| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,198,339 | A→G | 7.6% | S215G (AGC→GGC) | gspE → | protein secretion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,198,339 | 0 | A | G | 7.6% | 387.1 / 13.6 | 131 | S215G (AGC→GGC) | gspE | protein secretion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (54/66); new base G (3/7); total (58/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
TGGCCCGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGAACAGCCTC > NC_002947/1198190‑1198488 | tGGCCCGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCa > 1:544264/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAg > 2:2038699/1‑150 (MQ=255) cccGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGcc < 2:583760/150‑1 (MQ=255) ccGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCct > 2:2090049/1‑150 (MQ=255) tGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCTGGCctgcttg < 1:975541/150‑3 (MQ=255) tGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCTGGCctgcttg < 1:968799/150‑3 (MQ=255) aCATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGgcgc < 2:2042822/150‑1 (MQ=255) aCATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGgcgc < 1:746196/150‑1 (MQ=255) cATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCTGGCctgcttgtcga < 2:488830/150‑7 (MQ=255) aTTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTg > 1:1549959/1‑150 (MQ=255) ttGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTgg > 2:2233330/1‑150 (MQ=255) ggAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGACGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGACGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCACGCGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTCGATac > 2:2301007/1‑149 (MQ=255) gAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGCATAGCAGTCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAAc < 1:1871512/150‑1 (MQ=255) aaaaGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCct > 2:319653/1‑133 (MQ=255) aaaaGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCct < 1:319653/133‑1 (MQ=255) tCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCt < 1:2386687/135‑1 (MQ=255) tCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCt > 2:2386687/1‑135 (MQ=255) tCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCAt > 1:1675225/1‑150 (MQ=255) tCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCAGGCTGgcctgc < 1:1169767/136‑5 (MQ=255) cccAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGGCGTGCGAGTCTCGACCTTGCCCGGCAGCCACGGTGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCCGGCTGCTGGCGTTGGCTGACCTGGGCATGCCgg > 1:772256/1‑150 (MQ=255) cccAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCgg < 2:1039656/150‑1 (MQ=255) cAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCa > 2:844572/1‑150 (MQ=255) cAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCa < 1:2038699/150‑1 (MQ=255) cAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCa < 2:1387638/150‑1 (MQ=255) cGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGt < 1:67016/150‑1 (MQ=255) cGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTg > 2:1598908/1‑150 (MQ=255) tCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAgg < 1:588371/150‑1 (MQ=255) tCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGATCAACAAGAAGGCCAGGCTGTTGGCGCTCGATATCCTAGGCATGTTGGTAGCGGTATTGCAgg < 2:636911/150‑1 (MQ=255) aCCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGc > 2:2002831/1‑150 (MQ=255) cTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCt > 1:1884666/1‑111 (MQ=255) cTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCt < 2:1884666/111‑1 (MQ=255) ggcggGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTg > 1:1633128/1‑150 (MQ=255) gcggGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGc > 1:2150729/1‑150 (MQ=255) cggGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATCACCTAGAACTGCGGACAAGGGTAGTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGcc > 2:633988/1‑150 (MQ=255) ggggCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGAATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCt > 2:916551/1‑150 (MQ=255) gcgcGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGgc < 1:1534073/150‑1 (MQ=255) cgcgAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCTGTTGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGgcg < 1:633988/150‑1 (MQ=255) gcgAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAg < 2:1300103/128‑1 (MQ=255) aaGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGc < 1:624700/150‑1 (MQ=255) tGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCa < 1:810898/150‑1 (MQ=255) gACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCt > 1:2028977/1‑86 (MQ=255) gACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCt < 2:2028977/86‑1 (MQ=255) gACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAAc > 1:1028305/1‑150 (MQ=255) gACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAAc < 1:1598908/150‑1 (MQ=255) gACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGAGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAAc > 2:2393061/1‑150 (MQ=255) aCGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACg < 1:809380/150‑1 (MQ=255) aCGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCAACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCAt > 2:2124484/1‑150 (MQ=255) cGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCAtt < 2:2284221/150‑1 (MQ=255) cGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCAtt < 2:1475518/150‑1 (MQ=255) gAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATtg > 1:2262530/1‑150 (MQ=255) tctcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGCGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCGGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGc > 1:803369/1‑150 (MQ=255) ctcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCAtt < 2:2302062/145‑1 (MQ=255) ctcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCAtt > 1:2302062/1‑145 (MQ=255) ctcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCt < 1:10641/150‑1 (MQ=255) ctcGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCt < 2:1675225/150‑1 (MQ=255) cGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGt < 1:1079249/150‑1 (MQ=255) gACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGgcgc < 1:1692689/128‑1 (MQ=255) gACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTc > 2:130106/1‑150 (MQ=255) aCCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTcc > 2:1279120/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAAc > 1:87572/1‑77 (MQ=255) cTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCt < 2:621008/78‑1 (MQ=255) ttGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCAcc > 1:1449845/1‑150 (MQ=255) ccGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGgcgc > 2:1666781/1‑63 (MQ=255) ccGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGc < 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gtggtgATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCt > 2:2369196/1‑119 (MQ=255) gtggtgATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCt < 1:2369196/119‑1 (MQ=255) gtggtgATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGAcc > 1:425467/1‑150 (MQ=255) tggtgATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCNCTGGATNACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTTCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCa > 1:1222077/1‑150 (MQ=255) ggtgATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCAc < 1:1279120/150‑1 (MQ=255) ggtgATGCGCGCGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCAc < 1:130106/150‑1 (MQ=255) gATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCg > 1:1743400/1‑64 (MQ=255) gATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCg < 2:1743400/64‑1 (MQ=255) gATGCGCGTGCCCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGGCCGCCGTTTCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGAc < 2:2019591/150‑1 (MQ=255) aTGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGAcc > 2:1089064/1‑150 (MQ=255) gcgcGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCtt > 2:896735/1‑150 (MQ=255) gcgcGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCtt > 2:896576/1‑150 (MQ=255) gcgcGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTCATCGAGATCTATAACCTTGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCtt < 2:803369/150‑1 (MQ=255) gTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTAc < 1:1547061/150‑1 (MQ=255) gTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTAc < 1:1105639/150‑1 (MQ=255) gcgccaGCAGGCTGGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGa > 1:1647598/6‑131 (MQ=255) gcgccaGCAGGCTGGCCTGCTGCCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGa < 2:1647598/126‑1 (MQ=255) gACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGc < 2:612152/150‑1 (MQ=255) ccaGCAGGCTGGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCgg > 2:793232/3‑82 (MQ=255) ccaGCAGGCTGGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGc > 1:792972/3‑110 (MQ=255) gCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTTTTGCCTGTTCGTCACAAGGTG‑CTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGaa < 1:2090049/150‑1 (MQ=255) gCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGaa < 2:1449845/150‑1 (MQ=255) cAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGAAc > 1:893107/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGAACAGCCt > 1:1851348/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGAACAGCCt > 1:1851269/1‑150 (MQ=255) | TGGCCCGCCTGGACATTGCGGAAAAGCGTCAGCCCCAGGACGGCCGCATCACCTTGCGCGCGGCGGGGCGCGAAGTGGACGTACGAGTCTCGACCTTGCCCGGCATCCACGGCGAGCGGGTGGTGATGCGCGTGCTCGACAAGCAGGCCAGCCTGCTGGCGCTGGATAACCTGGGCATGCCGGCAGCGGTATTGCAGGGCCTGCGC‑AGTTGCCTGGCGCGGCCCAACGGCATTGTGCTGTCCACCGGGCCGACCGGTTCGGGCAAGACCACGACCTTGTACGCCAGCCTGAACAGCCTC > NC_002947/1198190‑1198488 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |