Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,726,530 | A→T | 12.1% | L559Q (CTG→CAG) | plsB ← | glycerol‑3‑phosphate acyltransferase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,726,530 | 0 | A | T | 12.1% | 277.9 / 23.1 | 98 | L559Q (CTG→CAG) | plsB | glycerol‑3‑phosphate acyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (41/44); new base T (8/4); total (50/48) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.56e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GCACCGCGTTGCCTTCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGTTTCTCCCAGGCGGGCG > NC_002947/1726381‑1726679 | gCACCGCGTTGCCTTCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCgcagca > 1:1794474/1‑150 (MQ=255) gCACCGCGTTGCCTTCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCgcagca > 1:2226711/1‑150 (MQ=255) aCCGCGTTGCCTTCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGAGAGTAGGGCACTTGGCGCtgctgc > 1:1356556/1‑150 (MQ=255) cgcgTTGCCTTCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAgcgc > 1:1950431/1‑150 (MQ=255) gTTGCCTTCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAg > 1:918537/1‑150 (MQ=255) gTTGCCTTCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAg < 2:212468/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTTCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAg < 1:1176937/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTTCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAg < 2:1950431/150‑1 (MQ=255) gTTGCCTTCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGAGAGTAGGGCACTTGGCGCTGCTGCGCCaa < 2:1356556/150‑2 (MQ=255) gtctgcATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCTGCTGCGCCAAGtg < 2:727881/145‑2 (MQ=255) ccTTCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTAc > 2:1877435/1‑150 (MQ=255) cTTCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACAGGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACa > 1:1976645/1‑150 (MQ=255) ttCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAg < 1:1046764/150‑1 (MQ=255) tCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAgg < 2:619976/150‑1 (MQ=255) cATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGt < 2:2389476/150‑1 (MQ=255) ccAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGa < 1:393039/150‑1 (MQ=255) ccAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGa < 2:338541/150‑1 (MQ=255) ccAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGa < 1:1877435/150‑1 (MQ=255) ccAGGTAGAGGATGCAGCCCTGGGCGTTCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCACGCTGCGCACATGTCCGTTAAGTGCCTGGCCGCCCCCCTGGGGCAGCGTGGTATGCGGGGTGTAGGGCACTTGGGGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGa < 2:738558/150‑1 (MQ=255) cAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCGCCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAg < 1:869568/150‑1 (MQ=255) agagGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGTCAGGGTGGTGTGCGTCCTGTAGGGCGCGTTGCGTAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTAcgc < 2:276991/150‑1 (MQ=255) gagGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCTGCTGCGCCaa < 2:1598580/132‑2 (MQ=255) gagGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCTGCTGCGCCaa > 1:1598580/1‑131 (MQ=255) gagGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTAcgcg < 1:732750/150‑1 (MQ=255) aGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGgcgcgc < 2:239306/150‑1 (MQ=255) ggCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTc < 2:1796810/150‑1 (MQ=255) gTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTc < 1:1088620/150‑1 (MQ=255) ccTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCa > 1:665028/1‑150 (MQ=255) cTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCgg < 2:481514/130‑1 (MQ=255) cTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCgg > 1:481514/1‑130 (MQ=255) ttCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCCGTGCCTGCCCGTCGCCCTCGGGCAGGGCGGTGTGCGGCGCGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTGCAgg > 1:1041744/1‑150 (MQ=255) ttCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAgg < 1:79671/150‑1 (MQ=255) ttCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAgg < 2:2226711/150‑1 (MQ=255) tCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAgg > 1:1732838/1‑150 (MQ=255) ccaccaGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAggcggc > 1:563743/1‑150 (MQ=255) caGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCtggt > 1:1673429/1‑150 (MQ=255) gTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGa > 1:828429/1‑150 (MQ=255) ttCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGAc > 1:640085/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGCGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGAcagca > 2:1183257/1‑150 (MQ=255) ctgcGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGt < 1:1183257/150‑1 (MQ=255) gcgcACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGc < 2:665028/150‑1 (MQ=255) gcACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGgc > 1:1027885/1‑109 (MQ=255) gcACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGgc < 2:1027885/109‑1 (MQ=255) acaTGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAgg < 2:640085/150‑1 (MQ=255) caTGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAgg < 1:389360/119‑1 (MQ=255) caTGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAgg > 2:389360/1‑119 (MQ=255) aTGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGc < 2:1794474/150‑1 (MQ=255) gTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGcca > 2:364105/1‑150 (MQ=255) gATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCTGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTGAGGGCGCGCTCGTCCAGGGGCAGGCCGCTGTTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAg < 1:1396625/150‑1 (MQ=255) gATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAgg < 1:504987/97‑1 (MQ=255) gATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAgg > 2:504987/1‑97 (MQ=255) 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cTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAg < 1:607622/129‑1 (MQ=255) cTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAg > 2:607622/1‑129 (MQ=255) tCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCggg > 2:482192/1‑138 (MQ=255) tCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCggg < 1:482192/138‑1 (MQ=255) gggCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGgccgc > 1:2326952/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCt > 2:2247886/1‑150 (MQ=255) aGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCg > 1:66849/1‑150 (MQ=255) ggtggtGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGtt < 2:834595/150‑1 (MQ=255) tggtgTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGa < 2:1037810/150‑1 (MQ=255) gtgtGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAgg < 1:364105/150‑1 (MQ=255) gtgCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCTGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTg > 1:1868535/1‑150 (MQ=255) gtgCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTg < 2:2326952/150‑1 (MQ=255) tgtacctGGCGCTGCTGCGCCAAGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAgg > 1:1292016/7‑135 (MQ=255) tgtacctGGCGCTGCTGCGCCAAGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAgg < 2:1292016/129‑1 (MQ=255) gCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGttt < 2:66849/150‑1 (MQ=255) cACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGCTGATGGCGGCCGGCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGTTtc > 2:571033/1‑150 (MQ=255) aCTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACCCTGATTCCGGACCCAGCAGGTGGGCCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGGGGCGGGCCACGGTTtct > 1:1852894/1‑150 (MQ=255) cctGGCGCTGCTGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCACCGCGGTGATGTGGCGGGCCACGGTTtctc > 2:1508616/3‑150 (MQ=255) cTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGTTtctc < 1:502934/150‑1 (MQ=255) cTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGTTtctc < 2:704285/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGa < 1:1910181/128‑1 (MQ=255) ttGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGa > 2:1910181/1‑128 (MQ=255) ctGGCGCTGCTGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCGGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGTTTCTcc > 1:147596/2‑150 (MQ=255) ctGGCGCTGCTGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGTTTCTcc > 1:2188564/2‑150 (MQ=255) ctGGCGCTGCTGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGCCCACGGTTTCTcc > 1:101618/2‑150 (MQ=255) ctGGCGCTGCTGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTCCGGTCGCGCGCCACGGTTTCTcc > 2:912114/2‑150 (MQ=255) gcagcaGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGTTTCTCCCAggc > 2:1918665/1‑150 (MQ=255) agcagcGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGCCCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGTTTCTCCCAggcgg < 1:807643/150‑1 (MQ=255) agcagcGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGTTTCTCCCa > 2:56772/1‑145 (MQ=255) agcagcGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGTTTCTCCCa < 1:56772/145‑1 (MQ=255) gcagcGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGTTTCTCCCAggcggg < 2:1732838/150‑1 (MQ=255) agcGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGTTTCTCCCAggcgggcg < 1:457256/150‑1 (MQ=255) | GCACCGCGTTGCCTTCATCCAGGTAGAGGATGCGGCCCAGGGCGTCCTTCTGCTCGGCCACCAGGTTCATGCTGCGCACATGTTCGATCAGTGCCTGGCCGTCGCCCTCGGGCAGGGTGGTGTGCGGCGAGTAGGGCACTTGGCGCAGCAGCGCCAGGTACAGGTCGAGTACGCGGGTCAGGGCGCGCTCGTCCAGGGCAAGGCGGCTGGTGGACAGCAGTGCCAGGGCCACCAGGTTGACCGGGTTGATGGCGGCCGCCTCGTTGAGGTGGCGGGCCACGGTTTCTCCCAGGCGGGCG > NC_002947/1726381‑1726679 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |