| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,199,573 | C→G | 9.3% | A141G (GCC→GGC) | gspF → | protein secretion protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,199,573 | 0 | C | G | 9.3% | 286.3 / 17.7 | 97 | A141G (GCC→GGC) | gspF | protein secretion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/48); new base G (5/4); total (45/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
CAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCTGATGACGTTCGTCGTGCCCAAA > NC_002947/1199425‑1199718 | cAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGcc < 2:648809/150‑1 (MQ=255) cctgccctgcACATTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAg > 2:286214/1‑150 (MQ=255) cctgccctgcACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAg > 2:2271823/1‑150 (MQ=255) cctgcACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCt > 2:1056476/1‑150 (MQ=255) ctgcACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGGCCAGGTGccc < 1:778167/150‑3 (MQ=255) ctgcACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGAGCACCTGGGCCAGGTGccc < 2:1776362/150‑3 (MQ=255) tgcACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGa < 1:2188863/150‑1 (MQ=255) tgcACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTAACTCGCNGAAGGCCTGNGCATGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGGCCAGGTGcccg > 1:1068750/1‑147 (MQ=255) tgcACAGTGTGCTGGTGGACTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGa < 2:1124833/150‑1 (MQ=255) gtgtGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCt < 1:1056476/150‑1 (MQ=255) tgtgCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCtt < 2:958672/150‑1 (MQ=255) tgtgCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCtt < 1:1462753/150‑1 (MQ=255) tgtgCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCCTTGCTTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCtt < 2:1873143/150‑1 (MQ=255) tggtggCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGTCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCg < 1:2102487/150‑1 (MQ=255) gtggCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTg < 1:697283/144‑1 (MQ=255) gtggCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTg > 2:697283/1‑144 (MQ=255) gtggCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGac > 2:738271/1‑150 (MQ=255) gggCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGacc < 2:1439016/149‑1 (MQ=255) ttGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGTAGGGTGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGTGGCCGGTCCTGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTg < 1:2244086/150‑1 (MQ=255) ttGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTg < 1:1900930/150‑1 (MQ=255) gcgGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGTGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGc > 1:1043970/1‑150 (MQ=255) ggCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAg < 1:1798673/150‑1 (MQ=255) cTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGGCCAGGTGcccg < 1:1308617/122‑4 (MQ=255) cTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGGCCAGGTGcccg > 2:1308617/1‑119 (MQ=255) cTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGt < 1:510914/150‑1 (MQ=255) tCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTg > 1:842088/1‑150 (MQ=255) aCTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCa > 2:41119/1‑150 (MQ=255) aCTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCCTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGCACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCGGACCACCCGGAGCAGGGGCa > 1:1088429/1‑150 (MQ=255) tCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGGCCAg < 2:1447341/110‑1 (MQ=255) tCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGGCCAg > 1:1447341/1‑110 (MQ=255) tCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAAc > 2:874792/1‑150 (MQ=255) tCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAAc > 1:1471846/1‑150 (MQ=255) tCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAAc < 2:492145/150‑1 (MQ=255) tCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAAc > 1:991847/1‑150 (MQ=255) gCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGc > 1:2183776/1‑150 (MQ=255) cGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCa < 1:1517564/150‑1 (MQ=255) cGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCa < 1:1822759/150‑1 (MQ=255) gAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGACCGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAg > 1:494537/1‑150 (MQ=255) gAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAg > 1:286418/1‑150 (MQ=255) aaGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGc > 2:2118782/1‑150 (MQ=255) aaGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGc < 1:738271/150‑1 (MQ=255) gtgggcctggCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAacac > 2:1658635/2‑150 (MQ=255) ctgggcctggCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGcc > 2:2225993/1‑96 (MQ=255) ctgggcctggCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGcc < 1:2225993/96‑1 (MQ=255) ctgggcctggCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAacac > 1:2261892/1‑150 (MQ=255) tgggcctggCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAAcaca > 2:1064566/1‑150 (MQ=255) ctggCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGcc > 2:271386/1‑150 (MQ=255) cccGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGcc > 1:189789/1‑146 (MQ=255) cccGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGcc < 2:189789/146‑1 (MQ=255) cccGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGca < 1:1064566/150‑1 (MQ=255) ccGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGcac > 1:275319/1‑150 (MQ=255) gCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAg > 2:818200/1‑150 (MQ=255) ggccaggCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAgcg < 1:694073/145‑1 (MQ=255) ccTGGCCCGGCAGGGCGCACCCTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGGCGGCGAACGTTCCGGGCACCGGGCGCAGGTGCTGACCCCCTTAGCAGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCAAAgcaat < 2:1011192/150‑4 (MQ=255) tGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGt < 2:608456/115‑1 (MQ=255) tGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGt > 1:608456/1‑115 (MQ=255) tGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGa < 1:874792/150‑1 (MQ=255) ggCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAAAATTCCTGGCACCGGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGAt < 1:286214/150‑1 (MQ=255) cGGTAGGGCGCCCCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTAc < 2:137338/150‑1 (MQ=255) cACCGTTCACTGGCTTGTACTGCTCGCTGGTCTAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACTTGGCTCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGATCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGc < 2:323680/150‑1 (MQ=255) cACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGc > 2:948738/1‑150 (MQ=255) tCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATgg < 2:95826/150‑1 (MQ=255) tCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCACGCTGTGCTGATgg < 2:842088/150‑1 (MQ=255) ttGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCg > 1:1807295/1‑150 (MQ=255) ttGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCg < 1:338360/150‑1 (MQ=255) gTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCt < 1:2271823/150‑1 (MQ=255) gTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCt < 1:2118782/150‑1 (MQ=255) tACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTg < 2:991847/150‑1 (MQ=255) tGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGcc > 2:1879951/1‑150 (MQ=255) cgcTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTTACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCGGATCTACCCCGCTGTGTTGATGGGGGTGTCGCTGGCCgtgg < 2:707764/150‑1 (MQ=255) gcTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTg < 1:2305321/76‑1 (MQ=255) gcTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTg > 2:2305321/1‑76 (MQ=255) gcTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGa > 2:776362/1‑110 (MQ=255) gcTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGa < 1:776362/110‑1 (MQ=255) ggTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACACGGCCCGCTTCGCGCTTATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGAt < 1:1268600/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGAtt > 1:240550/1‑150 (MQ=255) aGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGcc < 1:1687230/150‑1 (MQ=255) aGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGcc > 2:1687230/1‑150 (MQ=255) aGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGcc < 1:1658635/150‑1 (MQ=255) gggcGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAg > 1:2405643/4‑64 (MQ=255) ggCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAg < 2:2405643/64‑1 (MQ=255) cGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCtgat > 2:976795/1‑150 (MQ=255) aCGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGAtt > 1:496306/1‑136 (MQ=255) aCGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGAtt < 2:496306/136‑1 (MQ=255) aCGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCTGATGACGtt > 2:2361437/1‑150 (MQ=255) cGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCgtggt < 1:227902/131‑1 (MQ=255) cGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCgtggt > 2:227902/1‑131 (MQ=255) cGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCTGATGACGTtc < 1:976795/150‑1 (MQ=255) gTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCTGATGACGTtcg < 1:41119/150‑1 (MQ=255) gTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCTGATGACGTtcg > 1:1042885/1‑150 (MQ=255) gtcagCACCTGGGCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCTGATGACGTtcgtcg > 2:1638383/5‑150 (MQ=255) tcagCACCTGGGCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCTGATGACGTTcgtcgt > 2:1029895/4‑150 (MQ=255) cGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGTTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCTGATGACGTTcgtcgt < 2:1043970/150‑1 (MQ=255) ggCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCTGATGACGTTCGTCGTGc < 1:818200/150‑1 (MQ=255) cACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCTGATGACGTTCGTCGTGccc < 2:1362877/150‑1 (MQ=255) aCCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCtgat > 1:1307462/1‑133 (MQ=255) aCCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCtgat < 2:1307462/133‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAac < 1:2070279/58‑1 (MQ=255) cTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAac > 2:2070279/1‑58 (MQ=255) cTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCTGATGACGTTCGTCGTGCCCaaa > 1:2205576/1‑150 (MQ=255) | CAGCCTGCCCTGCACAGTGTGCTGGTGGCCTTGCGCGGCTCACTCGCCGAAGGCCTGGGCCTGGCCCGCAGCCTGGCCCGGCAGGGCGCACCGTTCACTGGCTTGTACTGCGCGCTGGTCGAGGCCGGCGAACGTTCCGGGCACCTGGCCCAGGTGCTGACCCGCTTGGCCGACCACCTGGAGCAGGTGCAACGCCAGCAACACAAGGCCCGCACAGCGCTGATCTACCCCGCTGTGCTGATGGGTGTGTCGCTGGCCGTGGTGATTGGCCTGATGACGTTCGTCGTGCCCAAA > NC_002947/1199425‑1199718 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |