| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,168,588 | G→T | 5.4% | intergenic (+99/+154) | eda → / ← leuA | KHG/KDPG aldolase/2‑isopropylmalate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,168,588 | 0 | G | T | 5.4% | 263.5 / 3.9 | 94 | intergenic (+99/+154) | eda/leuA | KHG/KDPG aldolase/2‑isopropylmalate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (48/40); new base T (3/2); total (52/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.64e-01 | |||||||||||
ATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAG‑GCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCATTTCA > NC_002947/1168442‑1168737 | aTCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAAAcc > 2:919161/1‑150 (MQ=255) tCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGGAGGccc > 1:1013501/1‑150 (MQ=255) gCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTcc > 1:1190763/1‑150 (MQ=255) gTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTa < 1:2230635/150‑1 (MQ=255) gTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTa > 1:209726/1‑150 (MQ=255) gTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCAc < 2:442709/150‑1 (MQ=255) gTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCAc < 2:227722/150‑1 (MQ=255) ggCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTg > 2:2085562/1‑150 (MQ=255) gATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTGTTTTTGCCTGGGGTGTTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCGTTCCGGGAGAGACCCGCCCCTACACCCCGATCAGCgg > 1:946928/1‑150 (MQ=255) tGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTg < 1:2085562/150‑1 (MQ=255) gCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTggg < 1:832547/150‑1 (MQ=255) cACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGc > 1:747011/1‑150 (MQ=255) cACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGc < 1:644975/150‑1 (MQ=255) aCTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTTCGGTGGGcc > 2:1572831/1‑149 (MQ=255) ggACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACAcc < 2:1190763/150‑1 (MQ=255) aCGCCAACTGAAAGCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCgg < 2:901674/150‑1 (MQ=255) ccAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTCTACCCGcgaaa > 1:1052587/1‑113 (MQ=255) ccAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTCTACCCGcgaaa < 2:1052587/117‑5 (MQ=255) cAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGGCTCGCTCCTACGCACCGTTCTGCGGTGGGCACACACCGGgtgt > 2:1189668/1‑150 (MQ=255) aaCTTAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTTGGGCGCTTGGTCGGTGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGTTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGtt < 2:946928/150‑1 (MQ=255) aaCTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATc < 2:1331151/126‑1 (MQ=255) aaCTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCGCCTACGCACCGATc > 1:1331151/1‑126 (MQ=255) tGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGa < 2:209726/150‑1 (MQ=255) tGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGa < 2:1920615/150‑1 (MQ=255) aaaCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGacac > 2:1075594/1‑150 (MQ=255) aaCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGAc < 1:1953022/100‑1 (MQ=255) aaCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGAc > 2:1953022/1‑100 (MQ=255) aaCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGAcaca > 1:350768/1‑150 (MQ=255) aCAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAg < 1:1075594/150‑1 (MQ=255) aGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGtt > 1:2107075/1‑140 (MQ=255) aGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGtt < 2:2107075/140‑1 (MQ=255) ttGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTa < 1:1638803/104‑1 (MQ=255) ttGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTa > 2:1638803/1‑104 (MQ=255) tgtgCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGc > 2:1333188/1‑145 (MQ=255) tgtgCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGc < 1:1333188/145‑1 (MQ=255) tgCTTTACGGCTTGTGGTGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGGCCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCgtagta < 2:2189800/150‑1 (MQ=255) cTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTCTACCCGcgaaa > 2:513455/1‑92 (MQ=255) cTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTCTACCCGcgaaa < 1:513455/96‑5 (MQ=255) tttACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGa > 1:1212641/1‑150 (MQ=255) cGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCTGCTGGTTGTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGACACACACCGGGTGTTGGAAACAGGCCGTAGTAGGAgggg > 2:1667381/1‑150 (MQ=255) cGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCgg < 2:747011/150‑1 (MQ=255) gtgGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGTGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTAc > 2:1446899/1‑150 (MQ=255) gggCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCcg > 2:145426/1‑150 (MQ=255) ttGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTTGCGGGTAGACGCGCTCCTACGCGCCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACATGCCTTAGTATGAGCGGGTTTACCCGCGAAAg > 2:2018390/1‑150 (MQ=38) ttGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGAGACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAg > 2:1292374/1‑150 (MQ=255) ttGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:1332827/145‑1 (MQ=255) ttGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCcgc > 2:1332827/1‑145 (MQ=255) ttGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGACAg > 1:583651/1‑150 (MQ=255) tctgTCGGCGCCCC‑TTTTTGTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGTGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAg < 1:2051805/147‑1 (MQ=255) tGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgg < 1:1292374/150‑1 (MQ=255) tGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgg < 1:1581919/150‑1 (MQ=255) ggTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCCCCACTCTGCGGAGGGAAAGCAGGTACTGTTTGACACAGGCGGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAggg < 1:657604/150‑1 (MQ=255) 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ccTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAG‑GCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTtctc > 1:1934897/1‑150 (MQ=255) cTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAG‑GCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCa > 2:2010871/1‑150 (MQ=255) cTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAG‑GCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCa > 2:1156750/1‑150 (MQ=255) tttCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAG‑GCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCAt < 2:1212641/150‑1 (MQ=255) gagcgGGTCTACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGTCAGTCCAGAACCAAC‑CTGACGGGTCGTATCAAACGATGCCGGCTTTCTCATcc > 2:804226/3‑150 (MQ=18) gggTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGaaa > 1:1206758/1‑89 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gACCCGCTCCTCCGCCCCGATCTGCGGTGGGCACACACGGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGGAGGAGCGGGTTTTCCCGTGAAAGGGCCAGTCCAG‑GCCAACAAAAAAAGCCCTCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCATttca < 1:910517/150‑1 (MQ=255) gACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAG‑GCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCATttca > 2:804637/1‑150 (MQ=255) | ATCGAAGCGTGCAGTGCCGAGGCGATGGCACTGCTGGACGCCAACTGAAAACAGTTGTGTGCTTTACGGCTTGTGGGGCGCTTGGTCGGCGCCCC‑TTTTTTTTGCCTGGGGTATTTGCAGTGGTTGTGCTGGCCCTTTCGCGGGTAGACCCGCTCCTACGCACCGATCTGCGGTGGGCACACACCGGGTGTTGGACACAGGCCGTAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCAGTCCAG‑GCCAACAAAAAAAGCCCGCATCAAACGATGCGGGCTTTCTCATCCCTCATTTCA > NC_002947/1168442‑1168737 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |