Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_002947 | 1,859,156 | A→T | 8.2% | intergenic (+34/+67) | PP_1661 → / ← PP_1662 | dehydrogenase/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,859,156 | 0 | A | T | 8.2% | 409.8 / 19.5 | 132 | intergenic (+34/+67) | PP_1661/PP_1662 | dehydrogenase/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (64/57); new base T (4/7); total (68/64) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.55e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
CCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGAACATGCCC > NC_002947/1859008‑1859304 | ccAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAAt > 1:1382777/1‑150 (MQ=255) cAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATg > 2:1523649/1‑150 (MQ=255) aGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATAGCAACCCCAAAATGCTGCGGCATTGCCgga < 2:197368/150‑3 (MQ=255) ggTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCgcag > 1:1585780/1‑150 (MQ=255) ttGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCAtttt > 1:1274869/1‑150 (MQ=255) gCAGCTGTGCATCCATGACGAACTGGACGGCCGTTACGGGCGTCGCGTGATCGATAACCTGGTCAGCCTGTCTGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCCGCAATGCCGCAGCATTTTgg > 2:1834944/1‑150 (MQ=255) gCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCTGCGGCAttgccg < 1:568322/150‑5 (MQ=255) gCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCAAAATGCTGCGGCATTGCCGGAGCAtcgtgg < 2:2000566/150‑6 (MQ=38) cAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCAAAATGCTGCGGCATTGCCGGAGCAtcgtggg < 2:1773081/150‑7 (MQ=38) cTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGtt > 2:1282639/1‑150 (MQ=255) gCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATAGCAACCCCAAAATGCTGCGGCATTGCCGGAGCATCGTGGGGTTGcca < 2:849330/150‑3 (MQ=37) cATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGTGGGGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCa < 1:1021105/150‑1 (MQ=255) cATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCa < 2:1936750/150‑1 (MQ=255) aTCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCTGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTggg < 1:1752812/141‑1 (MQ=255) aTCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCTGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTggg > 2:1752812/1‑141 (MQ=255) aTCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCAc > 2:244065/1‑150 (MQ=255) ccTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGc < 1:1518038/150‑1 (MQ=255) ccTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGc < 2:2369612/150‑1 (MQ=255) tGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGa < 2:2246198/150‑1 (MQ=255) tGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGa < 1:20445/150‑1 (MQ=255) cGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCa > 2:2283938/1‑150 (MQ=255) gCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAggg < 1:1523649/150‑1 (MQ=255) gCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAggg < 2:301365/150‑1 (MQ=255) gTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGt < 1:1282639/150‑1 (MQ=255) tACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTc < 2:2036319/150‑1 (MQ=255) tACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTc < 1:2283938/150‑1 (MQ=255) tGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAgggg > 1:900727/1‑139 (MQ=255) tGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAgggg < 2:900727/139‑1 (MQ=255) tGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAAt < 2:332921/150‑1 (MQ=255) tGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAAt > 2:577698/1‑150 (MQ=255) gCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATgg < 1:2197862/150‑1 (MQ=255) tGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCa > 2:1564905/1‑150 (MQ=255) tGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCa > 1:301870/1‑150 (MQ=255) tGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCa < 1:411496/150‑1 (MQ=255) gAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAg < 1:1937603/150‑1 (MQ=255) aGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAgg > 1:1051342/1‑150 (MQ=255) aGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCACCGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTGTTTGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAgg < 1:296487/150‑1 (MQ=255) gCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGGTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAggg < 2:1127861/150‑1 (MQ=255) gATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTc > 2:951188/1‑150 (MQ=255) tAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCAt > 2:2082257/1‑150 (MQ=255) cccggggCTGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTGTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGGATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATtg < 2:333300/146‑1 (MQ=255) ccTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATtgt > 1:2227439/1‑150 (MQ=255) cTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCt < 1:1181285/99‑1 (MQ=255) cTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCt > 2:1181285/1‑99 (MQ=255) cTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCCGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATtgtg > 2:774636/1‑150 (MQ=255) tGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATtgtgt < 2:2167308/150‑1 (MQ=255) gggCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATtgtgtg < 1:951188/150‑1 (MQ=255) aGCCTGTCGTTATAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGgcgc > 2:602713/1‑150 (MQ=255) cTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCt > 2:2084405/1‑150 (MQ=255) 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gTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGt > 2:21058/1‑150 (MQ=255) tttCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCa > 2:1759704/1‑150 (MQ=255) ttCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCaa < 1:1759704/150‑1 (MQ=255) gCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCaa < 2:2009737/100‑1 (MQ=255) gCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCaa > 1:2009737/1‑100 (MQ=255) gCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCaa > 2:2012175/1‑150 (MQ=255) 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gTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGgtgt < 2:1933551/150‑1 (MQ=255) ggCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTc < 1:555091/150‑1 (MQ=255) gCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCg > 2:8567/1‑150 (MQ=255) gCAACCCCAAAATGCTGCGGCATTGCCGGAGCATCGTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCg > 2:591188/1‑150 (MQ=38) aaCCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCgg > 2:1584014/1‑133 (MQ=255) aaCCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCgg < 1:1584014/133‑1 (MQ=255) aCCCCACGATGATCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCgtgt > 2:1793105/1‑150 (MQ=255) cccACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTc > 2:1395952/1‑150 (MQ=255) ccaaaaTGCTGCGGCATTGCCGGAGCATCGTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTc > 1:2105546/6‑149 (MQ=38) ccACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATtgtgtg < 1:1908791/93‑1 (MQ=255) aCGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCAtt > 1:1065495/1‑86 (MQ=255) aCGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCAtt < 2:1065495/86‑1 (MQ=255) cGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTa < 1:774636/150‑1 (MQ=255) gATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGTTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTAt < 1:185185/150‑1 (MQ=255) gATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCCCTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTAt < 1:1109378/150‑1 (MQ=255) tgctgcGGCATTGCCGGAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATgg < 1:1262706/150‑1 (MQ=255) tGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGATTCGTGTTCGTTATgg < 1:8567/150‑1 (MQ=255) tCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGTTCGTGGTGTGGCGCGCTGGTCCTGACGGTCCTAATGCTTAGCTCTGTTTTGGTGTGCTTCTTGTTGGTTATGGAAc > 1:2341243/1‑150 (MQ=255) tCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGAAc > 1:352379/1‑150 (MQ=255) gCAATGCCGCAGCATTTTGGTGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAAGTGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCGTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGAACATGc < 1:1564905/150‑1 (MQ=255) cAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGgtgt > 1:802519/1‑124 (MQ=255) cAATGCCGCAGCATTGTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGgtgt < 2:802519/124‑1 (MQ=255) | CCAGCAAGGTGAGTTGCAGCTGTGCATCAATGACGACCTGGACGGGCGTTACGGGGCTGGCCTGAGCGATAACCTGGGCAGCCTGTCGGTAGAGGTGCGTTTCGGGGCGGTGTAGGCCCTGTCATGGCAACCCCACGATGCTCCGGCAATGCCGCAGCATTTTGGGGTTGCTCACTGAGCCCAGGCGAGTCAGGGGTTCGCCGCAATGGGCAGGGTCATTGTGTGGCGCGCTGGTTTTCCAGGTCTTCAAGCTCAACGCGGTATTGGTGTGCTTCGTGTTCGTTATGGAACATGCCC > NC_002947/1859008‑1859304 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |