| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,198,338 | C→T | 7.7% | A214A (GCC→GCT) | gspE → | protein secretion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,198,338 | 0 | C | T | 7.7% | 366.7 / 14.9 | 130 | A214A (GCC→GCT) | gspE | protein secretion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (54/65); new base T (3/7); total (57/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.11e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.00e-01 | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
TGGCCCGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGAACAGCCT > NC_002947/1198190‑1198487 | ggCCCGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAg > 2:2038699/1‑150 (MQ=255) cccGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGcc < 2:583760/150‑1 (MQ=255) cTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCTGGCctgctt < 1:1879762/150‑2 (MQ=255) tGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCTGGCctgcttg < 1:968799/150‑3 (MQ=255) aCATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGgcgc < 1:746196/150‑1 (MQ=255) aCATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGgcgc < 2:2042822/150‑1 (MQ=255) cATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCTGGCctgcttgtcga < 2:488830/150‑7 (MQ=255) aTTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTg > 1:1549959/1‑150 (MQ=255) ttGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTgg > 2:2233330/1‑150 (MQ=255) cGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATa < 1:2382078/150‑1 (MQ=255) ggAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGACGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGACGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCACGCGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTCGATac > 2:2301007/1‑149 (MQ=255) gAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGCATAGCAGTCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAAc < 1:1871512/150‑1 (MQ=255) aaaaGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCct < 1:319653/133‑1 (MQ=255) aaaaGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCct > 2:319653/1‑133 (MQ=255) agcctgggCCCCAGGACGGCCGTCTCACCGTGCGTGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGTCCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAACGAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTgg < 1:924089/143‑1 (MQ=255) tCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCt > 2:2386687/1‑135 (MQ=255) tCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCt < 1:2386687/135‑1 (MQ=255) tCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCAt > 1:1675225/1‑150 (MQ=255) tCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCAGGCTGgcctgc < 1:1169767/136‑5 (MQ=255) tCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCAGGCTGgcctgc > 2:1169767/1‑132 (MQ=255) cccAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCgg < 2:1039656/150‑1 (MQ=255) cAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCa < 2:1387638/150‑1 (MQ=255) cAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCa > 2:844572/1‑150 (MQ=255) cAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCa < 1:2038699/150‑1 (MQ=255) cGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGt < 1:67016/150‑1 (MQ=255) cGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTg > 2:1598908/1‑150 (MQ=255) tCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAgg < 1:588371/150‑1 (MQ=255) tCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGATCAACAAGAAGGCCAGGCTGTTGGCGCTCGATATCCTAGGCATGTTGGTAGCGGTATTGCAgg < 2:636911/150‑1 (MQ=255) aCCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGc > 2:2002831/1‑150 (MQ=255) ggcggGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTg > 1:1633128/1‑150 (MQ=255) gcggGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGc > 1:2150729/1‑150 (MQ=255) cggGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATCACCTAGAACTGCGGACAAGGGTAGTGCAGGGCCTGCGCAGTTGcc > 2:633988/1‑150 (MQ=255) ggggCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCt < 2:2124189/150‑1 (MQ=255) ggggCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGAATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCt > 2:916551/1‑150 (MQ=255) gcgcGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGgc > 2:1897812/1‑150 (MQ=255) gcgcGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGgc < 1:1534073/150‑1 (MQ=255) gcgAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAg < 2:1300103/128‑1 (MQ=255) aaGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGc < 1:624700/150‑1 (MQ=255) tGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCa < 1:810898/150‑1 (MQ=255) gACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCt > 1:2028977/1‑86 (MQ=255) gACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAAc > 1:1028305/1‑150 (MQ=255) gACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAAc < 1:1598908/150‑1 (MQ=255) gACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGAGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAAc > 2:2393061/1‑150 (MQ=255) cGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACgg < 2:1633128/150‑1 (MQ=255) aCGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCAACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCAt > 2:2124484/1‑150 (MQ=255) cGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCAtt < 2:2284221/150‑1 (MQ=255) gAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATtg > 1:2262530/1‑150 (MQ=255) gTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATtgtg < 1:689657/150‑1 (MQ=255) tctcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCgg > 2:1567699/1‑96 (MQ=255) tctcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGCGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCGGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGc > 1:803369/1‑150 (MQ=255) ctcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCAtt < 2:2302062/145‑1 (MQ=255) ctcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCt < 1:10641/150‑1 (MQ=255) ctcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCCTGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCt < 1:2069242/150‑1 (MQ=255) cGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGt < 1:1079249/150‑1 (MQ=255) gACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGgcgc < 1:1692689/128‑1 (MQ=255) gACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGgcgc > 2:1692689/1‑128 (MQ=255) aCCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTcc > 2:1279120/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAAc > 1:87572/1‑77 (MQ=255) cTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCt < 2:621008/78‑1 (MQ=255) cTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCt > 1:621008/1‑78 (MQ=255) ttGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCAcc > 1:1449845/1‑150 (MQ=255) ccGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGgcgc > 2:1666781/1‑63 (MQ=255) ccGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGc < 2:1325593/150‑1 (MQ=255) gCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGa > 2:185232/1‑150 (MQ=255) cATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGAc > 1:1388199/1‑150 (MQ=255) aTCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGAcc > 2:51519/1‑150 (MQ=255) cACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGt < 2:104016/150‑1 (MQ=255) cGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTc < 1:2233330/150‑1 (MQ=255) ggCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCg < 2:2030771/150‑1 (MQ=255) gCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCgg < 2:1582232/150‑1 (MQ=255) ccGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCCCTGCATAACCTGGGCACGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCTAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCgg < 2:772256/149‑1 (MQ=255) cGAGCCGGTTGTGAGGCGCTTGCTCGACAAGCCGGCAAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGTCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTGGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCCCCGGGCCGACCGGTTCggg < 1:410545/150‑1 (MQ=255) cGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAg < 2:1028305/150‑1 (MQ=255) gtggtgATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGtt > 1:2193217/1‑91 (MQ=255) gtggtgATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGtt < 2:2193217/91‑1 (MQ=255) gtggtgATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCt < 1:2369196/119‑1 (MQ=255) gtggtgATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCt > 2:2369196/1‑119 (MQ=255) gtggtgATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGAcc > 1:425467/1‑150 (MQ=255) tggtgATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCNCTGGATNACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTTCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCa > 1:1222077/1‑150 (MQ=255) ggtgATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCAc < 1:1279120/150‑1 (MQ=255) ggtgATGCGCGCGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCAc < 1:130106/150‑1 (MQ=255) gATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCg > 1:1743400/1‑64 (MQ=255) gATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCg < 2:1743400/64‑1 (MQ=255) gATGCGCGTGCCCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGGCCGCCGTTTCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGAc < 2:2019591/150‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGAcc < 2:1034665/150‑1 (MQ=255) gcgcGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCtt > 2:896576/1‑150 (MQ=255) gcgcGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCtt > 2:896735/1‑150 (MQ=255) gcgcGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTCATCGAGATCTATAACCTTGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCtt < 2:803369/150‑1 (MQ=255) gTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTAc < 1:1547061/150‑1 (MQ=255) gTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTAc < 1:1105639/150‑1 (MQ=255) gcgccaGCAGGCTGGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGa > 1:1647598/6‑131 (MQ=255) gcgccaGCAGGCTGGCCTGCTGCCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGa < 2:1647598/126‑1 (MQ=255) gACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGc < 2:612152/150‑1 (MQ=255) ccaGCAGGCTGGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCgg > 2:793232/3‑82 (MQ=255) ccaGCAGGCTGGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCgg < 1:793232/80‑1 (MQ=255) ccaGCAGGCTGGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGc > 1:792972/3‑110 (MQ=255) cAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCt < 1:844572/150‑1 (MQ=255) gCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGaa < 2:1449845/150‑1 (MQ=255) cAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGAAc > 1:893107/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGAACAGCCt > 1:1851348/1‑150 (MQ=255) | TGGCCCGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGCAGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGAACAGCCT > NC_002947/1198190‑1198487 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |