGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAg‑g < 2:2292305/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTTGACCCGCGACAgcggcac < 1:726460/150‑7 (MQ=255) gAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCC‑CTG‑‑GCGCGGGTTGACCCGCGACAgcggcacc > 1:583080/1‑140 (MQ=255) gAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCC‑CTG‑‑GCGCGGGTTGACCCGCGACAgcggcacc < 2:583080/147‑8 (MQ=255) aaGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑GCGCGGGTTGACCCGCGACAgc > 1:1196468/1‑140 (MQ=255) aaGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑GCGCGGGTTGACCCGCGACAgc < 2:1196468/141‑2 (MQ=255) aGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGAGGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCCGCCCGCGCCCG‑GGCCGCTTCCt > 2:316491/1‑150 (MQ=255) gcTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCaa < 2:1408544/150‑1 (MQ=255) gcTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCaa < 2:621340/150‑1 (MQ=255) cTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAg < 2:57860/150‑1 (MQ=255) cTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAg > 2:1446325/1‑150 (MQ=255) ttCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAgc > 2:290039/1‑150 (MQ=255) ccACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAgctgc > 1:157558/1‑150 (MQ=255) ccACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAgctgc < 1:1316668/150‑1 (MQ=255) cACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCACGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAgctgct < 2:1304133/150‑1 (MQ=255) cTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAg‑gg > 1:1794843/1‑129 (MQ=255) cTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAg‑gg < 2:1794843/129‑1 (MQ=255) ccGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCgg < 2:1347100/150‑1 (MQ=255) aaCTGTTCGGCAAGGAGGCCCTGCGTAAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGAGCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGGGGTACTGCTG‑‑TCGCGCGTCACCCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCaa < 2:497126/150‑1 (MQ=255) aTCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAAttctt < 1:412453/150‑1 (MQ=255) cGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCGGCCCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATtcttct > 1:22641/1‑150 (MQ=255) cGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATtcttct < 2:1249246/150‑1 (MQ=255) cGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATtcttct < 2:919265/150‑1 (MQ=255) gCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCaa > 1:416800/1‑127 (MQ=255) gCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCaa < 2:416800/127‑1 (MQ=255) ggCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGTGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGcc < 2:347089/150‑1 (MQ=255) 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gcgcgcCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAAt < 1:841010/150‑1 (MQ=255) cgcCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCt < 1:1401445/150‑1 (MQ=255) cgcCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCt < 1:1617063/150‑1 (MQ=255) ccGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGa < 2:157558/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGAt > 1:1899694/1‑150 (MQ=255) aGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGAttt < 2:2379659/150‑1 (MQ=255) cTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTTGACCcgcga > 1:786613/1‑80 (MQ=255) cTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTTGACCcgcga < 2:786613/81‑2 (MQ=38) aTGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCt > 2:289280/1‑129 (MQ=255) aTGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCt < 1:289280/129‑1 (MQ=255) tGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTAcgc > 2:1545659/1‑150 (MQ=255) 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ccTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTggg > 1:2229576/1‑150 (MQ=255) ctgctgGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGc > 1:579341/1‑150 (MQ=255) tgctgGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCa > 1:1570054/1‑150 (MQ=255) gctgGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCAt < 2:2229576/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAACCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCAtgtg > 2:1294584/1‑150 (MQ=255) cGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATgtggt < 1:2356274/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATgtggt < 1:2203739/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGTACGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATgtggtg < 1:1536617/150‑1 (MQ=255) gTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGtggtgg < 2:1604172/150‑1 (MQ=255) gTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGtggtgg < 2:622110/150‑1 (MQ=255) ccGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGgcgc < 1:14452/104‑1 (MQ=255) ccGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGgcgc > 2:14452/1‑104 (MQ=255) gCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCa > 1:1809234/1‑150 (MQ=255) cctggcgcgGGTTGACCCGCGACAGCGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTcc > 2:260349/6‑150 (MQ=255) gcgcgGGTTGACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAAGCCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGc > 1:556808/2‑150 (MQ=255) gcgGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGa > 1:1331054/1‑71 (MQ=255) gcgGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGa < 2:1331054/71‑1 (MQ=255) gcgGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCAGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCt > 1:2202833/1‑150 (MQ=255) gggTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTg < 2:2200166/77‑1 (MQ=255) gggTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTg > 1:2200166/1‑77 (MQ=255) ggTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGtt < 1:586832/150‑1 (MQ=255) tCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGTTcc > 2:1874551/1‑150 (MQ=255) | GCCGAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGTTCC > NC_002947/1121300‑1121597 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |