| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,186,799 | G→T | 5.3% | Q666H (CAG→CAT) | purL → | phosphoribosylformylglycinamidine synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,186,799 | 0 | G | T | 5.3% | 297.9 / 4.7 | 94 | Q666H (CAG→CAT) | purL | phosphoribosylformylglycinamidine synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (51/38); new base T (2/3); total (53/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.74e-01 | |||||||||||
GAAGCCGAGCTGGGCGATGACTTCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGCATGGCCATCGGCGA > NC_002947/1186650‑1186948 | gAAGCCGAGCTGGGCGATGACTTCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGAAAAGCTCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAg < 1:1953929/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGGGCGATGACTTCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATg < 2:192748/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGGGCGATGACTTCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATg < 2:1155809/150‑1 (MQ=255) gAGCTGGGCGATGACTTCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTc > 2:1927439/1‑150 (MQ=255) aGCTGGGCGATGACTTCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCg < 1:553515/150‑1 (MQ=255) tGGGCGATGACTTCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCATCTGGTCgcgg < 1:342618/150‑4 (MQ=255) tGGGCGATGACTTCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCATCTGGTCgcgg < 1:1319607/150‑4 (MQ=255) tGGGCGATGACTTCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGcc < 1:756429/150‑1 (MQ=255) gCGATGACTTCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAATTGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGt < 2:1666088/150‑1 (MQ=255) gACTTCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAg < 2:1224581/150‑1 (MQ=255) ttCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGtt > 1:98260/1‑150 (MQ=255) ttCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGtt > 1:504718/1‑150 (MQ=255) ttCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGtt > 1:687947/1‑150 (MQ=255) ttCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGtt > 1:72353/1‑150 (MQ=255) aCCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCgg < 2:1431525/150‑1 (MQ=255) agcgagcTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGTCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGcc < 1:1364558/150‑1 (MQ=255) gacctggacAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGcc < 1:2397656/150‑1 (MQ=255) ctggacAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGtt > 1:1388819/1‑150 (MQ=255) tggacAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTa > 2:245117/1‑150 (MQ=255) ggacAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTAc < 2:504718/150‑1 (MQ=255) gTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATAACTATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGCCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGc < 1:1132174/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCt < 1:1786128/150‑1 (MQ=255) gcgcGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGAcca < 1:1328390/126‑3 (MQ=255) gcgcGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGAcca > 2:1328390/1‑124 (MQ=255) gcgcGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGccacca > 1:1196726/1‑143 (MQ=255) gcgcGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGccacca < 2:1196726/143‑1 (MQ=255) gcgTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTAAGTACCCACTGTTCACGACCGCACCATCACCGGCGTTGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACg > 1:1022940/1‑150 (MQ=255) tGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCt > 2:286399/1‑150 (MQ=255) tGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTaca > 1:1540207/1‑150 (MQ=255) accaccCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAg < 2:821417/80‑1 (MQ=255) accaccCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAg > 1:821417/1‑80 (MQ=255) ccaccCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGTTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCgg < 1:903967/150‑1 (MQ=255) accCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCTCCCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGGCTACCCCGGTg > 2:162619/1‑150 (MQ=255) accCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTg < 1:299236/150‑1 (MQ=255) ccGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGTTCTGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTCCCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGaa > 1:1621058/1‑150 (MQ=255) ccGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGaa > 1:325629/1‑150 (MQ=255) cGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAgccat < 1:621676/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAgccatggc > 1:872837/1‑150 (MQ=255) ggCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAgccatggc < 2:1022940/150‑1 (MQ=255) ggCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAgccatggc > 1:567083/1‑150 (MQ=255) ccAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAgccatggcca < 1:605821/150‑1 (MQ=255) cAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAgccatggccat > 2:614057/1‑150 (MQ=255) cAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAgccatggccat > 2:2006547/1‑150 (MQ=255) cAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAgccatggccat > 1:999686/1‑150 (MQ=255) gagCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGt > 1:1624568/1‑130 (MQ=255) gagCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGt < 2:1624568/130‑1 (MQ=255) gagCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGa < 1:245117/150‑1 (MQ=255) cTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGTAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCg > 2:1182669/1‑150 (MQ=255) ttCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCATCTGGTCgcgg < 2:1946088/64‑4 (MQ=255) ttCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCATCTGGTCgcgg > 1:1946088/1‑61 (MQ=255) tCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGCTCCTGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTa < 1:162619/150‑1 (MQ=255) tGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTACGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTAcgc > 1:1094348/1‑150 (MQ=255) cACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCt > 2:1142510/1‑150 (MQ=255) aCCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGCCCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTg > 1:2294655/1‑150 (MQ=255) cATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGgc > 2:195520/1‑150 (MQ=255) cATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGgc > 1:1838149/1‑150 (MQ=255) aTTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGgcg > 2:771868/1‑150 (MQ=255) ttGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGgcgc < 1:1927439/150‑1 (MQ=255) 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2:1743574/1‑150 (MQ=255) cGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGAt > 2:1971556/1‑150 (MQ=255) cACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTa > 2:2230309/1‑74 (MQ=255) cACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTa < 1:2230309/74‑1 (MQ=255) cACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGc > 1:1284869/1‑150 (MQ=255) cACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGc > 1:2266428/1‑150 (MQ=255) aCCCTCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTCGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGcc > 2:906254/1‑150 (MQ=255) aCCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGcc > 1:12286/1‑150 (MQ=255) cATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGa < 2:1544531/120‑1 (MQ=255) cATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGa > 1:1544531/1‑120 (MQ=255) aCCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCg > 1:1438345/1‑150 (MQ=255) aCCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCg > 2:2148024/1‑150 (MQ=255) ccGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGt > 1:2099083/1‑150 (MQ=255) gCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCg < 1:286399/150‑1 (MQ=255) tGGTCGCCCGCGGCCAGAGGGTCGGCTCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCCCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGCATGCCCCGGCGTCCGGcc < 2:72353/150‑1 (MQ=255) ggTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCg > 2:1928215/1‑150 (MQ=255) gTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCt < 1:359140/119‑1 (MQ=255) gTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCt > 2:359140/1‑119 (MQ=255) gTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGc > 1:2409748/1‑150 (MQ=255) tGCCCGCGACCAGATGGCCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGCAt < 2:98260/150‑1 (MQ=255) cccGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGCATgg < 2:1838149/150‑1 (MQ=255) ccGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGCATGGc > 2:1732255/1‑150 (MQ=255) ccGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGCATGGc > 2:1521326/1‑150 (MQ=255) ccGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGCATGGc > 1:95469/1‑150 (MQ=255) ccGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGCATGGc > 1:945874/1‑150 (MQ=255) ccGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGCATGGc > 1:2360511/1‑150 (MQ=255) gccgACCATCTGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGCATGGcc > 2:101469/3‑150 (MQ=255) cgcgACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGc < 2:382350/141‑1 (MQ=255) cgcgACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGc > 1:382350/1‑141 (MQ=255) gACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCACCGGCGTTCGGCCGCATGGCCATc < 2:1419075/150‑1 (MQ=255) aCCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGCATGGCCATCg < 2:2294655/150‑1 (MQ=255) cAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGcca < 2:258090/52‑1 (MQ=255) cAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGcca > 1:258090/1‑52 (MQ=255) cAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGCATGGCCATCGGc > 2:218287/1‑150 (MQ=255) gATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCAGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGCATGGCCATCGGCGa > 1:936232/1‑150 (MQ=255) | GAAGCCGAGCTGGGCGATGACTTCGACCCGAGCGAGCTGGACCTGGACAGCGCCGTCCAGCGCGTGCTGAACCACCCGGCCGTGGCCAGCAAGAGCTTCCTGATCACCATTGGCGACCGCACCATCACCGGCCTGGTTGCCCGCGACCAGATGGTCGGCCCGTGGCAGGTTCCGGTGGCCGACTGCGCCGTTACCGCCACCAGCTTCGACGTCTACACCGGTGAAGCCATGGCCATGGGCGAGCGTACGCCGCTGGCGCTGCTGGATGCCCCGGCGTCCGGCCGCATGGCCATCGGCGA > NC_002947/1186650‑1186948 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |