| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,535,904 | A→C | 7.5% | N291H (AAC→CAC) | argJ → | glutamate N‑acetyltransferase/amino acid acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,535,904 | 0 | A | C | 7.5% | 272.2 / 12.2 | 95 | N291H (AAC→CAC) | argJ | glutamate N‑acetyltransferase/amino acid acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/45); new base C (3/4); total (46/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.71e-01 | |||||||||||
CCTGCCGGAAGTGACCGAAGCCAGCGGCGCGCTTTTCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGTAGGCCGTGCCGGTGTACCGGAGCTGGATGTGAGCCTGATCGAT > NC_002947/1535756‑1536053 | ccTGCCGGAAGTGACCGAAGCCAGCGGCGCGCTTTTCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCaa < 2:612653/150‑1 (MQ=255) ccGGAAGTGACCGAAGCCAGCGGCGCGCTTTTCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGTGACCCAGTTCGTGACCGTACAGGCCAACGGAGGTGGCAaccac > 1:2338827/1‑150 (MQ=255) gAAGTGACCGAAGCCAGCGGCGCGCTTTTCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTAATGGTGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTTGCCaccaccgt < 2:2019262/150‑3 (MQ=255) aGTGACCGAAGCCAGCGGCGCGCTTTTCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGa < 1:730497/150‑1 (MQ=255) gTGACCGAAGCCAGCGGCGCGCTTTTCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTTGCCaccaccgttga < 2:1741179/150‑6 (MQ=255) tGACCGAAGCCAGCGGCGCGCTTTTCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGt < 2:1334707/150‑1 (MQ=255) ccGAAGCCAGCGGCGCGCTTTTCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGcc > 1:747036/1‑150 (MQ=255) ccGAAGCCAGCGGCGCGCTTTTCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGcc > 1:285717/1‑150 (MQ=255) cGAAGCCAGCGGCGCGCTTTTCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCt < 1:197765/150‑1 (MQ=255) cGAAGCCAGCGGCGCGCTTTTCGAAGCGCTAAACGCGGCTATGTTC‑AATTAAGAATTTAATGACTGCCAATCTAGCGACCGTGACGGAGAAGGTGCTACTAAGTTCGTGACCGTGGAGGGCAACGGTGGTGGCGACCACCAGGCGTGccc > 1:1252406/1‑149 (MQ=255) gAAGCCAGCGGCGCGCTTTTCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTg < 2:1654379/150‑1 (MQ=255) gcggcgCGCTTTTCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCg < 2:2291282/150‑1 (MQ=255) ttCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTg < 2:285717/150‑1 (MQ=255) tCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTgg < 1:784639/150‑1 (MQ=255) gAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAATGGTGGTTGCCaccaccgttgac < 1:191854/124‑7 (MQ=255) gAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAATGGTGGTTGCCaccaccgttgac > 2:191854/1‑118 (MQ=255) aaaGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCt > 1:1197738/1‑150 (MQ=255) gCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATc < 2:1197738/150‑1 (MQ=255) cGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCaa > 2:249844/1‑150 (MQ=255) tgtTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGa < 2:747036/150‑1 (MQ=255) tgtTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTACGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTCCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGa < 1:162041/150‑1 (MQ=255) gtgtGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCATAGACGTTGGGTACCCCGTGGCCCACTAGCCACTGATCAAGACAGCGCTg > 2:246630/1‑150 (MQ=255) tgCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTc < 1:249844/150‑1 (MQ=255) tgCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTc < 1:1092760/150‑1 (MQ=255) tgCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTc < 2:909768/150‑1 (MQ=255) tgCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGCACGTGAAGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAATCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTc < 2:192436/150‑1 (MQ=255) gCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCNAGTTCGTGACCGTGCAGGTAAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCAGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCACCACTCCGCTGATCAAGACGCCGCTGTTcc > 1:1107982/1‑149 (MQ=255) aTGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCt > 1:1558004/1‑150 (MQ=255) tGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCtt < 1:1860431/150‑1 (MQ=255) tGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTATCTAGGCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACTGCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCtt > 1:1641402/1‑150 (MQ=255) ggAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTc < 2:2355846/150‑1 (MQ=255) gAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTcc > 2:1422482/1‑150 (MQ=255) aa‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTcgccgc < 1:165268/123‑1 (MQ=255) aa‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTcgccgc > 2:165268/1‑123 (MQ=255) a‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGa < 1:1942852/150‑1 (MQ=255) gTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGAc < 1:246630/150‑1 (MQ=255) gCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCg > 2:318031/1‑150 (MQ=255) cccAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCgg > 2:1235649/1‑94 (MQ=255) cccAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCgg < 1:1235649/94‑1 (MQ=255) cccAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGa > 1:218869/1‑150 (MQ=255) cccAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGa > 2:1044942/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGaa < 1:2033490/150‑1 (MQ=255) cccATCGCCCGTCACGCCGAAGCTTCGTCCAACTTCGTCACCGTGCAGCGCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGCGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACCCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTgg < 2:1107982/149‑1 (MQ=255) cATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTgggg < 1:1388121/150‑1 (MQ=255) aTCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCTACCCGAACTGGGGc > 2:1758297/1‑150 (MQ=255) aTCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCCTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGc < 2:1558004/150‑1 (MQ=255) gTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTcgccg < 2:1837430/105‑1 (MQ=255) gTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTcgccg > 1:1837430/1‑105 (MQ=255) gTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACcgc < 2:1580228/119‑1 (MQ=255) gTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACcgc > 1:1580228/1‑119 (MQ=255) ccGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCAt > 1:1299816/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCGACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCgccgcc > 2:1281746/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGCGACCAAGGTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGTGGCCGCATCCTCgccgcc > 2:2208631/1‑150 (MQ=255) gTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCa < 1:1037411/82‑1 (MQ=255) gTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCa > 2:1037411/1‑82 (MQ=255) gTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGa < 2:2138183/123‑1 (MQ=255) gTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGa > 1:2138183/1‑123 (MQ=255) gCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGTAGGc < 2:2225063/150‑1 (MQ=255) cGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTcgccg < 1:1967852/86‑1 (MQ=255) cGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTcgccg > 2:1967852/1‑86 (MQ=255) 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tcctggtggtTGCCACCGCCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTGGCCGCAGTAGGCCGGACCGTTGTACCGGAGCTGGCtgt > 2:126745/5‑150 (MQ=255) tcctggtggtTGCCACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGTAg < 1:544506/118‑1 (MQ=255) tcctggtggtTGCCACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGTAg > 2:544506/5‑122 (MQ=255) aaCGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGTAGGCCGTGCCGGTGTACCGGAGCTGGAtgtg > 1:2178796/1‑150 (MQ=255) tctgtggtgGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGCCCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCAGCCGTAGGCCGTGCCGGTGTACCGGAGCTGGATGTGa < 1:803823/147‑1 (MQ=255) aCGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGTAGGCCGTGCCGGTGTACCGGAGCTGGATGTGa < 1:1823878/150‑1 (MQ=255) aCGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGTAGGCCGTGCCGGTGTACCGGAGCTGGATGTGa > 2:1485789/1‑150 (MQ=255) aCGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGTAGGCCGTGCCGGTGTACCGGAGCTGGATGTGa < 1:2279754/150‑1 (MQ=255) cGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCTAACTGGGGCCACATCCTCGCCGCCGTAGGCCGTGCCGGTGTACCGGAGCTGGATGTGAg > 2:567047/1‑150 (MQ=255) tggtggCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGTAGGCCGTGCCGGTGTACCGGAGCTGGATGTGAGCCt < 1:1422482/150‑1 (MQ=255) tggtggCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGTAGGCCGTGCCGGTGTACCGGAGCTGGATGTGAGCCt < 1:829180/150‑1 (MQ=255) tggtggCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGTAGGCCGTGCCGGTGTACCGGAGCTGGATGTGAGCCt > 2:829180/1‑150 (MQ=255) tggtggCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGAAAGCCCTGCCGGTGTACCGGAGCTGGATGTGAgaga > 2:803823/1‑147 (MQ=255) aaCCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGTAGGCCGTGCCGGTGTACCGGAGCTGGATGTGAGCCTGATCGAt > 2:2091089/1‑150 (MQ=255) | CCTGCCGGAAGTGACCGAAGCCAGCGGCGCGCTTTTCGAAGCGCTGAAAAAGGCCGTGTTCGAAGTGTGCATGGAA‑GTGGCCCAGGCCATCGTCCGTGACGGCGAAGGTGCGACCAAGTTCGTGACCGTGCAGGTCAACGGTGGTGGCAACCACCAGGAGTGCCTGGACGTCGGCTACGCCGTGGCCCACTCGCCGCTGATCAAGACCGCGCTGTTCGCTTCCGACCCGAACTGGGGCCGCATCCTCGCCGCCGTAGGCCGTGCCGGTGTACCGGAGCTGGATGTGAGCCTGATCGAT > NC_002947/1535756‑1536053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |