| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,345,459 | G→C | 7.1% | A204G (GCC→GGC) | gnl ← | gluconolactonase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,345,459 | 0 | G | C | 7.1% | 267.8 / 8.4 | 84 | A204G (GCC→GGC) | gnl | gluconolactonase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/43); new base C (3/3); total (38/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
GTCCAGGCTGGCGCCGCCAAAGGCGCACATTGCCGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGCCGTCGGGGCTG > NC_002947/1345311‑1345608 | gTCCAGGCTGGCGCCGCCAAAGGCGCACATTGCCGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATggcggc < 1:34162/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGCCGCCAAAGGCGCACATTGCCGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAAGCGTCCTGGTCGATGGCGGCGcc > 2:1651036/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCCGCCAAAGGCGCACATTGCCGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGCCGCCATcg < 2:87866/150‑2 (MQ=255) ggCGCCGCCAAAGGCGCACATTGCCGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCgg < 2:1818559/150‑1 (MQ=255) gcgcCGCCAAAGGCGCACATTGCCGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCggg > 1:1420328/1‑150 (MQ=255) ccAAAGGCGCACATTGCCGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCg < 1:2396117/150‑1 (MQ=255) cAAAGGCGCACATTGCCGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCgg < 1:179607/150‑1 (MQ=255) aaaGGCGCACATTGCCGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCggg < 2:1786437/150‑1 (MQ=255) aaaGGCGCACATTGCCGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCggg < 1:1763453/150‑1 (MQ=255) aaaGGCGCACATTGCCGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCggg < 1:1763961/150‑1 (MQ=255) ccGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGt < 1:456459/150‑1 (MQ=255) ccGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGt > 2:730424/1‑150 (MQ=255) cGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTc < 1:2238927/150‑1 (MQ=255) cGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTCGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGTCCGGGGTAGTTGCGCATGTc > 2:1139425/1‑150 (MQ=255) ggCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTcg > 2:1491678/1‑150 (MQ=255) gCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTcga < 2:1678893/150‑1 (MQ=255) gCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGAAGCACAAGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTcga > 1:760067/1‑150 (MQ=255) cTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGCCCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTcgac < 1:1935640/150‑1 (MQ=255) cTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTcgac < 1:1519982/150‑1 (MQ=255) tttCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGaa < 2:1963659/150‑1 (MQ=255) ttCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAAc < 1:1698555/150‑1 (MQ=255) cACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAg < 1:1076973/150‑1 (MQ=255) cACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAg > 1:1690060/1‑150 (MQ=255) gCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTgc < 2:99443/125‑1 (MQ=255) gCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTgc > 1:99443/1‑125 (MQ=255) gCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTGGACCTATAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTTGACGAACAGGTGCTTGcc > 1:1872259/1‑150 (MQ=255) tGAGTGATCGTTCGAGGCTACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGCTCTGCCCGGCTTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCGGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCTACGAACAGGTGCTTGCCGt < 2:303432/150‑1 (MQ=255) tGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGt > 1:1720308/1‑150 (MQ=255) gAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTg < 1:2387567/150‑1 (MQ=255) tCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCg > 1:1869906/1‑106 (MQ=255) tCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCg < 2:1869906/106‑1 (MQ=255) ggTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATc < 1:1811964/94‑1 (MQ=255) ggTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATc > 2:1811964/1‑94 (MQ=255) gTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGcc > 2:315266/1‑150 (MQ=255) tCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCg > 2:445763/1‑150 (MQ=255) aGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTg > 1:1286121/1‑150 (MQ=255) aGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTg > 2:144213/1‑150 (MQ=255) ggCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGt > 1:317272/1‑150 (MQ=255) gACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCtt < 1:337266/127‑1 (MQ=255) gACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCtt > 2:337266/1‑127 (MQ=255) cTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGgtgt > 1:230181/1‑150 (MQ=255) cTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGgtgt > 2:1319389/1‑150 (MQ=255) ttCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAgg < 2:1674009/118‑1 (MQ=255) ttCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAgg > 1:1674009/1‑118 (MQ=255) gggggTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTa > 1:1184098/1‑150 (MQ=255) ggggTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCgg < 1:433474/142‑1 (MQ=255) ggggTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCgg > 2:433474/1‑142 (MQ=255) gggTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTAGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGGGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGt < 2:1817376/150‑1 (MQ=255) aaaCGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGaaa < 1:1319389/150‑1 (MQ=255) aaCGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTTCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTc < 2:504177/145‑1 (MQ=255) aaCGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTTCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTc > 1:504177/1‑145 (MQ=255) gTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGgt > 1:2119715/1‑132 (MQ=255) gTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGgt < 2:2119715/132‑1 (MQ=255) tCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCt > 1:954558/1‑150 (MQ=255) cTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCtt < 1:1491678/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCt > 2:1454600/1‑150 (MQ=255) tcgtTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTc < 1:315266/150‑1 (MQ=255) ttGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCggg > 1:1733788/1‑150 (MQ=255) tGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGt < 1:801342/150‑1 (MQ=255) gCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGa < 1:1715780/150‑1 (MQ=255) aGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGt < 1:2165584/150‑1 (MQ=255) cAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGAc < 1:1606589/150‑1 (MQ=255) aGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACa < 2:2406279/150‑1 (MQ=255) tAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTg > 2:815342/1‑80 (MQ=255) tAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTg < 1:815342/80‑1 (MQ=255) gcCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGACGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGCGTGCAAGGCGGAGAGGTACAt > 2:311040/1‑150 (MQ=255) tCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATgcgc < 1:1454600/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGt > 1:363555/1‑140 (MQ=255) cTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGt < 2:363555/140‑1 (MQ=255) tGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTg < 1:144213/150‑1 (MQ=255) cccggATGGCGCCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGc > 1:856517/5‑150 (MQ=255) gTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGTGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGcc < 2:954558/150‑1 (MQ=255) ccggATGGTGCCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACAt > 2:1156294/4‑141 (MQ=255) ccggATGGTGCCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGCCGGACAGGTACAt < 1:1156294/138‑1 (MQ=255) ccggATGGCGCCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGcc > 2:2408583/4‑150 (MQ=255) cGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGCCGt > 2:514253/1‑150 (MQ=255) gATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCg < 1:1002648/73‑1 (MQ=255) gATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCg > 2:1002648/1‑73 (MQ=255) gATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGCCGTc > 1:2207289/1‑150 (MQ=255) aTGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGtgtg > 1:1950644/1‑69 (MQ=255) aTGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGtgtg < 2:1950644/69‑1 (MQ=255) aTGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGCCGTCg < 2:1286121/150‑1 (MQ=255) aTGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGCCGTCg < 2:1690060/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGCCGTCgg < 2:1371107/150‑1 (MQ=255) tGGCGCCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGCCGTCgg < 1:2408583/150‑1 (MQ=255) gcggcgGCATCCGGGCGGGGGGGGTGGTTGCGCAGGTGGGCGAAGCGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGCCGTCgggg < 2:760067/150‑1 (MQ=255) gcggcgCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGCCGTCgggg > 1:441223/1‑150 (MQ=255) ggcgCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCa < 1:330239/93‑1 (MQ=255) ggcgCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCa > 2:330239/1‑93 (MQ=255) gcgcCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGCCGTCGGGGCTg > 1:1675885/1‑150 (MQ=255) | GTCCAGGCTGGCGCCGCCAAAGGCGCACATTGCCGGCTTTTTCACCGGCACGCTGAGTGATCGGTCGAGGCGACCTTCGGGGGTAAAACGGTGGATCTGCCCGGCGTCGTTGCCGCAGATCCAGTAGCAGCCGTCCTGGTCGATGGCGGCGCCATCCGGGCGGCCGGGGTAGTTGCGCATGTCGACGAACAGGTGCTTGCCGTGCGGTGTGCCGCTGTCGGTGTCGTAGTCGAAAGCCCATACCTTCTGCACGTTCGGGTGCGAGTCGGACAGGTACATGCGCTTGCCGTCGGGGCTG > NC_002947/1345311‑1345608 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |