| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 164,466 | C→G | 8.7% | G331R (GGC→CGC) | pntB ← | pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 164,466 | 0 | C | G | 8.7% | 330.6 / 16.0 | 108 | G331R (GGC→CGC) | pntB | pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (53/45); new base G (7/3); total (60/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
TTCAGCCTCGGCCAGCAGTACGTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGAAGCCGCCAAGGATGACGTTGA > NC_002947/164323‑164615 | ttCAGCCTCGGCCAGCAGTACGTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGACCGTAGcc > 2:2067664/1‑150 (MQ=255)ttCAGCCTCGGCCAGCAGTACGTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGAGGGCTACGGCCTGGCGGTAGcc > 1:125381/1‑150 (MQ=255) tCAGCCTCGGCCAGCAGTACGTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACGGCCTGGCGGTAGccc < 2:1927373/150‑1 (MQ=255) tCAGCCTCGGCCAGCAGTACGTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACGGCCTGGCGGTAGccc < 2:125381/150‑1 (MQ=255) tCAGCCTCGGCCAGCAGTACGTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGccc < 2:1491709/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCCAGCAGTACGTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGaa < 1:1890602/150‑1 (MQ=255) ccTCGGCCAGCAGTACGTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGaa > 2:1890602/1‑150 (MQ=255) cagTACGTTCATGTTCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCATGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCAc < 2:174423/150‑1 (MQ=255) cagTACGTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCAc < 2:2270302/150‑1 (MQ=255) agTACGTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACg > 2:1272600/1‑150 (MQ=255) gTACGTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGc > 2:728062/1‑150 (MQ=255) gTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTc > 2:2196522/1‑150 (MQ=255) gTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTGGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTCCCGCCAGTCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTc > 2:541399/1‑150 (MQ=255) aTGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCg > 2:1682088/1‑150 (MQ=255) gtgCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGtt > 1:1724092/1‑150 (MQ=255) gtgCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGGGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGtt < 1:429401/150‑1 (MQ=255) cccGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCt < 1:348651/150‑1 (MQ=255) cGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGa < 2:32183/150‑1 (MQ=255) gCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCATTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCt < 1:283433/133‑1 (MQ=255) gCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCATTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCt > 2:283433/1‑133 (MQ=255) aTACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCAGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAgg > 1:2283741/1‑150 (MQ=255) cGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAg < 1:470584/150‑1 (MQ=255) ggCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGCCACTCCGATGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTATTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAgg > 1:1398664/1‑150 (MQ=255) cccGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTg < 2:1995626/150‑1 (MQ=255) cccGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTg < 1:1272600/150‑1 (MQ=255) cccGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCAGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTg < 2:2283741/150‑1 (MQ=255) cccGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGGGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGCTGACCACGCTGAAAAAACTGCTGAGCAGGAAGGTg > 1:1329974/1‑150 (MQ=255) cGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGc > 1:2062826/1‑150 (MQ=255) gCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGc > 1:357285/1‑149 (MQ=255) gCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGc < 2:357285/149‑1 (MQ=255) catcgtgTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATc < 2:1167981/144‑1 (MQ=255) cACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATc < 2:1075118/150‑1 (MQ=255) aCCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCGACCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCg > 1:1642707/1‑150 (MQ=255) ggTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAg < 2:2252973/150‑1 (MQ=255) gTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTc > 2:2345970/1‑117 (MQ=255) gTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTc < 1:2345970/117‑1 (MQ=255) aTCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGaa > 1:807786/1‑150 (MQ=255) tCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAAc > 1:256271/1‑150 (MQ=255) tCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTATTGCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAAc < 2:1642707/150‑1 (MQ=255) gCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGc > 2:574129/1‑113 (MQ=255) gCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGc < 1:574129/113‑1 (MQ=255) cATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTTCCTGGAGGCGGTAGTCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCGGAGCAGGAAGGTGTGATCGTCAGCCGAACCgg > 1:899811/1‑150 (MQ=255) aTACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGa < 1:2092916/150‑1 (MQ=255) aTACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGa < 1:1682088/150‑1 (MQ=255) tACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGAc < 1:1781874/150‑1 (MQ=255) ttCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTc > 1:440643/1‑150 (MQ=255) ttCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTc > 1:1503806/1‑150 (MQ=255) ggTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTg < 1:1547080/121‑1 (MQ=255) gTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGc > 2:860887/1‑150 (MQ=255) tCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGcc > 1:857777/1‑150 (MQ=255) tCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGcc > 1:1690917/1‑150 (MQ=255) cACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCg < 2:1690917/150‑1 (MQ=255) gCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTg > 1:818139/1‑150 (MQ=255) ccGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGt > 2:1535921/1‑150 (MQ=255) tgtgGGTCAGTTTCTCGGTCACCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCtt < 1:125015/150‑1 (MQ=255) tgtgGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCtt < 1:175533/150‑1 (MQ=255) gtgGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGCCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTg < 1:937958/150‑1 (MQ=255) ggTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGa > 2:1985795/1‑150 (MQ=255) gTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACgatga < 1:1120663/73‑1 (MQ=255) gTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACgatga > 2:1120663/1‑73 (MQ=255) cTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCa > 2:142458/1‑92 (MQ=255) cTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCa < 1:142458/92‑1 (MQ=255) ttCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAg > 1:1609334/1‑96 (MQ=255) ttCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTgc > 2:180971/1‑150 (MQ=255) ttCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTCTCGGAGTTGCTGTGCAGGAAg < 2:1609334/96‑1 (MQ=255) ctcGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACgat > 2:1525101/1‑63 (MQ=255) ggTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTgcgccgc > 2:933951/1‑150 (MQ=255) ggTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTgcgccgc > 2:1539545/1‑150 (MQ=255) tCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTTCTGAGCAGGAAGGTGCCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTgcgccgcgc > 1:1145082/1‑150 (MQ=255) aGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTg < 2:497084/75‑1 (MQ=255) aGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTg > 1:497084/1‑75 (MQ=255) aGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAg > 1:2220692/1‑87 (MQ=255) aGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAg < 2:2220692/87‑1 (MQ=255) aGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCa > 1:2311517/1‑150 (MQ=255) ctctTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAgt < 1:2002094/150‑1 (MQ=255) ctctTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAgt > 1:496023/1‑150 (MQ=255) tttCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTc > 2:1474241/1‑150 (MQ=255) ttCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGAGGCAGGCCTGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCCGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCg < 2:1398664/150‑1 (MQ=255) tCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCgg > 1:1572869/1‑150 (MQ=255) gcgcGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGc > 2:1993220/1‑66 (MQ=255) gcgTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCg > 2:1065599/1‑150 (MQ=255) gcgTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCg > 1:361969/1‑150 (MQ=255) gtgtTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGGGTTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGcc > 1:1331652/1‑150 (MQ=255) gttgtGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGCGCAGGAACGTGCCATCTTCAGCCTAACCTGACGTCACCGTCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCAc < 2:2079177/150‑1 (MQ=255) atcgttccgGGCTACGGCCTGGCGGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCAcc > 1:1074600/8‑150 (MQ=255) tgCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGaa < 1:933951/150‑1 (MQ=255) tgCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGaa < 2:818139/150‑1 (MQ=255) ttccgGGCTACGGCCTGGCGGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGAAg > 1:924092/4‑150 (MQ=255) gggCTACGGCCTGGCGGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGAAgccgc > 1:469763/1‑150 (MQ=255) gggCTACGGCCTGGCGGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGAAgccgc > 2:1290267/1‑150 (MQ=255) gggCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCa > 1:31910/1‑140 (MQ=255) gggCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCa < 2:31910/140‑1 (MQ=255) gCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGAAGCCGCCa > 2:2121216/1‑150 (MQ=255) tACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGAAGCCGCCAAg > 1:2080538/1‑150 (MQ=255) tACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGAGACCTTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGAAGCCGCCAAg < 1:633866/150‑1 (MQ=255) aCCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGAAGCCGCCAAgg < 2:361969/150‑1 (MQ=255) ccGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCTAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGAAGCCGCCAAGGa < 1:1135192/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGAAGCCGCCAAGGATGAc < 1:1539545/150‑1 (MQ=255) aGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGAAGCCGCCAAGGATGACg > 2:2195442/1‑150 (MQ=255) cGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGAAGCCGCCAAGGATGACGTTga < 2:1329974/150‑1 (MQ=255) | TTCAGCCTCGGCCAGCAGTACGTTCATGTGCCCGGGCATACGGCCCGCCACCGGGTGAATCGCATACTTCACGGTCACGCCGTTGTGGGTCAGCTTCTCGGTCAGCTCTTTCAGCGCGTGTTGTGCGCGGGCTACCGCCAGGCCGTAGCCCGGAACGATGATCACGCTGTCGGCGTTGCTGAGCAGGAAGGTGGCATCGTCAGCCGAACCGGACTTCACCGGCCGCTGTTCTTGCGAACCTTGCGCCGCGCCAGTGTCGGTATCGCCACCGAAGCCGCCAAGGATGACGTTGA > NC_002947/164323‑164615 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |