Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 151,062 | T→C | 5.7% | intergenic (‑113/+19) | PP_0142 ← / ← PP_0143 | ABC transporter permease/membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 151,062 | 0 | T | C | 5.7% | 264.6 / 4.4 | 87 | intergenic (‑113/+19) | PP_0142/PP_0143 | ABC transporter permease/membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (44/38); new base C (3/2); total (47/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.39e-01 |
TGTCCAGGGTGGCGCTGGGGTTGGTCATAGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTCC > NC_002947/150913‑151208 | tgtCCAGGGTGGCGCTGGGGTTGGTCATAGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTtgt < 2:1292794/150‑1 (MQ=255) cAGGGTGGCGCTGGGGTTGGTCATAGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGtgctg > 1:2254689/1‑150 (MQ=255) cAGGGTGGCGCTGGGGTTGGTCATAGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCACGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACTCTGGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGtgctg > 1:1738150/1‑150 (MQ=255) gTGGCGCTGGGGTTGGTCATAGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCa > 2:227519/1‑150 (MQ=255) cgcTGGGGTTGGTCATAGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGc < 1:822330/150‑1 (MQ=255) gcTGGGGTTGGTCATAGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCa > 2:2047301/1‑150 (MQ=255) gcTGGGGTTGGTCATAGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCa > 2:2033181/1‑150 (MQ=255) gcTGGGGTTGGTCATAGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGCGCAGCACAAGGcg < 2:370023/150‑2 (MQ=255) cTGGGTTTGGTTCTAGGCTCTATGCAATTGTCTCGGCGCTAGGGGTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGTTGATTATGTGCTGTGTGGACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCTGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAg < 2:545625/150‑1 (MQ=255) tGGGGTTGGTCATAGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAgg > 2:2375068/1‑150 (MQ=255) tCATAGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACt < 1:851425/150‑1 (MQ=255) tAGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTAcc > 1:829195/1‑150 (MQ=255) aGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTAccc < 1:2047301/150‑1 (MQ=255) gCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCcgc > 1:1205510/1‑150 (MQ=255) cTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCaa > 2:610309/1‑141 (MQ=255) cTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCaa < 1:610309/141‑1 (MQ=255) cTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCcgcg < 1:2375068/150‑1 (MQ=255) tCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGTGGGTCAACTACCCGCgg > 2:1346375/1‑150 (MQ=255) aaTTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGTGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGtgctgc < 1:2097369/116‑1 (MQ=255) aaTTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGtgctgc > 2:2097369/1‑116 (MQ=255) aaTTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGt > 2:608497/1‑130 (MQ=255) aaTTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGt < 1:608497/130‑1 (MQ=255) tGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCAtt < 2:1608535/150‑1 (MQ=255) cTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGac < 1:226720/150‑1 (MQ=255) tCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGTTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGacc > 2:2308547/1‑150 (MQ=255) tCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTCGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGacc > 2:1542179/1‑150 (MQ=255) ggCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGaccac > 2:844842/1‑150 (MQ=255) ggCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGCGGGTCAACTACCCGCGGCGGCATCATTGaccac < 2:1971212/150‑1 (MQ=255) gcgcTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAgg > 1:1344102/1‑116 (MQ=255) gcgcTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAgg < 2:1344102/116‑1 (MQ=255) gcTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCaa < 2:1820157/108‑1 (MQ=255) gcTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCaa > 1:1820157/1‑108 (MQ=255) gCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCg > 2:2024413/1‑150 (MQ=255) ttAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGTTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCgca < 1:2308547/150‑1 (MQ=255) ttAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCgca > 1:2381543/1‑150 (MQ=255) gCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTtgtg < 1:2349543/86‑1 (MQ=255) gCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTtgtg > 2:2349543/1‑86 (MQ=255) cTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGCCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGcc > 2:57681/1‑150 (MQ=255) tGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCg < 2:2254689/150‑1 (MQ=255) aTCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGAt < 1:227519/150‑1 (MQ=255) aTCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTACTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGAt < 1:563101/150‑1 (MQ=255) tCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCgggg < 1:1758071/114‑1 (MQ=255) tCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCgggg > 2:1758071/1‑114 (MQ=255) gcgcAGGGGGCATGGGCTGATTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGCGGGGCACACATCCGCGGGGGCATCATTGACCCCCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTg > 2:1271265/1‑150 (MQ=255) cgcAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGc > 2:1546388/1‑150 (MQ=255) cgcAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGAGGACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGTAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGc < 1:738606/150‑1 (MQ=255) ggCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCt > 2:875842/1‑150 (MQ=255) aTGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCgg < 1:2033181/150‑1 (MQ=255) tGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGt < 2:1205510/150‑1 (MQ=255) gCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCgg > 1:476303/1‑92 (MQ=255) gCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCgg < 2:476303/92‑1 (MQ=255) cTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCcgcg < 2:485212/90‑1 (MQ=255) cTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCcgcg > 1:485212/1‑90 (MQ=255) tttGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCAcc > 2:2140952/1‑150 (MQ=255) tttGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCAcc > 1:1412871/1‑150 (MQ=255) ttGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCgcag > 2:2181080/1‑115 (MQ=255) ttGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCgcag < 1:2181080/115‑1 (MQ=255) gTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCa > 1:1304778/1‑150 (MQ=255) tGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCAc > 2:2026511/1‑150 (MQ=255) aTTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCt > 2:743755/1‑150 (MQ=255) gtgCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCAc > 1:1288758/1‑150 (MQ=255) cTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTg > 1:51003/1‑150 (MQ=255) gtgtgtACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAGGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGcc > 2:1615215/1‑150 (MQ=255) tgtgtACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCt > 1:1691639/1‑150 (MQ=255) gtACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATcc < 1:1064362/117‑1 (MQ=255) gtACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATcc > 2:1064362/1‑117 (MQ=255) tACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTTCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCg > 1:192403/1‑150 (MQ=255) tACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCg < 1:684979/150‑1 (MQ=255) cGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAgg < 2:361735/43‑1 (MQ=255) cGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAgg > 1:361735/1‑43 (MQ=255) cTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGtt < 1:2024413/150‑1 (MQ=255) ttGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCtt < 1:801971/80‑1 (MQ=255) ttGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCtt > 2:801971/1‑80 (MQ=255) ggCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGACCCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTggg > 2:1669606/1‑150 (MQ=255) gCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGc < 2:2057608/150‑1 (MQ=255) aaCAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGATGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCgg < 2:2111472/150‑1 (MQ=255) aCAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCggg > 1:399421/1‑150 (MQ=255) cAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTg < 2:1979776/131‑1 (MQ=255) cAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTg > 1:1979776/1‑131 (MQ=255) aCCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGTTc < 1:743755/150‑1 (MQ=255) cTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTGAACGACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGAACGCCGAGCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGTTCTg > 1:804301/1‑150 (MQ=255) cccctgccTTGCGCAGCACAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGtt < 2:2095654/139‑1 (MQ=255) cccctgccTTGCGCAGCACAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGtt > 1:2095654/6‑144 (MQ=255) cccctgccTTGCGCAGCACAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGTTCTGCtt > 1:1803801/6‑150 (MQ=255) cccctgccTTGCGCAGCACAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGTTCTGCtt > 2:865944/6‑150 (MQ=255) gccgccTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGTCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGTTCTGCTtgt < 2:1738150/150‑1 (MQ=255) gccgccTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGTTCTGCTtgt < 1:875842/150‑1 (MQ=255) gccgccTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGTTCTGCTtgt < 1:57681/150‑1 (MQ=255) cTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTggg < 1:1920542/128‑1 (MQ=255) cTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTggg > 2:1920542/1‑128 (MQ=255) cTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTc > 1:4311/1‑150 (MQ=255) ttGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTcc < 1:2140952/150‑1 (MQ=255) ttGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTcc > 1:548913/1‑150 (MQ=255) ttGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTcc < 1:844842/150‑1 (MQ=255) | TGTCCAGGGTGGCGCTGGGGTTGGTCATAGGCTCCATGCAATTGACTCGGCGCTAAGGCTTAGGGGCTGATCATAGCGCAGGGGGCATGGGCTGTTTGGTGATTATGTGCTGTGTGTACGCTTGGCAACAGTGACCTGCAGCCGCCTTGTGCTGCGCAAGGCAGGGGGTCAACTACCCGCGGGGGCATCATTGACCACCTTGAACCGCAGCACGCCGATCACTTGCCCATCCTCGGTCAGCACCCTCACCTGCCACTTGCCTACCGGGTTGGGCGGGAAGTTCTGCTTGTGGGTCC > NC_002947/150913‑151208 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |