| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,481,522 | T→C | 6.0% | S75G (AGC→GGC) | rhlB ← | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,481,522 | 0 | T | C | 6.0% | 256.7 / 3.7 | 83 | S75G (AGC→GGC) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/42); new base C (2/3); total (38/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 | |||||||||||
GTAACCCAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCGGCGT > NC_002947/1481373‑1481669 | gtAACCCAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCt > 2:689417/1‑150 (MQ=255) cAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCtg > 2:2141444/1‑150 (MQ=255) aGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCtgt < 2:1630767/150‑1 (MQ=255) gACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGTGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTgg > 1:66774/1‑150 (MQ=255) gACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTgg < 2:1332517/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTCGAAGGCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCCAGCCTGTggaa < 1:292220/150‑3 (MQ=255) tGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTggcttg < 1:449189/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTggcttgg < 2:1263091/150‑1 (MQ=255) cgcCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTggcttggg < 2:944003/150‑1 (MQ=255) cgcCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCCAGCCTGTggaagccc < 1:178532/150‑7 (MQ=255) cTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTggcttgggctt < 1:1822820/150‑1 (MQ=255) cGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTc < 1:2141444/150‑1 (MQ=255) cGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGGCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTcgcg > 1:121198/1‑150 (MQ=255) gTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTAGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTcgcgg > 1:519339/1‑150 (MQ=255) tACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGt < 1:1845896/150‑1 (MQ=255) tACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGt < 2:1860999/150‑1 (MQ=255) gggAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTg > 1:653450/1‑150 (MQ=255) gggAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCCTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTg > 1:652611/1‑150 (MQ=255) aGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCCTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCTGGCTTCCACAAGCTGGCCTGTGGCTTAGGCTTGCGTTCGCGGCCCGGTTTGTCCt > 2:562938/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTgg < 2:1851728/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTgg > 1:2249226/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTgg > 1:2311591/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGGAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCAACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACACGCTAGCATGTGGCTCGGGCTTGTGATCGCCGGGCGGTGTGTCCttagt > 2:222123/1‑147 (MQ=255) gTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCgg < 1:228289/150‑1 (MQ=255) cGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGtt < 2:653450/150‑1 (MQ=255) cGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCCTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGtt < 2:652611/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGc < 1:2279001/114‑1 (MQ=255) tGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGc > 2:2279001/1‑114 (MQ=255) tGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTACCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCgg < 2:1643172/150‑1 (MQ=255) cGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGAt < 2:1587644/144‑1 (MQ=255) cGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGAt > 1:1587644/1‑144 (MQ=255) gCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTg > 1:1356075/1‑150 (MQ=255) aTCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGc < 2:2249226/150‑1 (MQ=255) cTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTcgc > 2:1797930/1‑150 (MQ=255) gTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCgcggc < 2:1549421/150‑1 (MQ=255) gACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCa > 1:1239791/1‑150 (MQ=255) cAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAgg < 1:681751/150‑1 (MQ=255) cTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCtgt < 1:2051242/76‑1 (MQ=255) cTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCtgt > 2:2051242/1‑76 (MQ=255) ttGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCCTTCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGCGCTTCCGTTCGAGGCGCGGCTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCGGGTGGCGTCTCGGCGGTAGGGTGc > 2:288492/1‑150 (MQ=255) tGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTg < 2:1356075/150‑1 (MQ=255) ggAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTgg < 2:1239791/150‑1 (MQ=255) gggTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTCGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATc < 1:524741/106‑1 (MQ=255) gggTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTCGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATc > 2:524741/1‑106 (MQ=255) ggTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCt < 2:178617/134‑1 (MQ=255) ggTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCt > 1:178617/1‑134 (MQ=255) ggTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCggg < 1:2213735/150‑1 (MQ=255) ggTTTTGCCTTCCTGCGGCTAGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCggg > 2:1202778/1‑150 (MQ=255) ggTTTTGCCTTCCTGCGGCTAGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCggg > 2:1202429/1‑150 (MQ=255) ttttGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGt > 1:204576/1‑150 (MQ=255) tttGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGtt < 2:1494017/150‑1 (MQ=255) ttGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTg < 1:222123/150‑1 (MQ=255) ttGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTg < 1:689417/150‑1 (MQ=255) ttGCCTTCCTGCGGCTAGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTg < 1:1202778/150‑1 (MQ=255) ttGCCTTCCTGCGGCTAGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTg < 1:1202429/150‑1 (MQ=255) ccTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCa < 1:688082/150‑1 (MQ=255) cTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCAt > 1:869453/1‑150 (MQ=255) ttCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATg > 1:1633803/1‑150 (MQ=255) tCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATgg < 1:1816919/150‑1 (MQ=255) ccTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATggg < 1:1836914/150‑1 (MQ=255) aCCAGGAAGTGTTCGGGTTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGt < 2:66774/150‑1 (MQ=255) aCGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTgg < 2:333508/118‑1 (MQ=255) aCGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTgg > 1:333508/1‑118 (MQ=255) aCGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCCGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCCTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGtttt > 2:1022408/1‑150 (MQ=255) tCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCcgcg > 1:1391518/1‑150 (MQ=255) ttCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAg > 1:2203743/1‑95 (MQ=255) ttCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAg < 2:2203743/95‑1 (MQ=255) ttCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGGTGGCATCGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcggg > 2:2307270/1‑150 (MQ=255) ttCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGGCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGACTCAGGTGGGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcggg > 2:1171628/1‑150 (MQ=255) ttCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCCTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGCGCGGGGTTGGCATGGGGTGCCGCCGGTTTTGCCTcggg > 2:210205/1‑150 (MQ=255) cGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGCCCGGTTGACCACCGCGGGGCGGCGCGGCGGCATGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcgggcc < 1:2097558/150‑1 (MQ=255) gggCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGt > 1:1990230/1‑64 (MQ=255) gggCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGt < 2:1990230/64‑1 (MQ=255) ggCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcgggccgg < 2:2311591/150‑1 (MQ=255) gccACAGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCg < 1:2297196/106‑1 (MQ=255) gccACAGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCg > 2:2297196/2‑107 (MQ=255) ccACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTc < 2:869453/150‑1 (MQ=255) ccACAGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGCTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGTCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTc > 2:1558425/1‑150 (MQ=255) acaGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCg > 2:1223361/1‑150 (MQ=255) acaGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCg > 1:778293/1‑150 (MQ=255) aGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCgg < 2:717100/103‑1 (MQ=255) aGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCgg > 1:717100/1‑103 (MQ=255) aGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCGGc < 2:1633803/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCGGCGt > 1:371020/1‑150 (MQ=255) | GTAACCCAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCGGCGT > NC_002947/1481373‑1481669 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |