| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,695,071 | C→G | 6.5% | A332G (GCC→GGC) | wspC → | biofilm formation methyltransferase WspC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,695,071 | 0 | C | G | 6.5% | 384.4 / 14.4 | 123 | A332G (GCC→GGC) | wspC | biofilm formation methyltransferase WspC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (52/63); new base G (4/4); total (56/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.22e-01 | |||||||||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
CACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCGCAAGGCC > NC_002947/1694922‑1695219 | cACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGc < 2:885573/150‑1 (MQ=255) gacgTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCaa > 1:1007653/1‑150 (MQ=255) gacgTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCaa > 1:1558605/1‑150 (MQ=255) gacgTTGCCCGCACCGGTTTATCCCGCGCCGCATAGGCCGGGCCCTCGTTCGCGGCGCGTGCTGCCGGTGGAAGCAA‑‑‑CCAGACACTACCAGTGGAGGTAGGGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCCTTGCCCGTCTGGCCaa > 1:1152165/1‑150 (MQ=255) cccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGt < 1:2369468/150‑1 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 2:278844/1‑150 (MQ=255) ccGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTg > 2:1820587/1‑150 (MQ=255) cGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGACCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCggcca < 1:714220/150‑4 (MQ=255) gCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGcc > 2:45497/1‑150 (MQ=255) gCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGcc > 2:2088511/1‑150 (MQ=255) cACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCa < 2:208558/150‑1 (MQ=255) ggTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGa < 2:756867/150‑1 (MQ=255) ggTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGa < 2:1355316/150‑1 (MQ=255) tATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAg > 2:76225‑M2/1‑149 (MQ=255) tCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGTCTTGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAggc > 1:1044698‑M2/1‑147 (MQ=255) tCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAggc > 1:2265068‑M2/1‑147 (MQ=255) tCCGCAGCCCAGTGTGCCGTAGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CACAAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAggc < 2:884858‑M2/150‑4 (MQ=255) cGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCAACGAGGGGGCCAGCGATTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAggccc < 1:892674‑M2/150‑6 (MQ=255) cGCAGCCAAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCCGCGAGCAggccc < 1:1001561‑M2/150‑6 (MQ=255) cAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGt > 2:1030192/1‑150 (MQ=255) cccAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGc > 2:2212606/1‑119 (MQ=255) cccAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGc < 1:2212606/119‑1 (MQ=255) gtgtGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAAt < 2:419532/150‑1 (MQ=255) gtgCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGc < 1:2088511/150‑1 (MQ=255) ggCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCCGCCGGTGGCGGCAAGCAACAA‑CGC‑AGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGcc < 2:675200/149‑1 (MQ=255) ccGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCa < 2:1463734/124‑1 (MQ=255) ccGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCa > 1:1463734/1‑124 (MQ=255) cGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAAc < 2:1848575/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAAc < 2:1145390/150‑1 (MQ=255) ttGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCACGCCCGTAGCGAATGCCAACGc > 2:1594052/1‑150 (MQ=255) gCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTa > 1:2408979/1‑150 (MQ=255) ccTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAc < 1:1235550/150‑1 (MQ=255) ccTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAc > 2:1235550/1‑150 (MQ=255) ccTCGTTCGCGGCGTGTGCGGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAc < 2:382498/150‑1 (MQ=255) cTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTAcc > 2:271036/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAg < 1:1752796/150‑1 (MQ=255) ttCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAAGGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCTAATGCCAACGACACCTGAg > 1:425901/1‑150 (MQ=255) tCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCGGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGc < 2:246809/150‑1 (MQ=255) gtgtGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑AGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTAcc > 1:1088059/1‑150 (MQ=255) ctgcCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCg < 2:2272100/94‑1 (MQ=38) tgcCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCCGTACCCGCCGt < 1:271036/150‑1 (MQ=255) tgcCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGt > 1:2107001/1‑150 (MQ=255) cGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGTCGGTGCCAGCGACCACGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCgg < 2:1818574/150‑1 (MQ=255) cGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAg > 2:854562/1‑137 (MQ=255) cGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAg < 1:854562/137‑1 (MQ=255) gTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGca < 2:429967/150‑1 (MQ=255) ggcggcCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGcaca < 1:1303799/150‑1 (MQ=255) gcggcCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCACTGCACGTGACAGCAGACGTGTGCTTTGCTGATTCCAACGCGACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAg < 1:45497/150‑1 (MQ=255) gcggcCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAg < 1:144929/150‑1 (MQ=255) ggccagg‑ccaG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGgt < 1:180068/150‑1 (MQ=255) 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gCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAAc > 1:1846937/1‑92 (MQ=255) cacaGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCTGCATTGCGAGGCCGGCGAATTCCGGTTCCATCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCTAACGCTACCTGAGCCCGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGt < 2:1130425/150‑1 (MQ=255) cacaGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGt < 1:793484/150‑1 (MQ=255) ccACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAggccccctcgtggctgtgctcgcgggctcgcgctggcctggccgccaccggcagcacacgccgcgaacgag > 2:1975280‑M2/1‑66 (MQ=255) ccACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAggccccctcgtggctgtgctcgcgggctcgcgctggcctggccgccaccggcagcacacgccgcgaacgag < 1:1975280‑M2/137‑72 (MQ=255) gAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGaa < 1:111696/150‑1 (MQ=255) 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cAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATgc > 1:2194627/1‑150 (MQ=255) cAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTAGCTGTTTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATgc > 2:1398072/1‑150 (MQ=255) gCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCa > 1:2391326/1‑129 (MQ=255) cGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCgca < 1:278844/150‑1 (MQ=255) gTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCgcagca < 1:1087905/150‑1 (MQ=255) tggcaccGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCG‑‑GCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgcgc > 2:289283/6‑150 (MQ=38) tgtccGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgcgc > 2:35810/4‑150 (MQ=255) tGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgcgc > 1:1532814/1‑150 (MQ=255) tGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGgcgc > 1:877677/1‑150 (MQ=255) gCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAg < 1:1078059/93‑1 (MQ=255) gCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAg > 2:1078059/1‑93 (MQ=255) accGGCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTc < 2:2132535/85‑1 (MQ=37) ccGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGa < 2:82538/150‑1 (MQ=255) cGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAg < 1:1820587/150‑1 (MQ=255) cGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAg > 1:888375/1‑150 (MQ=255) ggCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGc < 2:892674/150‑1 (MQ=255) gCATTGGCCAGCCGGGCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGcc > 1:1148688/1‑150 (MQ=255) cATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGtac > 2:2334793/1‑94 (MQ=255) cATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGtac < 1:2334793/94‑1 (MQ=255) cATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATgc > 2:2352124/1‑132 (MQ=255) cATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATgc < 1:2352124/132‑1 (MQ=255) cATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCa > 2:162430/1‑150 (MQ=255) ttGCCCGGCTTGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCt < 1:758498/109‑1 (MQ=255) tGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTa < 1:1030192/150‑1 (MQ=255) cccGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAgg < 2:1360693/121‑1 (MQ=255) cccGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAgg > 1:1360693/1‑121 (MQ=255) cccGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATc < 2:1088059/150‑1 (MQ=255) gCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCGCAAGGcc < 2:719947/150‑1 (MQ=255) | CACGACGTTGCCCGCACCGGTTTATCCGCAGCCCAGTGTGCCGTTGCCTCGTTCGCGGCGTGTGCTGCCGGTGGCGGCCAGG‑CCAG‑CGCGAGCCCGCGA‑GCACAGCCACGAGGGGGCCAGCGAGTTGCTGGCCGGCATTGCCCGGCTGGCCAATGCCGGTGCCAGCGAGCAGGCCCGTAGCGAATGCCAACGCTACCTGAGCCAGTACCCGCCGTCGGCACAGGTGTACTACTGGCTGGGTTTGCTCAGTGATACCGAAGGCGATGCGCAGCAGGCGCTGAGCCACTATCGCAAGGCC > NC_002947/1694922‑1695219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |