| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,791,876 | G→C | 7.3% | G162R (GGT→CGT) | rseP → | regulatory intramembrane protein RIP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,791,876 | 0 | G | C | 7.3% | 302.3 / 12.7 | 98 | G162R (GGT→CGT) | rseP | regulatory intramembrane protein RIP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/45); new base C (3/4); total (47/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.52e-01 | |||||||||||
TGGCTATCCTGTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCCGACGAGCCGGAC > NC_002947/1791727‑1792022 | tgGCTATCCTGTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGAGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACg > 1:982337/1‑150 (MQ=255) ggCTATCCTGTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGCACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACgg > 2:2184344/1‑150 (MQ=255) gCTATCCTGTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGt < 2:1894167/150‑1 (MQ=255) tCCTGTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGt < 2:2219281/150‑1 (MQ=255) tGTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTcgg > 1:1923751/1‑150 (MQ=255) tGTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGACGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCCAGCCGACCAACGGTTGGTcgg > 1:1135186/1‑150 (MQ=255) gTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTcggc < 1:1060766/150‑1 (MQ=255) tttttCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTcggcg < 1:692437/150‑1 (MQ=255) tttttCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTcggcg > 1:950979/1‑150 (MQ=255) tttttCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTcggcg < 2:1506533/150‑1 (MQ=255) ttttCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGACTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACCGTTGGTcggctt < 1:1626985/150‑3 (MQ=255) tttCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGCTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACCGTTGGTcggcttg < 1:728669/150‑4 (MQ=255) gggTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAAtt > 1:689606/1‑150 (MQ=255) gCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGTTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCa < 2:400997/150‑1 (MQ=255) gCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTcggc < 1:118636/134‑1 (MQ=255) gCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTcggc > 2:118636/1‑134 (MQ=255) cGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTgg > 2:1320021/1‑150 (MQ=255) atttGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGtt > 2:939670/4‑126 (MQ=255) atttGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGtt < 1:939670/123‑1 (MQ=255) aTGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGtt > 2:1682350/1‑150 (MQ=255) tGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTtcgtc > 1:1760042/1‑150 (MQ=255) cccAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTgg < 1:2184344/150‑1 (MQ=255) cccAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTgg < 1:2356880/150‑1 (MQ=255) cccAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTgg < 2:950979/150‑1 (MQ=255) cAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGc > 2:721014/1‑150 (MQ=255) cAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGc > 2:1808348/1‑150 (MQ=255) cAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGc > 2:1992037/1‑150 (MQ=255) aGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCg > 2:1520970/1‑150 (MQ=255) gCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCga < 2:1785161/150‑1 (MQ=255) aaaTCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCgaga > 1:890643/1‑150 (MQ=255) tCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCg > 2:768566/1‑150 (MQ=255) ggTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCtt > 1:2395305/1‑150 (MQ=255) gTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTg < 2:988833/150‑1 (MQ=255) tCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGa < 1:1682350/150‑1 (MQ=255) ggCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGAtt < 2:689606/150‑1 (MQ=255) ggCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACCGTTGGTcggc < 2:202332/98‑1 (MQ=255) ggCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACCGTTGGTcggc > 1:202332/1‑98 (MQ=255) gcgcGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGGTGACGGCGGGTTAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACTGTTGGTTGGCGGTCAATTTGCATCTGGTTCGTCGTCTCTGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTg < 2:568242/150‑1 (MQ=255) gcgGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGc < 1:344789/150‑1 (MQ=255) gcgGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGc < 2:2291835/150‑1 (MQ=255) gcgGTCGACAGGGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGc < 1:1647440/150‑1 (MQ=255) gTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAg > 1:944616/1‑105 (MQ=255) gTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAg < 2:944616/105‑1 (MQ=255) gtacttgTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCACGGGTGAGGAAATCGCTTCTGGGGATGGCAATCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAACTTGCAGCTGGTTCGACGTCTGGGCGAGAGCGGTACATTCCAGATTGGCGTgg > 2:170316/7‑149 (MQ=255) cGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTgcg < 2:2208251/150‑1 (MQ=255) aCAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACCGTTGGTcgg < 1:1420997/87‑1 (MQ=255) aCAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACCGTTGGTcgg > 2:1420997/1‑87 (MQ=255) aGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGAt < 1:1520970/150‑1 (MQ=255) tGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGa < 2:2247058/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAg < 1:1320021/150‑1 (MQ=255) gcaagcTGGGAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGTCAGCCGACCAATTGTTCGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAgg < 1:170316/145‑1 (MQ=255) gCAGCCTGGCAGCATCTGCAGTGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGc > 1:804531/1‑137 (MQ=255) 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gcaTCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGcc < 1:721014/150‑1 (MQ=255) tCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAg < 2:890643/150‑1 (MQ=255) tGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGAAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAgcg > 1:1322523/1‑150 (MQ=255) gCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAgcgc > 2:542934/1‑150 (MQ=255) cAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGcc > 1:974548/1‑150 (MQ=255) 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1:131373/1‑150 (MQ=255) cTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCa > 2:1617671/1‑150 (MQ=255) cTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCa > 1:1685273/1‑150 (MQ=255) tgGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTg > 1:1304252/1‑84 (MQ=255) tgGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTg < 2:1304252/84‑1 (MQ=255) gATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGa > 2:1970649/1‑134 (MQ=255) gATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGa < 1:1970649/134‑1 (MQ=255) gATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGgc > 1:1383210/1‑150 (MQ=255) gATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGgc < 1:846805/150‑1 (MQ=255) gATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGgc > 2:847220/1‑150 (MQ=255) gATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGgc < 1:907713/150‑1 (MQ=255) ggCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTg < 1:1721009/137‑1 (MQ=255) ggCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCAAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTg > 2:1721009/1‑137 (MQ=255) gCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCa > 1:2235371/1‑73 (MQ=255) gCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCa < 2:2235371/73‑1 (MQ=255) cAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCCGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCcga > 1:287077/1‑150 (MQ=255) aGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGATGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCcgacg > 1:898007/1‑150 (MQ=255) aGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGccttcg < 2:2146684/150‑5 (MQ=255) 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aaCGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCCGACGAGcc < 2:1185839/146‑1 (MQ=255) aaCGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCCGACGAGcc > 1:1185839/1‑146 (MQ=255) aaCGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCCGACGAGCCGGAc < 2:709538/150‑1 (MQ=255) | TGGCTATCCTGTTTTTCTGGGTGCTGGCGATGCTGGGTACCCAGCAAATCCGCCCGGTTATCGGCGCGGTCGACAGTGGCAGCCTGGCAGCATCTGCAGGGCTGACCGCGGGTCAGGAAATTGTTTCTGTGGATGGCAAGCCGACCAACGGTTGGTCGGCGGTCAATTTGCAGCTGGTTCGTCGTCTGGGCGAGAGCGGTACCTTGCAGATTGGCGTGCGCGATGAGGGCGCCAGCGCCGAGCGCCAGCTGCAGGTCAAGCTGGACAGTTGGCTCAAGGGCGCCGACGAGCCGGAC > NC_002947/1791727‑1792022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |