Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_002947 | 1,354,159 | 0 | A | T | 7.0% | 318.7 / 9.3 | 98 | P408P (CCT→CCA) | nrdA | ribonucleoside‑diphosphate reductase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/43); new base T (5/2); total (53/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.47e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
CCAGGTTTCCAGGTAGGCACATACAGCGCCTTTGCGCTTGCCACCCTGGTTGACCGCAACGGCGGTGTCGTTGACCACTTTCAGGAACGGTACGACGCCCTGCGACTTGCCGTTGGTGCCCTTGATGTAAGAGCCCAGTGCGCGCACAGGGGTCCAGT‑CGTTGCCCAGGCCACCGGCGAATTTCGACAGCATGGCGTTGTCGTGGATCGCGTGGTAGATGCCCGACAGGTCGTCCGGCACGGTGGTCAGGTAGCAGCTGGACAGCTGCGGGCGCAGGGTGCCGGCGTTGAACAGG > NC_002947/1354012‑1354306 | ccAGGTTTCCAGGTAGGCACATACAGCGCCTTTGCGCTTGCCACCCTGGTTGACCGCAACGGCGGTGTCGTTGACCACTTTCAGGAACGGTACGACGCCCTGCGACTTGCCGTTGGTGCCCTTGATGTAAGAGCCCAGTGCGCGCACAgg > 1:1639748/1‑150 (MQ=255) cAGGTTTCCAGGTAGGCACATACAGCGCCTTTGCGCTTGCCACCCTGGTTGACCGCAACGGCGGTGTCGTTGACCACTTTCAGGAACGGTACGACGCCCTGCGACTTGCCGTTGGTGCCCTTTATGTAAGAGCCCAGTGCGCACACAggg > 2:150280/1‑150 (MQ=255) aGGTTTCCAGGTAGGCACATACAGCGCCTTTGCGCTTGCCACCCTGGTTGACCGCAACGGCGGTGTCGTTGACCACTTTCAGGAACGGTACGACGCCCTGCGACTTGCCGTTGGTGCCCTTGATGTAAGAGCCCAGTGCGCGCACAg < 2:959532/147‑1 (MQ=255) 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aTACAGCGCCTTTGCGCTTGCCACCCTGGTTGACCGCAACGGCGGTGTCGTTGACCACTTTCAGGAACGGTACGACGCCCTGCGACTTGCCGTTGGTGCCCTTGATGTAAGAGCCCAGTGCGCGCACAGGGGTCCAGT‑c < 2:1849557/139‑1 (MQ=255) cAGCGCCTTTGCGCTTGCCACCCTGGTTGACCGCAACGGCGGTGTCGTTGACCACTTTCAGGAACGGTACGACGCCCTGCGACTTGCCGTTGGTGCCCTTGATGTAAGAGCCCAGTGCGCGCACAGGGGTCCAGT‑CGTTGCCCAGGCCAc > 2:2074089/1‑150 (MQ=255) gcgcCTTTGCGCTTGCCACCCTGGTTGACCGCAACGGCGGTGTCGTTGACCACTTTCAGGAACGGTACGACGCCCTGCGACTTGCCGTTGGTGCCCTTGATGTAAGAGCCCAGTGCGCGCACAGGGGTCCAGT‑CGTTGCCCAGGCCACCg > 2:423394/1‑150 (MQ=255) gcTTGCCACCCTGGTTGACCGCAACGGCGGTGTCGTTGACCACTTTCAGGAACGGTACGACGCCCTGCGACTTGCCGTTGGTGCCCTTGATGTAAGAGCCCAGTGCGCGCACAGGGGTCCAGT‑CGTTGCCCAGGCCACCGGCGAATTTCg > 2:938714/1‑150 (MQ=255) cTTGCCACCCTGGTTGACCGCAACGGCGGTGTCGTTGACCACTTTCAGGAACGGTACGACGCCCTGCGACTTGCCGTTGGTGCCCTTGATGTAAGAGCCCCGTCCGCCCACAGGGGTCCAGT‑CGTTGCCCAGGCCACCGGCGAATTTCGa < 1:1161643/150‑1 (MQ=255) 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1:2136937/122‑1 (MQ=255) cccTGTGCGCGCACTGGGGTCCAGT‑CGTTGCCCAGGCCACCGGCGAATTTCGACAGCATGGCGTTGTCGTGGATCGCGTGGTAGATGCCCGACAGGTCGTCCGGCACGGTGGTCAGGTagca > 2:2136937/1‑122 (MQ=255) cccAGTGCGCGCACAGGGGTCCAGT‑CGTTGCCCAGGCCACCGGCGAATTTCGACAGCATGGCGTTGTCGTGGATCGCGTGGTAGATGCCCGACAGGTCGTCCGGCACGGTGGTCAGGTAGCAGCTGGACAGCTGCGGGCGCAGGGTGCCg > 1:398656/1‑150 (MQ=255) ccAGTGCGCGCACAGGGGTCCAGT‑CGTTGCCCAGGCCACCGGCGAATTTCGACAGCATGGCGTTGTCGTGGATCGCGTGGTAGATGCCCGACAGGTCGTCCGGCACGGTGGTCAGGTAGCAGCTGGACAGCTGCGGGCGCAGGGTGCCgg > 2:2256878/1‑150 (MQ=255) caacttgcgcAGATGGGTCCAGT‑CGTTGCCCAGGCCACCGGCGAATTTCGACAGCATGGCGTTGTCGTGGATCGCGTGGTAGATGCCCGACAGGTCGTCCGGCACGGTGGTCAGGTAGCAGCTGGACAGCTGCGGGCGCAGGGTGCCGGc > 2:1200708/7‑150 (MQ=255) gcgcACAGGGGTCCAGT‑CGTTGCCCAGGCCACCGGCGAATTTCGACAGCATGGCGTTGTCGTGGATCGCGTGGTAGATGCCCGACAGGTCGTCCGGCACGGTGGTCAGGTAGCAGCTGGACAGCTGCGGGCGCAGGGTGCCGGCGTTGaa < 1:2256878/150‑1 (MQ=255) 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CCAGGTTTCCAGGTAGGCACATACAGCGCCTTTGCGCTTGCCACCCTGGTTGACCGCAACGGCGGTGTCGTTGACCACTTTCAGGAACGGTACGACGCCCTGCGACTTGCCGTTGGTGCCCTTGATGTAAGAGCCCAGTGCGCGCACAGGGGTCCAGT‑CGTTGCCCAGGCCACCGGCGAATTTCGACAGCATGGCGTTGTCGTGGATCGCGTGGTAGATGCCCGACAGGTCGTCCGGCACGGTGGTCAGGTAGCAGCTGGACAGCTGCGGGCGCAGGGTGCCGGCGTTGAACAGG > NC_002947/1354012‑1354306 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |