| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,121,450 | A→G | 11.5% | N296D (AAC→GAC) | PP_0982 → | YjgP/YjgQ family permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,121,450 | 0 | A | G | 11.5% | 245.4 / 18.3 | 96 | N296D (AAC→GAC) | PP_0982 | YjgP/YjgQ family permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/45); new base G (5/6); total (45/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.00e-01 | |||||||||||
CGAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGTTCCTG > NC_002947/1121302‑1121599 | cGAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCaa < 2:220261/150‑1 (MQ=255) gAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCTCTG‑‑TCGCGGGTCAAc > 2:121590/1‑150 (MQ=255) aaGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTTGACCcgc < 2:860098/150‑1 (MQ=255) aaGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTTGACCcgc < 2:1551416/150‑1 (MQ=255) gTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCgcgc > 1:2379659/1‑150 (MQ=255) cctaGCTCGAAGCGCGTCCCGCCTCCGAACTGATCTGCAAGGATGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAg‑g < 1:1102448/147‑1 (MQ=255) ccGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAg‑g < 2:2292305/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTTGACCCGCGACAgcggcac < 1:726460/150‑7 (MQ=255) gAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCC‑CTG‑‑GCGCGGGTTGACCCGCGACAgcggcacc > 1:583080/1‑140 (MQ=255) gAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCC‑CTG‑‑GCGCGGGTTGACCCGCGACAgcggcacc < 2:583080/147‑8 (MQ=255) aaGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑GCGCGGGTTGACCCGCGACAgc > 1:1196468/1‑140 (MQ=255) aaGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑GCGCGGGTTGACCCGCGACAgc < 2:1196468/141‑2 (MQ=255) aGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGAGGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCCGCCCGCGCCCG‑GGCCGCTTCCt > 2:316491/1‑150 (MQ=255) gcTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCaa < 2:621340/150‑1 (MQ=255) gcTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCaa < 2:1408544/150‑1 (MQ=255) cTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAg > 2:1446325/1‑150 (MQ=255) cTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAg < 2:57860/150‑1 (MQ=255) ttCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAgc > 2:290039/1‑150 (MQ=255) ccACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAgctgc > 1:157558/1‑150 (MQ=255) ccACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAgctgc < 1:1316668/150‑1 (MQ=255) cACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCACGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAgctgct < 2:1304133/150‑1 (MQ=255) cTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAg‑gg > 1:1794843/1‑129 (MQ=255) cTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAg‑gg < 2:1794843/129‑1 (MQ=255) 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cGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATtcttct < 2:919265/150‑1 (MQ=255) gCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCaa > 1:416800/1‑127 (MQ=255) gCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCaa < 2:416800/127‑1 (MQ=255) ggCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGTGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGcc < 2:347089/150‑1 (MQ=255) cTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGCTCCTGGTGTTCGTGGTCCTCCTGCTGGCGGTGCCGCTA‑‑TCGCGGGGCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCCTCCTCATTCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTAc > 2:585616/1‑150 (MQ=255) cTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTAc > 2:1401445/1‑150 (MQ=255) tGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACAt > 1:1041895/1‑142 (MQ=255) tGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACAt < 2:1041895/142‑1 (MQ=255) tGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTCTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTAcc < 1:749592/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAAt < 1:841010/150‑1 (MQ=255) cgcCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCt < 1:1401445/150‑1 (MQ=255) cgcCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCt < 1:1617063/150‑1 (MQ=255) ccGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGa < 2:157558/150‑1 (MQ=255) cGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGAt > 1:1899694/1‑150 (MQ=255) aGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGAttt < 2:2379659/150‑1 (MQ=255) cTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTTGACCcgcga > 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gTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCt > 1:397732/1‑132 (MQ=255) ttGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGcc > 1:1107890/1‑150 (MQ=255) tCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTCCTCAAGGTGCGGCTGCATCGCCGG‑‑AACCCGCGCCAG‑GGCCTTTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTc > 1:1022810/1‑150 (MQ=255) gCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCga < 2:1022810/150‑1 (MQ=255) tGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCgaga > 1:622110/1‑150 (MQ=255) 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aTCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGccc > 2:2106515/1‑139 (MQ=255) tGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGc > 1:439668/1‑114 (MQ=255) tGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGc < 2:439668/114‑1 (MQ=255) tGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAAc > 2:2203739/1‑150 (MQ=255) tGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAAc > 2:2356274/1‑150 (MQ=255) gtcgtcACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCaa > 1:2255396/1‑76 (MQ=255) 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tgctgGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCa > 1:1570054/1‑150 (MQ=255) gctgGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCAt < 2:2229576/150‑1 (MQ=255) ggCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAACCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCAtgtg > 2:1294584/1‑150 (MQ=255) cGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATgtggt < 1:2356274/150‑1 (MQ=255) cGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATgtggt < 1:2203739/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGTACGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATgtggtg < 1:1536617/150‑1 (MQ=255) gTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGtggtgg < 2:1604172/150‑1 (MQ=255) gTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGtggtgg < 2:622110/150‑1 (MQ=255) ccGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGgcgc < 1:14452/104‑1 (MQ=255) ccGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGgcgc > 2:14452/1‑104 (MQ=255) gCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCa > 1:1809234/1‑150 (MQ=255) cctggcgcgGGTTGACCCGCGACAGCGGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTcc > 2:260349/6‑150 (MQ=255) gcgcgGGTTGACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAAGCCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGc > 1:556808/2‑150 (MQ=255) gcgGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGa > 1:1331054/1‑71 (MQ=255) gcgGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGa < 2:1331054/71‑1 (MQ=255) gcgGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCAGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCt > 1:2202833/1‑150 (MQ=255) gggTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTg < 2:2200166/77‑1 (MQ=255) gggTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTg > 1:2200166/1‑77 (MQ=255) ggTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGtt < 1:586832/150‑1 (MQ=255) tCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGTTcc > 2:1874551/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGTTCctg > 2:2289746/1‑150 (MQ=255) | CGAGGAAGTGACCGAGCGCGAAGCGCTTCCCACCTCCGAACTGATCGGCAAGGAGGGCCTGCGTGAGCGCGCCGAGCTGCAATGGCGGTTGTCGCTGCCGATCCTGGTGTTCGTCGTCACCCTGCTGGCGGTGCCGCTG‑‑TCGCGGGTCAACCCGCGCCAG‑GGCCGCTTCCTCAAGCTGCTGCCGGCAATTCTTCTGTACATGGCCTACCTGACAATGCTGATTTCCGTACGCGGCGCCCTCGAGAAGGGCAAACTGCCGATCGCCCTGGGCATGTGGTGGGTCCACGGCCTGTTCCTG > NC_002947/1121302‑1121599 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |