Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,845,825 | T→C | 9.6% | L25P (CTC→CCC) | pfeS‑II → | histidine kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,845,825 | 0 | T | C | 9.6% | 199.6 / 9.0 | 74 | L25P (CTC→CCC) | pfeS‑II | histidine kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/32); new base C (3/4); total (38/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.11e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.51e-01 |
GTTATCACGAACGGCAGATCCGCACCGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGC > NC_002947/1845678‑1845974 | gTTATCACGAACGGCAGATCCGCACCGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCa > 2:1705035/1‑150 (MQ=255) tCACGAACGGCAGATCCGCACCGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTta > 1:1247246/1‑150 (MQ=255) aCGAACGGCAGATCCGCACCGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCGGGCTGCTGATGATAGGACTCAGTtata > 2:911447/1‑150 (MQ=255) cGAACGGCAGGTCCGCACCGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATAc < 2:1632338/150‑1 (MQ=255) aCGGCAGATCCGCACCGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTg < 2:829334/150‑1 (MQ=255) cGGCAGATCCGCACCGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGCGCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTgg < 1:159671/150‑1 (MQ=255) cAGATCCGCACCGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCCCAGGTATAACTGAGGc < 1:988372/150‑1 (MQ=255) gATCCGCACCGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCCCAGGTATAACTGAGGCCg < 1:1822959/150‑1 (MQ=255) tCCGCACCGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCCCAGGTATAACTGAGGCCgat < 1:595597/150‑3 (MQ=255) cacaGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTgg < 2:522879/139‑1 (MQ=255) cACCGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTgg > 1:522879/1‑139 (MQ=255) cACCGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACAt < 1:2229878/150‑1 (MQ=255) tgtgGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGaaa < 1:875377/150‑1 (MQ=255) ggCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCCCAGGTATAACTGAGGcc < 2:309360/133‑1 (MQ=255) ggCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCCCAGGTATAACTGAGGcc > 1:309360/1‑133 (MQ=255) gCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGc > 1:1524282/1‑131 (MQ=255) gCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGc < 2:1524282/131‑1 (MQ=255) gCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGa < 1:728827/150‑1 (MQ=255) aaGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAAc < 1:1881820/143‑1 (MQ=255) aaGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGACTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAAc > 2:1881820/1‑143 (MQ=255) ggTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGcc < 2:1145027/150‑1 (MQ=255) tACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCATCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTc < 2:1220116/150‑1 (MQ=255) gTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCctc < 2:2355523/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAACCCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCg < 2:826989/150‑1 (MQ=255) gCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCAc > 2:894449/1‑150 (MQ=255) ggCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCa < 1:1081693/150‑1 (MQ=255) gCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAg > 1:643766/1‑150 (MQ=255) ggAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCCGAc < 2:643766/150‑1 (MQ=255) aaCCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCg > 2:1979339/1‑150 (MQ=255) aaCCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCg > 2:1313409/1‑150 (MQ=255) aaCCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCg < 1:1705035/150‑1 (MQ=255) aaCCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTAGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATTAAGACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCg > 2:273918/1‑150 (MQ=255) ccATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCggg < 2:777530/150‑1 (MQ=255) cATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCgggg > 1:320047/1‑150 (MQ=255) cATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCgggg > 1:767746/1‑150 (MQ=255) tGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAAt > 1:1629307/1‑110 (MQ=255) tGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAAt < 2:1629307/110‑1 (MQ=255) cTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTAt < 1:210830/150‑1 (MQ=255) cGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATgc < 1:61943/150‑1 (MQ=255) cGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATgccgcc > 2:1492903/1‑150 (MQ=255) cGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTATGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTGGGAGCCGGCACGCCAGTCCTTGCGGGGTTATgccgcc > 1:1691871/1‑150 (MQ=255) cATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGaa < 2:767746/150‑1 (MQ=255) ttCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGc > 1:442501/1‑150 (MQ=255) ttCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAg > 2:1689457/1‑150 (MQ=255) ctCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTACTGCCAATAGGGCGCAGTTGTACCTGTTGCCGTCACATGGAAACCCAGACTGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTCCGGGGTTATGCCGCCGCAGCTGAACAg > 1:1855708/2‑150 (MQ=255) ggCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGcc < 1:426326/82‑1 (MQ=255) ggCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGcc > 2:426326/1‑82 (MQ=255) gCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGt > 2:2196471/1‑150 (MQ=255) cATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTgg < 1:2138910/52‑1 (MQ=255) cATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTgg > 2:2138910/1‑52 (MQ=255) ttGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTggcggg > 2:300688/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTggcgggcg < 2:320047/150‑1 (MQ=255) ggtggGCTTCTGCCTGCTGATTATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCCGCACATGGAAACCGCGATTGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCGCAACAGGCCTGGCGCCGTGGCgggcgggc < 2:654497/150‑1 (MQ=255) gtggGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCa > 1:1547190/1‑150 (MQ=255) ggCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGATGCTTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAggg < 1:1979339/150‑1 (MQ=255) gCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGc > 1:1700274/1‑150 (MQ=255) ttCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGc < 2:382039/148‑1 (MQ=255) ttCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGc > 1:382039/1‑148 (MQ=255) ttCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTg > 2:1734004/1‑150 (MQ=255) ttCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTg < 1:1070581/150‑1 (MQ=255) tCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTgg < 1:300688/150‑1 (MQ=255) gcctgcTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCg < 1:1776714/74‑1 (MQ=255) gcctgcTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCg > 2:1776714/1‑74 (MQ=255) tgctgATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGACAGCAAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAgt > 1:2097096/1‑150 (MQ=255) gctgATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAgtg > 2:2208172/1‑150 (MQ=255) atgatCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCa < 2:1782080/44‑1 (MQ=255) atgatCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCa > 1:1782080/1‑44 (MQ=255) tCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGATGTTGCGTGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTggcgg > 1:542358/1‑150 (MQ=255) cGGCCCCAGGTATAACTGAGGCCGGCACCGCGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTggcggc > 1:1268968/1‑150 (MQ=255) ggCCCCAGGTATAACTGAGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACAAGTGGGGGGCGGcc > 2:460568/1‑150 (MQ=255) gCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCa > 2:422634/1‑150 (MQ=255) ccTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCAt < 2:1247246/150‑1 (MQ=255) cTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATg > 1:112986/1‑150 (MQ=255) cTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATg > 1:346020/1‑150 (MQ=255) tCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGTAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGc < 1:1145417/150‑1 (MQ=255) | GTTATCACGAACGGCAGATCCGCACCGTGTGGGGCAAGGGTTACGTGCTCAGTGCCAGCGAGGCGGAGTGAACCATGCTCGACCGCCATTCGCTGTTCTGGAAGCTGGCCATCTTGCTGGTGGGCTTCTGCCTGCTGATGATCGGCCTCAGTTATACCTGGGGCCGGCACATGGAAACCCAGAATGCCTTCCTCTCGGAGCCGGCACGCCAGACCTTGCGGGGTTATGCCGCCGAAGCTGAACAGGCCTGGCGCAGTGGCGGGCGGGCAGGGCTGGACCAGTGGGTGGCGGCCATGC > NC_002947/1845678‑1845974 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |