| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,067,292 | C→G | 7.7% | V9L (GTG→CTG) | PP_1843 ← | Mg(2+)/Co(2+) transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,067,292 | 0 | C | G | 7.7% | 230.2 / 6.6 | 73 | V9L (GTG→CTG) | PP_1843 | Mg(2+)/Co(2+) transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/27); new base G (4/2); total (44/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTGCAGGTTGAACTGCGACTGCAGGTTGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCATGCGGTCAATGCACTGCTGCATTTGCCCACGGCATTG > NC_002947/2067146‑2067441 | gTGCAGGTTGAACTGCGACTGCAGGTTGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACCAGTAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATTTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACAccgc < 1:1958371/150‑1 (MQ=255) gTTGAACTGCGACTGCAGGTTGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGGCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGa < 1:2383115/147‑1 (MQ=255) gTTGAACTGCGACTGCAGGTTGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGGCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGa > 2:2383115/1‑147 (MQ=255) gTTGAACTGCGACTGCAGGTTGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGc < 2:1976918/150‑1 (MQ=255) gTTGAACTGCGACTGCAGGTTGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGc > 2:1924608/1‑150 (MQ=255) tGCGACTGCAGGTTGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGAt < 1:1405795/141‑1 (MQ=255) tGCGACTGCAGGTTGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGAt > 2:1405795/1‑141 (MQ=255) cTGCAGGTTGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGAcc > 2:1980356/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGATATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGAGCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGt > 2:1615483/1‑150 (MQ=255) gTTGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATgg > 1:1369291/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATgg < 2:1369291/149‑1 (MQ=255) ttGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGtt < 2:613164/150‑1 (MQ=255) cAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCg > 2:191515/1‑150 (MQ=255) tgggCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGAGGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTc > 1:170951/3‑150 (MQ=255) tcGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTc > 1:1595812/1‑150 (MQ=255) gCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACt < 1:916176/116‑1 (MQ=255) gCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACt > 2:916176/1‑116 (MQ=255) gCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAacac > 2:463860/1‑150 (MQ=255) gCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGACGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAacac > 2:2023707/1‑150 (MQ=255) ctctTCCAGGCCGATCCACACGATATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACg < 1:1615483/150‑1 (MQ=255) tctTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCAc > 2:259199/1‑110 (MQ=255) tctTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCAc < 1:259199/110‑1 (MQ=255) ttCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGAt > 1:1300591/1‑150 (MQ=255) ccAGGGCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTCAATTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATAc < 1:2330960/150‑1 (MQ=255) gATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTgg < 1:1980356/150‑1 (MQ=255) gATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTgg < 1:2388490/150‑1 (MQ=255) aTCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTTCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTggg > 1:2143990/1‑150 (MQ=255) aTCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTggg < 1:1906598/150‑1 (MQ=255) aTCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTggg < 1:460483/150‑1 (MQ=255) acacGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGt > 1:1121933/1‑150 (MQ=255) acGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTAc > 2:1056048/1‑150 (MQ=255) cGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCaga < 2:1937415/150‑1 (MQ=255) cGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCaga < 1:191515/150‑1 (MQ=255) ggCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGt < 2:6557/98‑1 (MQ=255) ggCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGt > 1:6557/1‑98 (MQ=255) cTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGTCACGACTCGACCCCTGGTTGTCCGCTTATTCCATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCa > 2:1470340/1‑150 (MQ=255) ttGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCaa > 2:1489112/1‑150 (MQ=255) gcgcgcCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCCTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATgg > 1:1674780/1‑89 (MQ=255) gcgcgcCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCCTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATgg < 2:1674780/89‑1 (MQ=255) gcgcCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCAc > 2:46990/1‑73 (MQ=255) gcgcCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCAc < 1:46990/73‑1 (MQ=255) gcgcCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAAcccc > 2:2058180/1‑150 (MQ=255) gcCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCa > 1:1006555/1‑70 (MQ=255) gcCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCa < 2:1006555/70‑1 (MQ=255) cccACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGa < 2:1525270/150‑1 (MQ=255) aCTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCa < 1:1489112/150‑1 (MQ=255) aCTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCa > 1:1962424/1‑150 (MQ=255) cTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCa > 2:1004765/1‑150 (MQ=255) ccTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGtt > 2:1138273/1‑150 (MQ=255) cTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTc > 2:1590442/1‑150 (MQ=255) cTTCGTCGATGATGAAGATGGCCTTCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTc > 2:2020627/1‑150 (MQ=255) ttCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCt > 1:822668/1‑150 (MQ=255) tcgtcgATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCtt < 1:1590442/150‑1 (MQ=255) gtcgATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCtttt < 1:463860/150‑1 (MQ=255) gtcgATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCtttt > 1:1389943/1‑150 (MQ=255) gCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCacg < 2:1300591/150‑3 (MQ=255) gCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCATg > 2:1628241/1‑150 (MQ=255) tGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCTATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCGGATTCGATTCACACCGCCGACCGCCTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTGTTCCATGCg > 1:1977868/1‑150 (MQ=255) gATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCATGCgg > 2:2296920/1‑150 (MQ=255) 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atcggcggTGTACAGCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGGGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCATGCGGTCAATGCACTGCTGCAtt > 2:2333242/3‑150 (MQ=255) atcggcggTGTACAGCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCATGCGGTCAATGCACTTCTGCAtt > 2:672083/3‑150 (MQ=255) atcggcggTGTACAGCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCATGCGGTCAATGCACTGCTGCAtt > 2:1861537/3‑150 (MQ=255) atcGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCATGCGGTCAATGCACTGCTGCAtt > 2:1338928/3‑150 (MQ=255) tcggcggTGTACAGCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCtttt < 2:1273684/121‑1 (MQ=255) tcggcggTGTACAGCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCtttt > 1:1273684/2‑122 (MQ=255) tGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCaga > 2:2388878/1‑88 (MQ=255) tGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCaga < 1:2388878/88‑1 (MQ=255) tGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCATGCGGTCAATGCACTGCTGCATTTGCCCACg > 1:1774372/1‑150 (MQ=255) gTACAGCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGGGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCATGCGGTCAATGCACTGCTGCATTTGCCCACgg < 1:2333242/150‑1 (MQ=255) acacCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCATGCGGTCAATGCACTGCTGCATTTGCCCACGGCa < 1:1468768/150‑1 (MQ=255) cacCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCATGCGGTCAATGCACTGCTGCATTTGCCCACGGCAt < 2:1389943/150‑1 (MQ=255) ccgccgATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCATGCGGTCAATGCACTGCTGCATTTGCCCACGGCATTg < 1:1924608/150‑1 (MQ=255) | GTGCAGGTTGAACTGCGACTGCAGGTTGGCCAGCTCCTCGGCATTGGGCTCTTCCAGGCCGATCCACACGAAATGCCCCGGCTTGCGCGCCCACTCGCTGCCTTCGTCGATGCTGATGTTGGTGACCTTTCTGCCGGCGCTGTACACCGCCGATGCCACGACTCGACCCATGGTTGTCCGCTTATTCGATTGAACACGGATACAGCTTGGGCTGTACCCGGCTCCAGAGCAACCCCGGATCAGGCCAGTTCTTTTTCCATGCGGTCAATGCACTGCTGCATTTGCCCACGGCATTG > NC_002947/2067146‑2067441 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |