| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,594,526 | A→C | 5.5% | R313R (CGT→CGG) | kgtP ← | alpha‑ketoglutarate permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,594,526 | 0 | A | C | 5.5% | 270.4 / 6.7 | 91 | R313R (CGT→CGG) | kgtP | alpha‑ketoglutarate permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/47); new base C (2/3); total (41/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.70e-01 | |||||||||||
ACGGCGTTGATCGAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATGTAGGTGGTGTAGGTG > NC_002947/1594377‑1594673 | aCGGCGTTGATCGAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCAGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGa > 1:2277134/1‑150 (MQ=255) gTTGATCGAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGAcggcg > 2:58810/1‑150 (MQ=255) gTTGATCGAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGAcggcg < 1:2384843/150‑1 (MQ=255) ttGATCGAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGAcggcgg > 1:1288724/1‑150 (MQ=255) tGATCGAGGTATCGCCGCTTACGATGATCAGGGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACggcggc < 1:306047/150‑1 (MQ=255) tGATCGAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACggcggc < 2:1861412/150‑1 (MQ=255) gAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGCCGCCGTCCGATc < 2:1476011/150‑1 (MQ=255) aGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCt > 2:451416/1‑150 (MQ=255) ggTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCtt < 1:58810/150‑1 (MQ=255) ataGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTc < 2:798459/150‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGa < 1:2120230/150‑1 (MQ=255) cGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACa < 2:384995/150‑1 (MQ=255) gCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAg > 1:1663718/1‑150 (MQ=255) cTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAAGGCACCCCACCAGGTCGGGAGGGTGTGAAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAGGGCGATAAGGGTCGGAGGGGGGCCGAGCCTGTCGGACAGa > 1:1917317/1‑150 (MQ=255) tACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGacc < 1:451416/150‑1 (MQ=255) cGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCAGCCTGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGaccac < 1:23301/150‑1 (MQ=255) gatgatCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGaccacc > 1:192690/1‑150 (MQ=255) atgatCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCg > 2:720583/1‑150 (MQ=255) atgatCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCg > 2:2219310/1‑150 (MQ=255) tCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGatca < 1:1472736/150‑1 (MQ=255) tCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGatca < 1:207303/150‑1 (MQ=255) cAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGatcat < 1:1743300/150‑1 (MQ=255) aGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGatcatc < 2:1288724/150‑1 (MQ=255) gTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCg > 1:2253466/1‑150 (MQ=255) ggCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCgtaag < 2:1917317/150‑5 (MQ=255) ccATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACTGATCATCGGCTGCa > 1:1789424/1‑150 (MQ=255) ccATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCa < 2:192690/150‑1 (MQ=255) ccATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCa < 2:2325778/150‑1 (MQ=255) ccATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCa > 1:978054/1‑150 (MQ=255) gATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCTGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGca > 2:756700/1‑150 (MQ=255) gATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCACGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACAGCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGct < 2:1649779/150‑2 (MQ=255) gATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCACGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGct < 2:1649628/150‑2 (MQ=255) aTCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGcac < 2:730714/150‑1 (MQ=255) cAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGCCGCCGTCCGAt > 1:2345866/1‑111 (MQ=255) cAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGCCGCCGTCCGAt < 2:2345866/111‑1 (MQ=255) aGGAAGAACGCA‑CCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGAc < 1:630947/99‑1 (MQ=255) aGGAAGAACGCA‑CCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGAc > 2:630947/1‑99 (MQ=255) gaagaaCGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCtt > 1:145909/1‑111 (MQ=255) gaagaaCGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCtt < 2:145909/111‑1 (MQ=255) agaaCGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATgaaca < 1:282465/150‑1 (MQ=255) gaaCGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATgaacag < 2:581779/150‑1 (MQ=255) gaaCGCACACCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGTACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATgaacag < 2:181020/150‑1 (MQ=255) ccaccaGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGt > 2:59822/1‑150 (MQ=255) ccaccaGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGt > 1:2117761/1‑150 (MQ=255) ccaGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGCCGCCGTCCGATc < 1:1537280/94‑1 (MQ=255) ccaGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGCCGCCGTCCGATc > 2:1537280/1‑94 (MQ=255) gATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGa > 1:1636260/1‑83 (MQ=255) gATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGa < 2:1636260/83‑1 (MQ=255) gATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGatc < 1:2010907/106‑1 (MQ=255) gATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGatc > 2:2010907/1‑106 (MQ=255) gATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGAt < 2:2277134/150‑1 (MQ=255) ggTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATAGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGAgggg > 1:2051395/1‑149 (MQ=255) gtgtGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTc < 1:1372584/86‑1 (MQ=255) gtgtGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTc > 2:1372584/1‑86 (MQ=255) tgCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGa > 2:1811622/1‑86 (MQ=255) tgCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGa < 1:1811622/86‑1 (MQ=255) cAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGa > 1:1440768/1‑150 (MQ=255) tGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGa > 1:2182702/1‑145 (MQ=255) tGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGa < 2:2182702/145‑1 (MQ=255) tGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGa > 2:903455/1‑80 (MQ=255) tGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGa < 1:903455/80‑1 (MQ=255) tGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGa > 1:746785/1‑150 (MQ=255) gATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCt > 2:708943/1‑150 (MQ=255) ggggACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCAt < 2:746785/150‑1 (MQ=255) ggggACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGAACTTGTCAGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGAGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCAt > 1:2389185/1‑150 (MQ=255) ggTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCAc < 1:708943/150‑1 (MQ=255) aCAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGgtgt < 2:2253466/150‑1 (MQ=255) cAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGGACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGtt < 2:1369604/150‑1 (MQ=255) gggTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGc > 2:333509/1‑98 (MQ=255) gggTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGc < 1:333509/98‑1 (MQ=255) ggTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGTAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGGGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGAc > 2:368200/1‑150 (MQ=255) tGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGActa > 1:1096982/1‑148 (MQ=255) tGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCa < 1:2043077/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACTAg < 2:1096982/150‑1 (MQ=255) gCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAg < 2:1440768/150‑1 (MQ=255) gCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCAc < 2:1784963/117‑1 (MQ=255) gCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCAc > 1:1784963/1‑117 (MQ=255) ccGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGc > 1:802409/1‑150 (MQ=255) cGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGAtggt < 1:1346815/100‑1 (MQ=255) cGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGAtggt > 2:1346815/1‑100 (MQ=255) cGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCa > 2:2226915/1‑150 (MQ=255) cGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCa < 1:756700/150‑1 (MQ=255) aaGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGt > 2:1982014/1‑83 (MQ=255) aaGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGt < 1:1982014/83‑1 (MQ=255) aTCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCga > 2:2166774/1‑86 (MQ=255) aTCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCga < 1:2166774/86‑1 (MQ=255) gATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAg > 2:106388/1‑94 (MQ=255) gATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAg < 1:106388/94‑1 (MQ=255) gATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATGTAGGTggtgta > 1:1808976/1‑150 (MQ=255) gATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATGTAGGTggtgta > 1:12148/1‑150 (MQ=255) aTCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACTGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATGTAGGTggtgtag < 2:1789424/150‑1 (MQ=255) ggACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGTTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGTCGTGATGGTGGTTGAGTCACTGATGGTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATGTAGGTggtgtaggtg < 2:119442/150‑1 (MQ=255) | ACGGCGTTGATCGAGGTATAGCCGCTTACGATGATCAGTGCGGCCATGATCAGGAAGAACGCACCCCACCAGGTCTGGATGGTGTGCAGGGTGCTGAGGATGGGGACGGTGAACAGGGTGCCGAGCACACCGAAGGCGATCAGGATCGGACGGCGGCCGATCTTGTCGGACAGACCACCGATCATCGGCTGCAGGCACATGAACAGGAACAGCGTGGCGGCCGAGATGGTGGTCGAGTCACTGATGCTCATGCCCACGGTGTTGACCAGGTATTTCTGCATGTAGGTGGTGTAGGTG > NC_002947/1594377‑1594673 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |