Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,193,934 | T→A | 9.6% | L23M (TTG→ATG) ‡ | uxpA → | lipoprotein UxpA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,193,934 | 0 | T | A | 9.6% | 255.4 / 14.0 | 83 | L23M (TTG→ATG) ‡ | uxpA | lipoprotein UxpA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/30); new base A (6/2); total (51/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.77e-01 |
ATTGGAATTGCTGTCGGATTTCTGCCATCAAACTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAGGCGGTGGTACCGGCTACCCGGTTGGGGCCGGTCAGCCA > NC_002947/1193785‑1194082 | aTTGGAATTGCTGTCGGATTTCTGCCATCAAACTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCt > 2:544499/1‑150 (MQ=255) tCGGATTTCTGCCATCAAACTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCgctgct > 2:221803/1‑150 (MQ=255) cGGATTTCTGCCATCAAACTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTc < 1:1938046/150‑1 (MQ=255) ggATTTCTGCCATCAAACTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCg > 2:306022/1‑150 (MQ=255) tttCTGCCATCAAACTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGgcg > 1:1828154/1‑150 (MQ=255) tttCTGCCATCAAACTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGgcg > 1:155859/1‑150 (MQ=255) tGCCATCAAACTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTg > 2:1082819/1‑150 (MQ=255) cATCAAACTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGcac > 1:1016934/1‑150 (MQ=255) tCAAACTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAg > 1:1519043/1‑150 (MQ=255) aaaCTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCAAGGC‑ACCgata < 1:2134264/132‑4 (MQ=255) aaaCTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCAAGGC‑ACCgata > 2:2134264/1‑129 (MQ=255) aaCTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCt > 2:128714/1‑150 (MQ=255) tGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTcc < 1:306022/150‑1 (MQ=255) aaTGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAg < 1:544499/150‑1 (MQ=255) aTGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAgg < 2:2215204/150‑1 (MQ=255) tGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAggg < 1:644729/150‑1 (MQ=255) aaCGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGgcagc > 1:430739/1‑150 (MQ=255) aCGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGgcagca < 2:1497302/150‑1 (MQ=255) cgccgcAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑a < 2:2375649/111‑1 (MQ=255) cgccgcAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑a > 1:2375649/1‑111 (MQ=255) cgcAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGggc > 2:654283/1‑150 (MQ=255) aaCATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGCCTGGATGTATATTGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGggcggc > 2:685682/1‑150 (MQ=255) tCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATg > 2:2141029/1‑150 (MQ=255) ccGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCAAAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGc > 1:1673230/1‑150 (MQ=255) cGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGcc < 2:1016934/150‑1 (MQ=255) gggTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGccc > 2:1977565/1‑150 (MQ=255) cTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCg > 2:120537/1‑150 (MQ=255) gAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTc < 1:1780574/117‑1 (MQ=255) gAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTc > 2:1780574/1‑117 (MQ=255) aTGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACtt > 1:1554327/1‑150 (MQ=255) tGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTg < 1:176192/150‑1 (MQ=255) tGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTg < 1:176156/150‑1 (MQ=255) tGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTg < 2:895100/150‑1 (MQ=255) aCGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCACAGCTAGCCTTGcgg > 2:477384/1‑148 (MQ=255) gTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTa > 1:1730142/1‑150 (MQ=255) ttAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTc < 2:1828154/150‑1 (MQ=255) ttAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTc > 1:948796/1‑150 (MQ=255) ttAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTc > 1:56805/1‑150 (MQ=255) ggCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGTATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAggg < 1:278359/103‑1 (MQ=255) ggCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGTATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAggg > 2:278359/1‑103 (MQ=255) tGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGa < 1:654283/150‑1 (MQ=255) tGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGa < 2:155859/150‑1 (MQ=255) gATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGcc > 1:1804618/1‑136 (MQ=255) gATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGcc < 2:1804618/136‑1 (MQ=255) tGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCtt > 1:1592191/1‑55 (MQ=255) tGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCtt < 2:1592191/55‑1 (MQ=255) tGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGAGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGccc > 2:355634/1‑150 (MQ=255) tGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATAGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGccc < 1:2281641/150‑1 (MQ=255) gAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCa > 1:1204051/1‑150 (MQ=255) gAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCa > 1:1217466/1‑150 (MQ=255) gAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGACTGGATCGATGT‑TCTGCAAGGCCTGCCGCGGCTCGGCGCGCTG‑GGGGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGAGTTGCAGTACGTCGCCGATACACTCGATGCCCGCCa > 1:420696/1‑150 (MQ=255) aGCAGTGTGCACGGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCAAGGC‑ACCga < 1:1886340/58‑2 (MQ=255) aGCAGTGTGCACGGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCAAGGC‑ACCga > 2:1886340/1‑57 (MQ=255) acaGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCAGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAgg > 1:1536329/1‑150 (MQ=255) gcgcGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAGGCggt < 1:2313377/150‑1 (MQ=255) gcgcGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAGGCggt < 2:1554327/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAGGCggtg < 1:128714/150‑1 (MQ=255) gAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAGGCGGTGGTa > 1:2079482/1‑150 (MQ=255) 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gCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAAt < 2:2055846/74‑1 (MQ=255) gCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAAt > 1:2055846/1‑74 (MQ=255) gCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTg > 1:1300162/1‑126 (MQ=255) gCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTg < 2:1300162/126‑1 (MQ=255) gCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAg < 1:1177178/131‑1 (MQ=255) gCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAg > 2:1177178/1‑131 (MQ=255) gCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAGGCGGTGGTACCGGCTAccc > 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gcGGTGCCAAGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAGGCGGTGGTACCGGCTACCCGGTTGGGGCCgg > 1:2289971/2‑150 (MQ=255) gcGGTGCCAAGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAGGCGGTGGTACCGGCTACCCGGTTGGGGCCgg > 2:2335907/2‑150 (MQ=255) gcGGTGCCAAGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAGGCGGTGGTACCGGCTACCCGGTTGGGGCCgg > 2:1018281/2‑150 (MQ=255) cTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAGGCGGTGGTACCGGCTACCCGGTTGGGGCCGGTCAGCCa > 1:973145/1‑150 (MQ=255) cTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAGGCGGTGGTACCGGCTACCCGGTTGGGGCCGGTCAGCCa > 1:1160138/1‑150 (MQ=255) | ATTGGAATTGCTGTCGGATTTCTGCCATCAAACTGTAATGCCAACGCCGCAACATCCGGGTCCCTGAATGGACGTGGTTAAGGATGGCGGATGCGATGGCGAGCAGTGTGCACAGGCGCGAAGTGATCGGCTGGATGGGTATCGGTGCCTTGGC‑ACCGCTGCTCGGCGC‑CTGCACAGCCTTCCCAGGGCAGCAGGGCGGCAATGCCCAGCTCGACTTGCTGTACGTCGCCGATACCCTCGATGCCCGCCAGCCTGGCCAGGCGGTGGTACCGGCTACCCGGTTGGGGCCGGTCAGCCA > NC_002947/1193785‑1194082 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |