Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,713,557 | A→C | 5.9% | A153A (GCA→GCC) | tsaB → | endopeptidase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,713,557 | 0 | A | C | 5.9% | 259.3 / 6.4 | 85 | A153A (GCA→GCC) | tsaB | endopeptidase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (30/50); new base C (2/3); total (32/53) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.80e-01 |
TTGCGCGAGCATGGCGTGCAGCAGGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCTTTGCCTGGGCCCGTGGCGA > NC_002947/1713408‑1713703 | ttGCGCGAGCATGGCGTGCAGCAGGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAGAGTGTAAGGACACCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCggca > 2:1268953/1‑150 (MQ=255) gcgcGAGCATGGCGTGCAGCAGGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCggcagg < 1:2155352/150‑1 (MQ=255) tgAGCATGGCGGGCAGCCGGTGGCCGTTGCTATCAATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGTTACCAGGCCATAGCGGGCGAAATGCGCCTGTTGGGCTGTGAAGCGGTGTTGCCGCCCGAGCAGTTGGCGCTGCCGgaaggcag < 2:450689/149‑1 (MQ=255) gAGCATGGCGTGCAGCAGGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGgcagc > 2:1409896/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGGCGTGCAGCAGGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCTGCCGgcagc < 1:93414/150‑1 (MQ=255) tGGCGTGCAGCAGGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATgg < 1:1238562/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCAGCAGGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCTGCCGgcagcgccacc < 1:676852/150‑7 (MQ=255) ggCGTGCAGCAGGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGc < 2:1030033/150‑1 (MQ=255) cGTGCAGCAGGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGa < 2:460979/150‑1 (MQ=255) gTGCAGCAGGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCACCAATgcccag < 2:32665/150‑6 (MQ=255) gcagcaGGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTg < 2:2067869/150‑1 (MQ=255) gcagcaGGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTg < 1:754220/150‑1 (MQ=255) agcagGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGt < 2:1446921/150‑1 (MQ=255) agcagGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGt > 1:1428001/1‑150 (MQ=255) gggTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCg < 2:1800856/149‑1 (MQ=255) ctgaccGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGGCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGa > 2:1399665/5‑140 (MQ=255) ctgaccGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGGCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGa < 1:1399665/136‑1 (MQ=255) ggCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGc < 2:246738/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGcc < 1:800538/150‑1 (MQ=255) gCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGCGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGcc < 1:2294319/150‑1 (MQ=255) gCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGt > 2:1162523/1‑150 (MQ=255) tGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTAc < 1:1409896/150‑1 (MQ=255) tGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTAc < 2:1285035/150‑1 (MQ=255) ccATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCg > 2:1767125/1‑150 (MQ=255) cATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCgg < 2:1428001/150‑1 (MQ=255) aTCGATGCGCGCGTGGATAAAGACTACTGGGGATGCGACCAGGCCACAGCGGACGAAATACGACTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGAGGGTCGGTGCCGGTACCggg > 2:70022/1‑150 (MQ=255) aTCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCggg > 2:2128536/1‑150 (MQ=255) cGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTg < 1:21286/150‑1 (MQ=255) gATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTgg < 1:1165223/150‑1 (MQ=255) gATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTgg < 1:2321821/150‑1 (MQ=255) cATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGc < 2:1934866/150‑1 (MQ=255) ggATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGAAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTTCCTGGTGGGGCTATGCCgc < 2:594003/150‑2 (MQ=255) aTGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGGTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGTCGCTc > 2:509851/1‑150 (MQ=255) gAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGc > 1:769429/1‑150 (MQ=255) tttACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGTGCTGCCGGCAGGCAGAAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGGGGGGCTATGCCGATCGCCTgg > 2:1387531/1‑150 (MQ=255) tACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCg < 2:769429/150‑1 (MQ=255) cTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGt > 1:512160/1‑150 (MQ=255) tGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCTGCCGgcagcgcca < 2:2018015/97‑5 (MQ=255) tGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCTGCCGgcagcgcca > 1:2018015/1‑93 (MQ=255) tGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTa < 2:2148563/150‑1 (MQ=255) gggCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACa < 1:2128536/150‑1 (MQ=255) gggCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGCGGCACGTCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGAGTTGCGGATCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACa > 1:1740559/1‑150 (MQ=255) ggCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAg < 2:1937684/150‑1 (MQ=255) gctgctACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTCCAgg > 1:228936/1‑150 (MQ=255) gctgctACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAgg > 2:1330002/1‑150 (MQ=255) aCCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTa < 2:812425/121‑1 (MQ=255) aCCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTa > 1:812425/1‑121 (MQ=255) ccAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCgg > 2:1249970/1‑111 (MQ=255) ccAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCgg < 1:1249970/111‑1 (MQ=255) cAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAgcggcg > 2:548481/1‑150 (MQ=255) aGGNCACAGCGGGCGAAATCAGCCGTGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGNANCGGGTGGGGCTATGCNGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGa < 1:1330002/150‑1 (MQ=255) aGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGa < 2:2005346/150‑1 (MQ=255) aGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTAAGCCGAGCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGa < 1:1268953/150‑1 (MQ=255) ggCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTCACGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAg < 1:305557/150‑1 (MQ=255) cacaGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCAGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCaa < 1:1266564/150‑1 (MQ=255) ggCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCt < 1:182064/150‑1 (MQ=255) gAAATGCACCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGcc > 1:1100603/1‑150 (MQ=255) aaaTGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGCTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCt < 2:1740559/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCaa < 2:2218197/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAAt > 1:589613/1‑150 (MQ=255) tGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATg < 2:2306797/150‑1 (MQ=255) cGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGctct < 1:724311/150‑1 (MQ=255) ggCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTg > 1:1192969/1‑150 (MQ=255) gCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTgg > 2:2106465/1‑150 (MQ=255) ccGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGa < 1:1208056/150‑1 (MQ=255) ccGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGa < 1:468191/150‑1 (MQ=255) cGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGAc > 2:1771936/1‑150 (MQ=255) gCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATtctc > 2:770141/1‑150 (MQ=255) ccGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCggca < 2:22973/35‑1 (MQ=255) ccGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCggca > 1:22973/1‑35 (MQ=255) gtgtTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGc < 1:1162523/150‑1 (MQ=255) cgccCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTAc < 1:1609971/90‑1 (MQ=255) cgccCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTAc > 2:1609971/1‑90 (MQ=255) gccCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGGAATGGCGGGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCttggccc < 2:88217/150‑7 (MQ=255) ccGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCt > 1:72470/1‑150 (MQ=255) cGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCtt > 1:1006288/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCttt > 1:710427/1‑150 (MQ=255) gCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCTTTGc < 1:1767125/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCTTTGc < 1:204039/150‑1 (MQ=255) aGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCTTTGCCt < 2:512160/150‑1 (MQ=255) gTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTgg > 2:954548/1‑73 (MQ=255) gTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTgg < 1:954548/73‑1 (MQ=255) gTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCTGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCTTTGCCTgg < 1:770141/150‑1 (MQ=255) gTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCTTTGCCTgg < 1:2106465/150‑1 (MQ=255) attgcTGCCTGCCGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCTTTGCCTGGGc > 1:2180551/4‑150 (MQ=255) cTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACa < 2:1763908/118‑1 (MQ=255) cTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACa > 1:1763908/1‑118 (MQ=255) gCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCTTTGCCTGGGCCCGTgg < 2:72470/150‑1 (MQ=255) ccGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCTTTGCCTGGGCCCGTGGc < 1:854204/150‑1 (MQ=255) ccGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCTTTGCCTGGGCCCGTGGc > 1:1286010/1‑150 (MQ=255) ggcaggcaGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTTGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGATTATTTCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCTTTGCCTGGGCCCGTcgcgc < 2:369796/150‑2 (MQ=255) ggcaggcaGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCTTTGCCTGGGCCCGTGGCGa < 2:1100603/150‑1 (MQ=255) gcaggcagCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTg > 2:1427386/1‑108 (MQ=255) gcaggcagCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTg < 1:1427386/108‑1 (MQ=255) aggcagCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGctc > 2:221525/1‑104 (MQ=255) aggcagCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGctc < 1:221525/104‑1 (MQ=255) | TTGCGCGAGCATGGCGTGCAGCAGGTGGCCGCTGCCATCGATGCGCGCATGGATGAGGTTTACTGGGGCTGCTACCAGGCCACAGCGGGCGAAATGCGCCTGGTCGGCCGTGAAGCCGTGTTGCCGCCCGAGCAGGTGGCGCTGCCGGCAGGCAGCAATGGCGAGTGGTTCGGTGCCGGTACCGGGTGGGGCTATGCCGATCGCCTGGCGGTACAGGTAGCGGCGAGCAACCCGGCTGCCTTGCCCAATGCTCTGGACATTCTCAGCCTGGCCACCTTTGCCTGGGCCCGTGGCGA > NC_002947/1713408‑1713703 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |