Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,622,234 | T→C | 10.6% | L369S (TTG→TCG) | PP_1421 → | sensor histidine kinase TctE |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,622,234 | 0 | T | C | 10.6% | 328.0 / 23.3 | 124 | L369S (TTG→TCG) | PP_1421 | sensor histidine kinase TctE |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/55); new base C (5/8); total (60/64) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.85e-01 |
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
GGCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCT > NC_002947/1622086‑1622383 | cGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAgttgtt < 1:2409745/150‑1 (MQ=255) cGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAgttgtt < 1:1850170/150‑1 (MQ=255) gTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGa < 1:214654/150‑1 (MQ=255) 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cTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCtggtg < 2:843799/150‑1 (MQ=255) gAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCAAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATGGCTCGACGAGTGGTGGATCAACCTGGTGGACAATGc > 2:1330968/1‑150 (MQ=255) gTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCt > 2:1660771/1‑150 (MQ=255) cAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCCAACTGGTGGACAATGCCTTg < 2:101905/150‑1 (MQ=255) aGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACaa < 1:2167461/142‑1 (MQ=255) aGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACaa > 2:2167461/1‑142 (MQ=255) aGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTgg > 1:1212331/1‑150 (MQ=255) gatGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGgc > 2:32021/3‑150 (MQ=255) gTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATg > 1:858699/1‑143 (MQ=255) gTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACAACTCGTTGAGCaatgtcg < 1:920750/134‑6 (MQ=255) gTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACAACTCGTTGAGCaatgtcg > 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tGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGGCAATGCCTTGGCGTATGCGCCaaggc < 2:95043/150‑5 (MQ=255) gCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTg > 2:1684690/1‑150 (MQ=255) catggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTgg < 1:1660771/150‑1 (MQ=255) ggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCaa < 2:1439678/150‑1 (MQ=255) ggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCaa < 2:161046/150‑1 (MQ=255) catggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAtgt < 1:1540257/150‑1 (MQ=255) catggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAtgt > 2:1540257/1‑150 (MQ=255) catggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACAACTCGTTGAGCa > 2:1844317/1‑104 (MQ=255) catggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACAACTCGTTGAGCa < 1:1844317/104‑1 (MQ=255) atggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAtgtg > 1:620409/1‑150 (MQ=255) ccTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGgc > 2:140630/1‑119 (MQ=255) ccTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTg > 1:1912939/1‑150 (MQ=255) cTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTg > 1:1390500/1‑135 (MQ=255) cTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTg < 2:1390500/135‑1 (MQ=255) cTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGc < 2:840621/150‑1 (MQ=255) tttGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCg > 2:1882589/1‑150 (MQ=255) 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ctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtggaa < 1:32021/150‑1 (MQ=255) ggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGgc > 2:2026430/1‑84 (MQ=255) ggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGgc < 1:2026430/84‑1 (MQ=255) gAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgac < 2:1097091/150‑1 (MQ=255) gAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgac > 2:925037/1‑150 (MQ=255) gAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgac < 2:1921577/150‑1 (MQ=255) aGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgacg < 2:1947329/150‑1 (MQ=255) gccaaGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGAACATCAACAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgacgac < 1:1330968/146‑1 (MQ=255) gCCGAGGCGCCGCTGTGGTTGACGGTGGAGCAGACATTGCTCAACGAGTTGTTGATCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATTGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgacgac < 2:410131/150‑1 (MQ=255) cGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACgg < 2:1404288/150‑1 (MQ=255) cgatctcGGTGTGGTTGAAGGGGGAGACGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCACCCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGc < 2:2370833/144‑1 (MQ=255) cGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTa > 2:297163/1‑150 (MQ=255) ggTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACACTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAgatcg > 1:2370833/1‑146 (MQ=255) ggTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACgg < 2:1264176/136‑1 (MQ=255) ggTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACgg > 1:1264176/1‑136 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCt > 2:1140563/1‑59 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCt < 1:1140563/59‑1 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGt > 2:1813394/1‑150 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGt < 1:1600673/150‑1 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGt > 1:897059/1‑150 (MQ=255) gAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGc > 1:1275001/1‑150 (MQ=255) gggggAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGa > 1:1858010/1‑150 (MQ=255) gggAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAgc < 1:2345052/150‑1 (MQ=255) gCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGgc > 1:1654012/1‑93 (MQ=255) cGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAAc < 2:2171785/150‑1 (MQ=255) caggttGCTCAACAACTCGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGc > 2:2296278/5‑138 (MQ=255) caggttGCTCAACAACTCGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGc < 1:2296278/134‑1 (MQ=255) aTTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGgt > 1:243119/1‑150 (MQ=255) ttGCTCAACAACTCGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGgtg > 2:2366395/1‑150 (MQ=255) cTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGCTTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGTAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGACCGGGTGGTc > 2:183858/1‑150 (MQ=255) cTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACgggagatc > 1:1132422/1‑145 (MQ=255) tCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCg > 2:2218517/1‑150 (MQ=255) tCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCg > 1:1138925/1‑150 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAg > 2:334567/1‑150 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGCAAGGGCGCCGGCAGTGCGGGAAGTGGAATACGACGGACCGGTTATTCCCGTGGCCTAGCGCGAACGGGTGTTCGAg > 2:2308560/1‑150 (MQ=255) cGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCg < 1:328131/150‑1 (MQ=255) aGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCgtt < 1:467583/150‑3 (MQ=255) gttgttGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGGACGGGTGTTCGAGCGGtt > 2:1176805/1‑150 (MQ=255) tgttgAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCt < 1:1422178/150‑1 (MQ=255) | GGCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGAGCGGTTCT > NC_002947/1622086‑1622383 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |