| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,077,810 | A→G | 5.8% | H164R (CAC→CGC) | PP_1853 → | LysR family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,077,810 | 0 | A | G | 5.8% | 250.1 / 4.2 | 86 | H164R (CAC→CGC) | PP_1853 | LysR family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (42/39); new base G (2/3); total (44/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.99e-01 | |||||||||||
GGAATTCTTGCGCCGATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCAGCCGTTGGCAGGCGC > NC_002947/2077661‑2077959 | ggAATTCTTGCGCCGATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCa > 1:2385678/1‑150 (MQ=255) aTTCTTGCGCCGATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCTAGGTCGACATGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCg < 2:1137029/150‑1 (MQ=255) aTTCTTGCGCCGATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCg > 2:961572/1‑150 (MQ=255) ttCTTGCGCCGATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCgg < 2:464156/150‑1 (MQ=255) ttGCGCCGATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGATCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGgtg > 2:1560423/1‑150 (MQ=255) ttGCGCCGATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGTGCGCCggggt < 1:512078/150‑3 (MQ=255) ttGCGCCGATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGgtg < 2:459111/150‑1 (MQ=255) tGCGCCGATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGTGCGCCggggtc < 2:1094106/150‑4 (MQ=255) gcCGATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTtgg < 2:1368870/150‑1 (MQ=255) cGATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTtggtg < 2:1017167/150‑1 (MQ=255) gATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTtggtgg > 2:1159196/1‑150 (MQ=255) gATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTtggtgg > 2:174472/1‑150 (MQ=255) ccAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCGTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGgcggcg > 1:1991258/1‑150 (MQ=255) cAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGgcgc > 1:1313073/1‑150 (MQ=255) ttACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTtg < 1:1570872/134‑1 (MQ=255) ttACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTtg > 2:1570872/1‑134 (MQ=255) ttACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGCGTTGGTGGCGGCGCCGGCCt < 2:1094837/150‑1 (MQ=255) aCCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCATGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTac > 2:508719/1‑149 (MQ=255) ccccGGATTGGCCCTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATc < 1:1695832/150‑1 (MQ=255) ccccGGATTGGCATTTCGACAACCGCCATGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTacc < 1:508719/150‑3 (MQ=255) ccccGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATc > 1:2396383/1‑150 (MQ=255) cccGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCAGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCt > 2:1235335/1‑150 (MQ=255) ccGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGAGCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGGTTCGAACAGGCCCCGGAGGGGGCTGCGCGCAACCTGACCCCGGCGCACCGGGTGGTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTg > 1:1149022/1‑150 (MQ=255) ggATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCa < 1:961572/150‑1 (MQ=255) aTTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTAAAGCGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGc < 1:149479/150‑1 (MQ=255) gCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCa < 1:282749/150‑1 (MQ=255) aTTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAg < 1:1985848/143‑1 (MQ=255) aTTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAg > 2:1985848/1‑143 (MQ=255) aTTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCg > 1:43005/1‑145 (MQ=255) aTTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCg < 2:43005/145‑1 (MQ=255) tttCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCAcgc < 2:2396383/150‑1 (MQ=255) aCAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGa > 1:2216675/1‑150 (MQ=255) aCAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGGGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGa > 1:1409089/1‑150 (MQ=255) 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cGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATagaa > 2:1636516/1‑150 (MQ=255) ccAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATagaaga > 2:1753341/1‑150 (MQ=255) ggTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGAccc < 2:1906020/150‑1 (MQ=255) tCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGc > 1:1215760/1‑150 (MQ=255) ggCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCg > 1:740677/1‑116 (MQ=255) ggCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCg < 2:740677/116‑1 (MQ=255) cgCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCaa < 1:359120/149‑1 (MQ=255) gCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAAc > 2:1548804/1‑150 (MQ=255) cAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGc > 1:1320891/1‑150 (MQ=255) aGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGcc > 1:134403/1‑150 (MQ=255) ttCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGACGCTGCAACGCCATGAc > 2:1376366/1‑150 (MQ=255) cAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATagaa < 2:2295969/116‑1 (MQ=255) cAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTCGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATagaa > 1:2295969/1‑116 (MQ=255) aGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCt > 2:2335686/1‑150 (MQ=255) aGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCt > 2:124914/1‑150 (MQ=255) tGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCg < 1:1235335/150‑1 (MQ=255) tgCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGATACTCCATGACGGCATCCTGGTGCgg < 1:2131582/149‑1 (MQ=255) ggCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCgg > 1:2214827/1‑150 (MQ=255) cGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGGTTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGta > 2:2131582/1‑149 (MQ=255) ggtggtTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCa > 2:1589131/1‑150 (MQ=255) ttCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAg > 2:2227677/1‑150 (MQ=255) gAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGAcc > 1:244361/1‑150 (MQ=255) 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gtggCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAGGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTgg < 1:1373442/150‑1 (MQ=255) gtggCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTgg < 1:2335686/150‑1 (MQ=255) gcgcgcAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCg > 2:2198942/1‑150 (MQ=255) gcgcAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACcggg < 1:318021/130‑1 (MQ=255) gcgcAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACcggg > 2:318021/1‑130 (MQ=255) gcgcAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGtt > 1:1306335/1‑150 (MQ=255) gcgcAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGtt < 2:2216675/150‑1 (MQ=255) gcAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAgg < 2:1344236/81‑1 (MQ=255) gcAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAgg > 1:1344236/1‑81 (MQ=255) accaacacccGGTGCGCCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCa > 1:2403078/8‑150 (MQ=255) aGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCa < 2:1925958/150‑1 (MQ=255) caacacccGGTGCGCCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGAc < 2:906726/141‑1 (MQ=255) caacacccGGTGCGCCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGAc > 1:906726/6‑146 (MQ=255) aCCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCAGCCGt > 2:583870/1‑150 (MQ=255) aCCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCAGCCGt < 1:124914/150‑1 (MQ=255) ccccGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCAGCCGtt < 1:1589131/150‑1 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCAGCCGTTg < 2:2385678/150‑1 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCAGCCGTTg > 2:504052/1‑150 (MQ=255) cccGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCAGCCGTTg > 2:436268/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCAGCCGTTgg < 2:1313073/150‑1 (MQ=255) cACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCAGCCGTTGGCAGgcg < 1:1348019/150‑1 (MQ=255) aCCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGTGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCAGCCGTTGGCAGgcgc > 2:1043465/1‑150 (MQ=255) aCCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCAGCCGTTGGCAGgcgc > 1:1968239/1‑150 (MQ=255) aCCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCAGCCGTTGGCAGgcgc > 1:2228714/1‑150 (MQ=255) | GGAATTCTTGCGCCGATACCCAGCGATTACCCCGGATTGGCATTTCGACAACCGCCAGGTCGACCTGATCGGCCAGGGCTTCGATGCAGCGATTGGCGGTGGTTTCGAACTGCCGCCGGGGGTGGTGGCGCGCAAGCTGACCCCGGCGCACCGGGTGTTGGTGGCGGCGCCGGCCTATCTGCAGCGGCACGCGTCGATAGAAGACCCGCAGGCGCTGCAACGCCATGACGGCATCCTGGTGCGGTCACCGCAGACCGGGCGGGTGCGCTCGTGGCCGTTGACCAGCCGTTGGCAGGCGC > NC_002947/2077661‑2077959 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |