| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,649,537 | T→C | 9.2% | H522R (CAT→CGT) | PP_1446 ← | TonB‑dependent receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,649,537 | 0 | T | C | 9.2% | 186.7 / 7.5 | 65 | H522R (CAT→CGT) | PP_1446 | TonB‑dependent receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/29); new base C (3/3); total (33/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.31e-01 | |||||||||||
TTCTTGGCTCGGGTATAGTCACCGGACAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGCCGTTGTCGAAGCGCAGCGCCAGG > NC_002947/1649390‑1649683 | ttCTTGGCTCGGGTATAGTCACCGTACAACTCCCGCGCGAAGCCAACGCAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTGCTGTGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTCGTATTCCGGGAAGCTCtcatgatgatga < 2:2077123/150‑1 (MQ=255) tCGGGTATAGTCACCGGACAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCatgatcatgatcatgatc > 1:2174311/1‑150 (MQ=255) tCGGGTATAGTCACCGGACAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCatgatcatgatcatgatc > 2:1356182/1‑150 (MQ=255) tCGGGTATAGTCACCGGACAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCatgatcatgatcatgatc < 2:1433365/150‑1 (MQ=255) gTATAGTCACCGGACAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCtcatgatcatgatcatgatcatga < 1:1308794/150‑1 (MQ=255) gTATAGTCACCGGACAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGa > 1:984097/1‑150 (MQ=255) aCCGGACAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGAtcctcctc > 1:623396/1‑150 (MQ=255) aCCGGAAAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTGGCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCTCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGAtcctcctc < 1:991464/150‑1 (MQ=255) cGGACAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCACGATCatgatcatgatcatgagg < 1:1609135/148‑7 (MQ=255) cGGACAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCACGATCatgatcatgatcatgagg > 2:1609135/1‑142 (MQ=255) ggACAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCctcctcctc > 2:1378018/1‑150 (MQ=255) ggACAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCCCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCtcatgatcatgatc < 1:1238131/129‑1 (MQ=255) ggACAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCCCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCtcatgatcatgatc > 2:1238131/1‑129 (MQ=255) atcttCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTTGGCCTGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATg < 1:1870374/146‑1 (MQ=255) tcgaGCGCGAAGCGGCCGTAACGGGTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCa > 2:1241564/4‑150 (MQ=255) tCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCa > 1:1189445/1‑150 (MQ=255) gcgAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCg > 1:1080388/1‑150 (MQ=255) gCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTc > 2:2153714/1‑150 (MQ=255) gCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTcgcg < 1:637671/150‑1 (MQ=255) tAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCACGATCatgatcatgatcatga > 2:2110754/1‑116 (MQ=255) tAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCACGATCatgatcatgatcatga < 1:2110754/120‑5 (MQ=255) aCGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTAATCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGtt > 1:2098672/1‑150 (MQ=255) cGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGc < 2:2098672/150‑1 (MQ=255) cGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCACGATCatgatcatgatcatga > 1:2354638/1‑106 (MQ=255) cGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCACGATCatgatcatgatcatga < 2:2354638/110‑5 (MQ=255) ccAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCaa > 1:1285397/1‑150 (MQ=255) aaCTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCtcatgatcat > 2:1004408/1‑85 (MQ=255) aaCTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCtcatgatcat < 1:1004408/85‑1 (MQ=255) aCTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCa < 1:363526/150‑1 (MQ=255) aCTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCa > 2:1515159/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAgg > 2:2103756/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGcc < 2:1285397/150‑1 (MQ=255) ccAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGcc > 1:97144/1‑150 (MQ=255) tCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCtcatgatcatga < 2:1349292/75‑1 (MQ=255) tCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCtcatgatcatga > 1:1349292/1‑75 (MQ=255) cTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGACCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGtt > 2:823851/1‑150 (MQ=255) cTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGAtcc > 2:1934228/1‑82 (MQ=255) cTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGAtcc < 1:1934228/82‑1 (MQ=255) cGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGc < 1:1528/123‑1 (MQ=255) cGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGc > 2:1528/1‑123 (MQ=255) cGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGt < 2:2174311/150‑1 (MQ=255) aTGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTgg < 1:1515159/150‑1 (MQ=255) tGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGc < 2:2106354/150‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCt < 1:1241564/150‑1 (MQ=255) cGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGc > 1:566780/1‑138 (MQ=255) cGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGc < 2:566780/138‑1 (MQ=255) gTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGACCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTTGCTGTa < 1:823851/150‑1 (MQ=255) gTAGAAGCGCGCCCGCACGACTTGGTAATGGTATTCAGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGATGCCAAACAGGACGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTa > 2:142744/1‑150 (MQ=255) tAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGAtcctcctcc < 2:160430/78‑1 (MQ=255) tAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGAtcctcctcc > 1:160430/1‑78 (MQ=255) tAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAg < 2:793003/150‑1 (MQ=255) gcgcCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAAcc < 1:1356182/150‑1 (MQ=255) cccGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCaa > 2:180959/1‑150 (MQ=255) ccGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAac > 2:400722/1‑150 (MQ=255) ccGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAac > 1:1683301/1‑150 (MQ=255) cGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAaca < 2:623396/150‑1 (MQ=255) gCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCa > 2:489890/1‑108 (MQ=255) gCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCa < 1:489890/108‑1 (MQ=255) aCGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAAACCAACACTg < 2:1189445/150‑1 (MQ=255) cGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGc > 2:146712/1‑150 (MQ=255) gCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGcc > 2:1974310/1‑150 (MQ=255) tACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTgg < 1:180959/150‑1 (MQ=255) ggTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATAAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGc < 1:2103756/150‑1 (MQ=255) ttCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCaa < 2:1957132/86‑1 (MQ=255) ttCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGCCGtt > 1:577152/1‑150 (MQ=255) ttCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCAGGTGCCaa > 1:1957132/1‑86 (MQ=255) ccGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGCCGTTGt < 2:413193/150‑1 (MQ=255) ccGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGCTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGCCGTTGt < 1:1378018/150‑1 (MQ=255) cGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGCCGTTGTc < 1:146712/150‑1 (MQ=255) cGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGCCGTTGTc > 2:730414/1‑150 (MQ=255) aGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGCCGTTGTCGAagc < 2:1080388/150‑1 (MQ=255) cccTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGCCGTTGTCGAagcgc < 1:730414/150‑1 (MQ=255) cccTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAAAACTCGCCTTGTGGGTGCCGTTGTCGAagcgc > 1:403/1‑150 (MQ=255) gatcatgatcatgatcatgaTCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGaaa < 2:259881/95‑1 (MQ=255) gatcatgatcatgatcatgaTCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGaaa > 1:259881/3‑97 (MQ=255) gatcatgatcatgatcatgaTCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTtgt < 2:991725/127‑1 (MQ=255) gatcatgatcatgatcatgaTCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTtgt > 1:991725/3‑129 (MQ=255) ccTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGCCGTTGTCGAagcgca > 2:2233308/1‑150 (MQ=255) cTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGtt > 2:2175171/1‑90 (MQ=255) cTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGtt < 1:2175171/90‑1 (MQ=255) tcatgatcatgatcatgaTCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAAt < 1:1061904/74‑1 (MQ=255) tcatgatcatgatcatgaTCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAAt > 2:1061904/1‑74 (MQ=255) tcatgatcatgatcatgaTCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGAt > 2:1529590/1‑83 (MQ=255) tcatgatcatgatcatgaTCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGAt < 1:1529590/83‑1 (MQ=255) tcatgatcatgatcatgaTCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGCCGTTGTCGAagcgcagc > 2:1037181/1‑150 (MQ=255) atcatgatcatgatcGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGCCGTTGTCGAAGCGCAGCGCCAg > 2:934782/1‑150 (MQ=255) tcatgatcatgatcGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGa > 2:2026681/1‑100 (MQ=255) tcatgatcatgatcGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGa < 1:2026681/100‑1 (MQ=255) tcatgatcatgatcGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGCCGTTGTCGAAGCGCAGCGCCAgg > 2:2084305/1‑150 (MQ=255) | TTCTTGGCTCGGGTATAGTCACCGGACAACTCCAGCGCGAAGCTGCCGTAACGGTTCTCGGCCAACTGCCAGCGGTCCTGGGCCTCGATGCCGTAGAAGCGCGCCCGCACGCCTTGGTACTGGTATTCCGGGAAGCCCTCATGATCATGATCATGATCGTGATCCTCCTCCTCATGGTCATGCTCGCCTTCGCGGGTGTTGCCGGTGCCAATCAGGCCGATGTAGTTGCGAAAGTGGCTGTAGAACAACCCAACACTGCCCTTGTGGGTGCCGTTGTCGAAGCGCAGCGCCAGG > NC_002947/1649390‑1649683 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |