| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,416,868 | G→A | 9.6% | R37Q (CGG→CAG) | PP_1239 → | metallo‑beta‑lactamase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,416,868 | 0 | G | A | 9.6% | 275.0 / 15.1 | 102 | R37Q (CGG→CAG) | PP_1239 | metallo‑beta‑lactamase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (50/42); new base A (5/5); total (55/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CCGCCGCGTGCTGAGCGCTATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTGCGCGGCAT > NC_002947/1416719‑1417015 | ccgccgCGTGCTGAGCGCTATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAgcg < 1:366211/150‑1 (MQ=255)ccgccgCGTGCTGAGCGCTATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAgcg < 1:123032/150‑1 (MQ=255) gccgcGTGCTGAGCGCTATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAgcggc < 2:49486/150‑1 (MQ=255) gccgcGTGCTGAGCGCTATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAgcggc < 2:537124/150‑1 (MQ=255) cgTGCTGAGTGCTATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCt < 1:2348454/150‑1 (MQ=255) gcTATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGCACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTc < 1:21425/150‑1 (MQ=255) cTATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCAGCGCCAGGCGCCGCTc > 2:159684/1‑149 (MQ=255) cTATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCAGCGCCAGGCGCCGCTc < 1:159684/149‑1 (MQ=255) tATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGTGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCgg < 2:1483658/150‑1 (MQ=255) tATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCgg < 1:1339412/150‑1 (MQ=255) tATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCgg < 1:950510/150‑1 (MQ=255) tATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCgg > 1:619926/1‑150 (MQ=255) aTTCAGGACCCCCTCGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCACAGCGACAGGGTCACCGATCTTCAGTGATGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCggg < 1:2350605/150‑1 (MQ=255) aTTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCggg < 2:619926/150‑1 (MQ=255) aTTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCGTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCggg < 2:1437733/150‑1 (MQ=255) aGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGttt < 2:1154368/150‑1 (MQ=255) ggACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGACGACCAGGGAACGGTACGGTGATGGCCAGTTTTGTCACGTTCATCCTTGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTc < 2:1476771/150‑1 (MQ=255) gACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCt > 2:761717/1‑150 (MQ=255) accaccTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTg < 1:1003755/150‑1 (MQ=255) cTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGcagct > 1:30584/1‑150 (MQ=255) cTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGcagct > 2:364148/1‑150 (MQ=255) tAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCggg > 2:2026065/1‑132 (MQ=255) gTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTcagt > 1:553010/1‑150 (MQ=255) gcgcTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCAGCGCCAGGCgccgct < 2:2124607/123‑1 (MQ=255) gcgcTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCAGCGCCAGGCgccgct > 1:2124607/1‑123 (MQ=255) cgcTTCGCGGTATTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTcagtgca < 1:18534/150‑1 (MQ=255) gcTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTcagtgcag > 1:994515/1‑150 (MQ=255) gcTCCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATACCTATGGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTcagtgcag < 1:1352885/150‑1 (MQ=255) gcgGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTg < 1:364148/150‑1 (MQ=255) agaCTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTc > 2:1298533/3‑150 (MQ=255) tACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCa > 1:131287/1‑150 (MQ=255) cTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑cc < 2:813225/150‑1 (MQ=255) cGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACa > 1:1599600/1‑150 (MQ=255) ggCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACAt > 1:1105166/1‑150 (MQ=255) gCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGcagctca < 1:1583957/118‑1 (MQ=255) gCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGcagctca > 2:1583957/1‑118 (MQ=255) gCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCg > 2:1883345/1‑150 (MQ=255) ccAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTcagtgca > 2:1273133/1‑124 (MQ=255) ccAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTcagtgca < 1:1273133/124‑1 (MQ=255) aGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGCTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCCGCTTTCACCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCAGGGATCCTGCAGCCCAGCTCCGTTCAGTGCTGGTCA‑CCGCCGAACATTTCGAcaa > 2:198099/1‑148 (MQ=255) ggCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGTGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCAt < 1:992717/150‑1 (MQ=255) ggCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCAt > 2:2056828/1‑150 (MQ=255) ggCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCAt > 2:987433/1‑150 (MQ=255) aaCGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGTATAAGGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATgg < 1:761717/149‑1 (MQ=255) aCGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATggg < 1:198099/150‑1 (MQ=255) gCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGCTTGGGGGCTTTCGTTTGTTGAAACCGAGCGGCGCCGGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGt > 1:1023482/1‑150 (MQ=255) tGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCg > 2:1539640/1‑150 (MQ=255) aTCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGc > 1:512322/1‑150 (MQ=255) tCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCt < 2:553010/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTg > 1:1605526/1‑150 (MQ=255) gCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGAAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTg > 1:2110091/1‑150 (MQ=255) ccAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGaa < 1:1054246/119‑1 (MQ=255) cAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCt < 2:1053227/150‑1 (MQ=255) tggtgACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCTTGCGTAAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGATCAGTGCAGTTCTGGTCA‑CCCACGAACAAGCCGACCCCATGCACGTGGTCGGCATgttcgt < 2:669753/150‑6 (MQ=255) gTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTa > 1:330468/1‑150 (MQ=255) ttCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTAc < 1:1883345/150‑1 (MQ=255) aTCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTa > 2:1954679/1‑146 (MQ=255) aTCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGAGCCTGGTGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTa < 1:1954679/146‑1 (MQ=255) tCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATg > 2:1639841/1‑150 (MQ=255) cTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTCCGTTCACGGGGCTTCAATGTa < 2:1792498/150‑1 (MQ=255) tGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTa < 1:1688409/149‑1 (MQ=255) tGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTa > 2:1688702/1‑149 (MQ=255) tGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTa > 2:1688409/1‑149 (MQ=255) tGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTa < 1:1688702/149‑1 (MQ=255) gTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCg > 1:1417078/1‑150 (MQ=255) gTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCg > 1:617311/1‑150 (MQ=255) tCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCgg < 1:1606523/150‑1 (MQ=255) gATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTc > 2:1702259/1‑150 (MQ=255) tGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTAc < 2:617311/150‑1 (MQ=255) cGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTcagtgc > 2:1381903/1‑69 (MQ=255) cGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTcagtgc < 1:1381903/69‑1 (MQ=255) cGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGcc < 2:2371974/94‑1 (MQ=255) cGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGcc > 1:2371974/1‑94 (MQ=255) gCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTTCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCa > 1:1999449/1‑150 (MQ=255) gCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTAGGATTGCTGTCATGGCGCAACCATTGAGCAGTCGACCTCa > 2:1123506/1‑150 (MQ=255) cTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTTCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAg > 1:1410228/1‑150 (MQ=255) cTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGcc < 1:709549/91‑1 (MQ=255) cTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGcc < 1:917273/91‑1 (MQ=255) cTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGcc > 2:709549/1‑91 (MQ=255) cTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGcc > 2:917273/1‑91 (MQ=255) ttttCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGc > 1:358370/1‑150 (MQ=255) ccTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATggg > 1:562173/1‑100 (MQ=255) ccTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATggg < 2:562173/100‑1 (MQ=255) cTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCACCCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAgg > 1:1043548/1‑150 (MQ=255) cTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAggg > 1:788626/1‑150 (MQ=255) cTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAggg > 1:563307/1‑150 (MQ=255) tGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGa < 1:987433/150‑1 (MQ=255) tGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGgc > 1:1603770/1‑113 (MQ=255) tGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGgc < 2:1603770/113‑1 (MQ=255) ccccGAGCAGCGCCAGGCGCCGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTgcg > 2:1202986/3‑150 (MQ=255) cccGAGCAGCGCCAGGCGCCGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCtt < 1:334002/97‑1 (MQ=39) aCCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCAt > 1:1071464/1‑87 (MQ=255) aCCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCAt < 2:1071464/87‑1 (MQ=255) aCCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATgggg < 2:169694/91‑1 (MQ=255) aCCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATgggg > 1:169694/1‑91 (MQ=255) cGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTGCGCgg > 1:742742/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGCGCCAGGCGCCGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGa < 2:2090629/75‑1 (MQ=38) cGAGCAGCGCCAGGCGCCGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGa > 1:2090629/1‑75 (MQ=38) gAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTGCGCGGc > 2:58632/1‑150 (MQ=255) gcggcgCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTGCGCGGCAt > 1:1392062/1‑150 (MQ=255) | CCGCCGCGTGCTGAGCGCTATTCAGGACCACCTGGGCTAAGTGCGCTTCGCGGTACTCGGAAGCGGCAGCCAAGGGAACGGCACGCTGATCGCCAGTGGTGACACGTTCATCCTGGTCGATTGCGGCTTTTCCCTGCGTGAAACCGAGCGGCGCCTGGCGCTGCTCGGGGTTTCTGCAGCTCAGCTCAGTGCAGTGCTGGTCA‑CCCACGAACATGCCGACCACGTGCATGGGGTCGGCTTGCTGTCACGGCGCTACAATGTACCGGTCTACCTCAGCCAAGGGACTTTGCGCGGCAT > NC_002947/1416719‑1417015 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |