Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
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RA | NC_002947 | 165,929 | G→T | 8.1% | A326A (GCC→GCA) | pntAA ← | pyridine nucleotide transhydrogenase subunit alpha |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | NC_002947 | 165,929 | 0 | G | T | 8.1% | 307.4 / 11.0 | 97 | A326A (GCC→GCA) | pntAA | pyridine nucleotide transhydrogenase subunit alpha |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (47/42); new base T (4/4); total (51/46) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.03e-01 |
TCCTTAGCCGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGATGACCACCGAGCCGGGCTTC > NC_002947/165782‑166070 | tCCTTAGCCGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGc < 2:325284/150‑1 (MQ=255) cTTAGCCGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCAt > 1:1218012/1‑150 (MQ=255) cTTAGCCGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCAt > 1:338173/1‑150 (MQ=255) tAGCCGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCg < 2:1218012/150‑1 (MQ=255) ccGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACCGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCa < 2:190385/150‑1 (MQ=255) ccGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCa < 1:837926/150‑1 (MQ=255) ccGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCa < 1:2008207/150‑1 (MQ=255) gTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTAGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACt > 2:1735530/1‑150 (MQ=255) gCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTg < 2:1505485/150‑1 (MQ=255) cGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTgg < 1:1060197/150‑1 (MQ=255) gacCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGCGCCgg > 1:2288374/1‑150 (MQ=255) acCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCgg < 2:1563608/149‑1 (MQ=255) acCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCgg > 1:1563608/1‑149 (MQ=255) ccTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCa > 1:1717092/1‑150 (MQ=255) ccTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCa < 2:2099533/150‑1 (MQ=255) ccTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGCGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCa < 1:2297412/150‑1 (MQ=255) cTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGATGCCTCGGCACtg < 2:71848/136‑2 (MQ=255) cTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGATGCCTCGGCACtg > 1:71848/1‑135 (MQ=255) cTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAg > 2:435801/1‑150 (MQ=255) cTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAg > 2:1426567/1‑150 (MQ=255) tGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAgg > 1:1920353/1‑150 (MQ=255) gagcATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGt < 1:1062188/147‑1 (MQ=255) gACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGt < 1:1544285/150‑1 (MQ=255) ccATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTTCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTg < 1:1024841/150‑1 (MQ=255) 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aTGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGcc > 2:5848/1‑150 (MQ=255) aTGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCAACTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGcc > 2:278743/1‑150 (MQ=255) tGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACgatga < 1:1963217/81‑1 (MQ=255) tGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACgatga > 2:1963217/1‑81 (MQ=255) gAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAg > 1:1285166/1‑150 (MQ=255) gAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCATACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGCTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAg > 2:598718/1‑150 (MQ=255) aaGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAgg > 2:1776294/1‑150 (MQ=255) aaGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAgg > 1:90515/1‑150 (MQ=255) aGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCTGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGt < 2:701198/150‑1 (MQ=255) agcagGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACAATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGATg < 2:2029654/150‑1 (MQ=255) cagGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGATGac < 2:1285166/150‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) aGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGATGACCACCGAGCCGGGCTTc < 1:1414399/150‑1 (MQ=255) | TCCTTAGCCGTTTTTGCGGACGACCTGACCATCACGGCACATCAGGCAGGCCGCGACGATGTCGTCTTCGAGGTTGATGATCAGCGCGCCATCCTTGTCGAACAGCAGCTTCATGAAGTCCAGCAGGTTGCGTGCGTACAGTGCCGAGGCATCGGCACTCACCTGGGCCGGCAGGTTGGTCGGGCCGACGATGATCACGCCGTTCTCCTGCACCACCTGGTCTGCGACGGTCAGCGGGCAGTTGCCGCCTTGGGCTGCAGCCAGGTCGATGACCACCGAGCCGGGCTTC > NC_002947/165782‑166070 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |