Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,337,043 | T→G | 6.4% | L137R (CTC→CGC) ‡ | gstA → | glutathione S‑transferase GstA |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,337,043 | 0 | T | G | 6.4% | 222.5 / 7.3 | 78 | L137R (CTC→CGC) ‡ | gstA | glutathione S‑transferase GstA |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/40); new base G (2/3); total (35/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.27e-01 |
CGAAGAACCTGCCGCCGCCGCCCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCGCTGGAGCCCTATGCCAATGTGCGCAACTG > NC_002947/1336894‑1337187 | cGAAGAACCTGCCGCCGCCGCCCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCt < 2:97223/150‑1 (MQ=255) agaaCCTGCCGCCGCCGCCCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCaa < 1:589072/150‑1 (MQ=255) agaaCCTGCCGCCGCCGCCCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCaa < 1:2216740/150‑1 (MQ=255) gaaCCTGCCGCCGCCGCCCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAg < 2:253762/150‑1 (MQ=255) aaCCTGCCGCCGCCGCCCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAgg < 2:2396768/150‑1 (MQ=255) aCCTGCCGCCGCCGCCCGGGTGCAACGCTGGCTATCGATTGCCGCAGGCCGAACAACCTTTGGCCCGGCAGCCTCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGGGATTTCCCGCGCCCACACCTTGAGCAAGGt > 1:420783/1‑150 (MQ=255) ccTGCCGCCGCCGCCCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTg > 1:935870/1‑150 (MQ=255) cTGCCGCCGCCGCCCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGa < 1:1105975/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCGCCGCCCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGAt < 2:1926529/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCGCCGCCCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGAGCAAGGTgtg < 2:420783/150‑3 (MQ=255) gccgccgccgccCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATc < 1:589562/150‑1 (MQ=255) gccgccgccgccCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATc < 1:2143255/150‑1 (MQ=255) gccgccgccgccCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGAGCAAGGTgtgg < 2:1240686/150‑4 (MQ=255) gccgccgccCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGAt < 2:1855208/150‑1 (MQ=255) ccGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGAGCAAGGTgtg > 1:2281365/1‑136 (MQ=255) ccGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGAGCAAGGTgtg < 2:2281365/138‑3 (MQ=255) gCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATc < 2:725878/128‑1 (MQ=255) gCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATc > 1:725878/1‑128 (MQ=255) cTGGCAATCGGCCAACGCAGGGCCGCTGGGCAACAGCCCGGCGGCCGCTCCCCTTGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAACACCCACAAATTGACTTCCCGCGCCCACCCCTTGCTCGAGGTCATCGATGCCCGGTTGACCAATACGcc > 2:280554/1‑150 (MQ=255) gCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCAtt > 1:826650/1‑150 (MQ=255) cTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTc < 2:826650/150‑1 (MQ=255) cTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTc < 1:2133801/150‑1 (MQ=255) tATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAg > 2:2380383/1‑116 (MQ=255) tATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAg < 1:2380383/116‑1 (MQ=255) tATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTcc > 2:2242206/1‑150 (MQ=255) gggccaaaGGCCAGCGGGCCTGCGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACgg > 1:857488/8‑150 (MQ=255) cgccgcAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACggg < 1:2186979/150‑1 (MQ=255) gccgcAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGgc > 2:412492/1‑150 (MQ=255) gccgcAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGgc > 1:1345505/1‑150 (MQ=255) gccaaaGGCCAGCGGGCCTGCGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGgc > 2:187898/6‑150 (MQ=255) ccgcAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAgg < 2:1947407/108‑1 (MQ=255) ccgcAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAgg > 1:1947407/1‑108 (MQ=255) aGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGcac < 1:412492/150‑1 (MQ=255) gCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCacac < 2:2369308/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTCCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCCcaccc > 1:623723/1‑150 (MQ=255) cTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGc > 1:2144132/1‑150 (MQ=255) tGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGCTGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGa < 2:941973/150‑1 (MQ=255) tGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGa < 2:911342/150‑1 (MQ=255) cggCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGa < 2:857488/149‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGt < 1:913653/88‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGt > 2:913653/1‑88 (MQ=255) gCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAactac > 2:2409009/1‑150 (MQ=255) gCTCCCTTGGTCACGGTGTCCGGGGCTTCGTCCAATACCGCCGAAGTAATTTCCCGCGCCAACCCCTTGCTAAAGGTGATCGATGCCAAGTTGGCCAATCCGCCATTCCTGCCGGGAAGCACA‑CCACCATAGCGGACATTGCCAactact < 1:490761/150‑1 (MQ=255) tCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTc < 1:187898/150‑1 (MQ=255) cTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTAc < 2:1474359/150‑1 (MQ=255) tCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAACACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCg > 1:101068/1‑150 (MQ=255) ggTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCa > 1:2199824/1‑150 (MQ=255) ttCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGcc > 2:496912/1‑150 (MQ=255) tCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGccc < 2:2087991/150‑1 (MQ=255) ggCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGa > 1:586970/1‑150 (MQ=255) gCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGaa > 2:446427/1‑150 (MQ=255) gTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCAACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCaa > 2:1405860/1‑150 (MQ=255) ttCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAAc > 1:1683263/1‑150 (MQ=255) aaTACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGc < 2:758875/128‑1 (MQ=255) aaTACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGc > 1:758875/1‑128 (MQ=255) aTACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAg > 2:1610052/1‑41 (MQ=255) aTACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAg < 1:1610052/41‑1 (MQ=255) tACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTc < 1:496912/150‑1 (MQ=255) aGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCaa < 2:357902/135‑1 (MQ=255) aGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCaa > 1:357902/1‑135 (MQ=255) aGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCGCTGGAGcc < 2:724944/150‑1 (MQ=255) ttCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCGCTGGAGCCCTATGc < 2:1345505/150‑1 (MQ=255) cccGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCAcacccac > 1:631471/1‑76 (MQ=255) cccGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCAcacccac < 2:631471/76‑1 (MQ=255) cccGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCGCTGGAGCCCTATGCCa < 1:2409009/150‑1 (MQ=255) ccGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAACGGACATTGCCAACTACACGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCGCTGGCGCCCTCTGCCaa > 2:388001/1‑150 (MQ=255) cgcgCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCGCTGGAGCCCTATGCCAAt < 1:446427/150‑1 (MQ=255) cgcgCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCAACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCGCTGGAGCCCTATGCCAAt < 1:1405860/150‑1 (MQ=255) gcgcCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTc > 1:1427296/1‑108 (MQ=255) gcgcCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTc < 2:1427296/108‑1 (MQ=255) cccACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCGCTGGAGCCCTATGCCAATGTgc < 1:2242206/150‑1 (MQ=255) acacCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCg < 1:333660/125‑1 (MQ=255) acacCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCg > 2:333660/1‑125 (MQ=255) cacCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGAAACGAAGAAGTACTCGTACATCGCTCACGCCAACGAAGGCAACGTGAAGCTGGAGCCCGATGCCAATGTGCGCaa > 1:2223241/1‑150 (MQ=255) acCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCGCTGGAGCCCTATGCCAATGTGCGCAAc > 2:472976/1‑150 (MQ=255) cTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTAc > 1:1388063/1‑91 (MQ=255) cTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTAc < 2:1388063/91‑1 (MQ=255) cTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCGCTGGAGCCCTATGCCAATGTGCGCAActg > 1:31298/1‑150 (MQ=255) cTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCGCTGGAGCCCTATGCCAATGTGCGCAActg < 1:472976/150‑1 (MQ=255) | CGAAGAACCTGCCGCCGCCGCCCGGGTGCAACGCTGGCTATCGGTCGCCGCAGGCCCGCTGGCCTTTGGCCCGGCAGCCGCTCGCCTGGTCACGGTGTTCGGGGCTTCGTTCAATACCGACGAAGTGATTTCCCGCGCCCACACCTTGCTCAAGGTGATCGATGCCGAGTTGGCCAATACGCCATTCCTGACGGGCAGCACACCCACCATAGCGGACATTGCCAACTACTCGTACATCGCTCACGCCCCCGAAGGCAACGTGTCGCTGGAGCCCTATGCCAATGTGCGCAACTG > NC_002947/1336894‑1337187 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |