| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 1,291,468 | A→C | 10.2% | K85Q (AAG→CAG) | estC → | carboxylesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,291,468 | 0 | A | C | 10.2% | 288.2 / 20.3 | 105 | K85Q (AAG→CAG) | estC | carboxylesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (46/48); new base C (6/5); total (52/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.61e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
AGGTGGGTGGCGAAACCGTCGTTGACCTGTGGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCAGCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCTTGTATGACTGG > NC_002947/1291319‑1291617 | aGGTGGGTGGCGAAACCGTCGTTGACCTGTGGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCa > 1:1990/1‑150 (MQ=255) ggtggCGAAACCGTCGTTGACCTGTGGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTg < 1:1665999/150‑1 (MQ=255) gtggCGAAACCGTCGTTGACCTGTGGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCCAGCttg < 2:533214/150‑3 (MQ=255) gtggCGAAACCGTCGTTGACCTGTGGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTgg < 2:1328921/150‑1 (MQ=255) ataaCCGTCGTTGACCTGTGGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCAGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTc > 1:467807/3‑150 (MQ=255) aaCCGTCGTTGACCTGTGGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCCAGCTTGCCCTCgc < 2:2249985/150‑2 (MQ=255) ccGTCGTTGACCTGTGGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATg < 1:2044394/150‑1 (MQ=255) gtcgtTGACCTGTGGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGcc > 1:869646/1‑150 (MQ=255) gtTGACCTGTGGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGccc > 1:1415993/1‑139 (MQ=255) gtTGACCTGTGGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGccc < 2:1415993/139‑1 (MQ=255) gACCTGTGGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCCGTg < 2:48825/150‑1 (MQ=255) tgGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTg < 1:2306606/144‑1 (MQ=255) tgGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTg > 2:2306606/1‑144 (MQ=255) cGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGa > 2:4777/1‑129 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ggACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCa > 2:986295/1‑150 (MQ=255) ggCCAACAGGCGCGGCATAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTACTTCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGGCCTGCAGTTGGTCGGTAGGGGCAAGCTGGTGCTCGATGCCCCGGTTGCTAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCATGCg < 2:190736/150‑1 (MQ=255) ccAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCgca < 2:1453338/150‑3 (MQ=255) agcagGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTa > 1:2384402/1‑150 (MQ=255) agcagGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTa > 1:2135099/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCCAGCttg > 1:1935756/1‑93 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gCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAg < 1:1204685/119‑1 (MQ=255) gCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAg > 2:1204685/1‑119 (MQ=255) cGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTCCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCtt < 1:1706055/150‑1 (MQ=255) aTACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGc < 1:2319050/150‑1 (MQ=255) aCCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGt < 2:631311/150‑1 (MQ=255) cATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCCAGCt > 2:820699/1‑75 (MQ=255) 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ttGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGTCCCGGTGGCCTACTCCTAGCGCCCGCTGTCCCATTCGGTTATGGTGTTGGTGTCCGGGCTGCAGTTGGTCGGCTTCGGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGaa < 2:273594/150‑1 (MQ=255) ttGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCAGCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGaa < 1:2163137/150‑1 (MQ=255) tCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGc < 1:1921400/87‑1 (MQ=255) tCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGc > 2:1921400/1‑87 (MQ=255) tCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGc > 2:2140509/1‑87 (MQ=255) tCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGc < 1:2140509/87‑1 (MQ=255) tCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCAGCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCt > 1:42514/1‑150 (MQ=255) ggCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGCTTGCCTTGCGTCAGCGCCTCGGCCTCCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCTTg < 1:2101134/150‑1 (MQ=255) atcGAGGGCCAGCTTGCCCTCGATCCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCACCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCTTg > 1:1972725/3‑150 (MQ=255) tcGAGGGCCAGCTTGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCAGCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCTTGt > 1:77752/2‑150 (MQ=255) gCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCAGCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCTTGt < 1:1760326/150‑1 (MQ=255) cGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCGGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCAGCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCTTGTa < 1:1179463/150‑1 (MQ=255) gAGGGCCAGCTTGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCAGCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCTTGTAt > 2:736386/1‑150 (MQ=255) gggCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCAGCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCTTGTATGa > 2:1888894/1‑150 (MQ=255) gCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCAGCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCTTGTATGACt < 2:1571814/150‑1 (MQ=255) cAAGCTTGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCAGCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCTTGTATGACTg < 2:1117892/150‑1 (MQ=255) cAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCAGCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCTTGTATGACTg < 2:2277186/150‑1 (MQ=255) aaGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCAGCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCTTGTATGACTgg > 2:581365/1‑150 (MQ=255) | AGGTGGGTGGCGAAACCGTCGTTGACCTGTGGGCCGGCAGTGCCGACAAGGACGGCCAGCAGGCCTGGCACAGCGATACCATCGCCAACCTGTTCTCCTGCACCAAGACCTTCGCGGCCGTTACCGCCCTGCAGTTGGTCGGCGAGGGCAAGCTGGCCCTCGATGCCCCGGTGGCCAACTACTGGCCCGAGTTCGCCCAGGCGGGTAAGCAGTCGATCACCTTGCGTCAGCTGCTCAGCCACCGTGCCGGCTTGCCGGCCATTCGTGAGCTGCTGCCGGCTGAAGCCTTGTATGACTGG > NC_002947/1291319‑1291617 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |