Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,872,278 | T→A | 5.4% | L174Q (CTG→CAG) | cobQ → | adenosyl‑cobyric acid synthase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,872,278 | 0 | T | A | 5.4% | 293.8 / 5.9 | 93 | L174Q (CTG→CAG) | cobQ | adenosyl‑cobyric acid synthase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/45); new base A (2/3); total (44/49) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.35e-01 |
CCGGTGGTCATGGTCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCGGCAAACCGGTACTGGGC > NC_002947/1872133‑1872420 | ccGGTGGTCATGGTCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCtggtg > 2:328377/1‑150 (MQ=255) ccGGTGGTCATGGTCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACACGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCtggtt > 2:293376/1‑149 (MQ=255) gtggtCATGGTCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGc > 1:1112039/1‑150 (MQ=255) tggtCATGGTCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCAGGTGGGcg < 2:831100/150‑2 (MQ=255) gtCATGGTCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACg > 1:1490598/1‑150 (MQ=255) gtCATGGTCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACg > 2:1026559/1‑150 (MQ=255) gtCATGGTCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACg > 1:2031727/1‑150 (MQ=255) tCATGGTCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGc > 1:2397818/1‑150 (MQ=255) tCATGGTCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCAGGTGGGcga < 1:743084/148‑3 (MQ=255) tCATGGTCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCAGGTGGGcga > 2:743084/1‑146 (MQ=255) agggTCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACACGGGCTTTGCCGAAGCGGCGGACTGTCCGGTGAGCCTGGTGGCCGACAGCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTg < 2:274183/148‑1 (MQ=255) ggTGGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGCTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGa < 2:403000/150‑1 (MQ=255) tCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAAt > 2:134926/1‑150 (MQ=255) tCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAAt > 2:2057539/1‑150 (MQ=255) gAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTg > 1:968250/1‑150 (MQ=255) ggggCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTg > 1:679302/1‑150 (MQ=255) gggCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCGCCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGt < 2:2086234/150‑1 (MQ=255) gggCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGt < 2:1112039/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCa < 2:2031727/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACt < 2:1444893/150‑1 (MQ=255) tCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGGGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACt > 2:853514/1‑150 (MQ=255) cGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAAc > 1:330255/1‑150 (MQ=255) gCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAg < 1:1817921/150‑1 (MQ=255) agagATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGgc > 2:186684/1‑150 (MQ=255) gaTCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCAGGTGGGcgaa < 2:804407/118‑4 (MQ=255) gaTCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACAGCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCAGGTGGGcgaa > 1:804407/1‑115 (MQ=255) aTCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCgg < 2:459827/150‑1 (MQ=255) cAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGt < 2:679302/150‑1 (MQ=255) cAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGt < 1:2323290/150‑1 (MQ=255) ccgtcgCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCgg > 2:504360/6‑147 (MQ=255) ccgtcgCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCgg < 1:504360/142‑1 (MQ=255) aCCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATGTCTTTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCa > 2:266405/1‑150 (MQ=255) cTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCaaa > 1:1073731/1‑150 (MQ=255) cTGCGTGCAGGAGAAATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCACGGTGATCCTGGTGGCCGACATCACCCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCaaa < 2:236570/150‑1 (MQ=255) gTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGCCGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGtt < 1:1230842/150‑1 (MQ=255) ggCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGtc < 1:1961790/150‑1 (MQ=255) ggCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGtc > 1:1702890/1‑150 (MQ=255) gCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGtca < 1:813443/150‑1 (MQ=255) cGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGtcat < 2:1490598/150‑1 (MQ=255) atatCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTTCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGtcatca > 2:878943/1‑150 (MQ=255) atatCGACAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTg > 1:668856/1‑101 (MQ=255) atatCGACAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTg < 2:668856/101‑1 (MQ=255) gCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCCACCGc > 1:176840/1‑150 (MQ=255) ccAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCaaa > 1:594579/1‑131 (MQ=255) ccAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCaaa < 2:594579/131‑1 (MQ=255) cAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCtt > 1:546881/1‑150 (MQ=255) aTGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGt > 1:1839356/1‑150 (MQ=255) gggCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTgg < 2:1839054/150‑1 (MQ=255) ggCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGc < 2:330255/150‑1 (MQ=255) tGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACAt < 1:328377/150‑1 (MQ=255) ccGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTg > 1:200554/1‑150 (MQ=255) cGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGc > 1:82373/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGTGGCCTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCAACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGct > 2:499744/1‑150 (MQ=255) gAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGct < 1:1880113/150‑1 (MQ=255) gAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGct > 1:372516/1‑150 (MQ=255) aaGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGctc < 1:1026559/150‑1 (MQ=255) aaGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGctc < 1:809689/150‑1 (MQ=255) tGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCtgctgc > 1:2379453/1‑150 (MQ=255) ggACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCa < 2:546881/150‑1 (MQ=255) gACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAg > 2:297101/1‑150 (MQ=255) tGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCa < 2:1073731/150‑1 (MQ=255) tGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCa > 2:717885/1‑150 (MQ=255) ggTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCt > 2:721762/1‑150 (MQ=255) ttCCTGGTGGCGGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCCCCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGCCATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGAc < 2:1260506/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAg > 2:55444/1‑91 (MQ=255) cTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAg < 1:55444/91‑1 (MQ=255) tggtggCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGActggc < 2:968250/150‑1 (MQ=255) tggtggCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTACGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGActggc > 1:231383/1‑150 (MQ=255) ggCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAggg < 1:864812/136‑1 (MQ=255) ggCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAggg > 2:864812/1‑136 (MQ=255) gCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCgg < 2:1776167/78‑1 (MQ=255) gCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCgg > 1:1776167/1‑78 (MQ=255) gCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGaa < 2:1758170/150‑1 (MQ=255) ccGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGaac > 1:707192/1‑150 (MQ=255) aCATCAACCGCGATGGGGTGTTCGCCCACTGGGTGTGCACGGTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGGCAGCAACCGCTTCCGTGTCGACATTTCTCTGCTGCAGGCAGGGCTGGACTGCCTGGaacaac < 2:231383/150‑1 (MQ=255) cATCGACGGCGGGGGTGTAGTCGCCCGCGTGGTGGGCACGCTCGAATTGCTGTCGACCACTGAGCAGGCGCGGGTCGAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACg < 2:176840/150‑1 (MQ=255) aCCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCATGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTg > 2:465952/1‑81 (MQ=255) aCCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCATGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTg < 1:465952/81‑1 (MQ=255) ccGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCgg < 2:372516/150‑1 (MQ=255) ccGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCgg < 1:266405/150‑1 (MQ=255) cgcgGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCGGc < 1:816878/150‑1 (MQ=255) ggtggtGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCGGCaga > 2:2096868/1‑148 (MQ=255) ggtggtGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCGGCaaa > 1:642679/1‑150 (MQ=255) gtggtgTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGActggctg > 2:516933/1‑131 (MQ=255) gtggtgTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGActggctg < 1:516933/131‑1 (MQ=255) gtggtgTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCGGCAAAc < 2:2379453/150‑1 (MQ=255) ggtgTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCGGCAAACCg < 1:134926/150‑1 (MQ=255) gtgtgtTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCaa > 1:1704647/1‑64 (MQ=255) gtgtgtTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCaa < 2:1704647/64‑1 (MQ=255) ttCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCGGCAAACCGGTAc > 2:181581/1‑148 (MQ=255) ttCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCGGCAAACCGGTAc < 1:181581/148‑1 (MQ=255) ttCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCGGCAAACCGGTACTg > 2:1865491/1‑150 (MQ=255) tCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCCAAAGCTTCCGTGGCGACATTGGTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCGGCAAACCGGTACTgg < 1:297101/150‑1 (MQ=255) tCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCGGCAAACCGGTACTgg < 1:721762/150‑1 (MQ=255) gCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCGGCAAACCGGTACTGGGc < 2:2397818/150‑1 (MQ=255) | CCGGTGGTCATGGTCGAGGGGGCGGGGTCGCCGGCAGAGATCAACCTGCGTGCCGGCGATATCGCCAACATGGGCTTTGCCGAAGCGGTGGACTGCCCGGTGATCCTGGTGGCCGACATCAACCGCGGTGGTGTGTTCGCCCACCTGGTGGGCACGCTGGAATTGCTGTCGACCACTGAACAGGCGCGGGTCAAAGGTTTTGTCATCAACCGCTTCCGTGGCGACATTGCTCTGCTGCAGCCAGGGCTGGACTGGCTGGAACAACGCACCGGCAAACCGGTACTGGGC > NC_002947/1872133‑1872420 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |