Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,083,532 | C→T | 5.9% | A48V (GCG→GTG) | PP_1862 → | membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,083,532 | 0 | C | T | 5.9% | 251.5 / 3.4 | 84 | A48V (GCG→GTG) | PP_1862 | membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/39); new base T (2/3); total (42/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
CTGATGATCGAGTGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCAGCTTCTTGTTCGCCTGGCTGGGGTCGATCTGGGCGGTGGGGCTTGATGCGC > NC_002947/2083387‑2083681 | cTGATGATCGAGTGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTg < 1:1085035/150‑1 (MQ=255) cTGATGATCGAGTGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTg < 1:250697/150‑1 (MQ=255) gattatCGAGTGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGt < 1:1052094/150‑1 (MQ=255) atgatCGAGTGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTg > 2:1263418/1‑150 (MQ=255) tgatCGAGTGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGa < 2:1635856/150‑1 (MQ=255) gatCGAGTGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGAt < 2:994215/150‑1 (MQ=255) gatCGAGTGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGAt < 1:1263418/150‑1 (MQ=255) atCGAGTGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGAtg > 2:974554/1‑150 (MQ=255) gAGTGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGAtggtg < 2:1674812/150‑1 (MQ=255) gAGTGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGAtggtg < 1:375449/150‑1 (MQ=255) gTGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATggtggt < 2:480805/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGgtggtg < 1:681354/150‑1 (MQ=255) gttgttGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGcc > 1:214967/1‑150 (MQ=255) gttgttGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGcc < 1:974554/150‑1 (MQ=255) gttgttGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGcc > 2:1009440/1‑150 (MQ=255) ttgttgTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCg > 1:2403301/1‑150 (MQ=255) ttgttgTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATAGCGCCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGAGCCGAAGTCGGATGCGGGGTCCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCg > 1:1622063/1‑150 (MQ=255) gttgtATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACGAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGaa > 1:1360150/1‑150 (MQ=255) ttgtATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGc > 1:1857994/1‑145 (MQ=255) ttgtATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGc < 2:1857994/145‑1 (MQ=255) ttgtATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAAc > 1:590788/1‑150 (MQ=255) ttgtATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAAc > 2:2345595/1‑150 (MQ=255) tataTCGTGCTGGGCGAAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGAGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGtg > 1:55254/1‑150 (MQ=255) tatCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGtgct > 1:1563227/1‑150 (MQ=255) tCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGtgctgc > 2:1437375/1‑150 (MQ=255) gTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGctgctg > 1:972176/1‑150 (MQ=255) tGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGAtggtg > 1:1360496/1‑131 (MQ=255) tGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGAtggtg < 2:1360496/131‑1 (MQ=255) cAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGc < 1:1357863/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTAGGCACCATGGCGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGc < 1:211171/150‑1 (MQ=255) cccTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGt > 1:2087751/1‑150 (MQ=255) cTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATggtggt < 1:1605108/119‑1 (MQ=255) cTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATggtggt > 2:1605108/1‑119 (MQ=255) cACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGTACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCa < 2:1563227/150‑1 (MQ=255) aCCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAg > 1:1430441/1‑150 (MQ=255) ccATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCAGGCGTTTTGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTCCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAgc < 1:1955164/150‑1 (MQ=255) cATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAgcg > 1:217573/1‑150 (MQ=255) ggggggCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCaa > 1:1821970/1‑150 (MQ=255) ggggCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAAcc > 1:1237882/1‑150 (MQ=255) gggCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGctgctg < 2:1441340/121‑1 (MQ=255) gggCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGctgctg > 1:1441340/1‑121 (MQ=255) gTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATcgc < 2:1622063/150‑1 (MQ=255) gCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCtgtg > 2:1924124/1‑118 (MQ=255) gCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCtgtg < 1:1924124/118‑1 (MQ=255) gCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTc > 1:598407/1‑150 (MQ=255) aTTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGc > 1:412926/1‑150 (MQ=255) aTTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGc < 2:2087751/150‑1 (MQ=255) tggCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGc > 2:766360/1‑150 (MQ=255) tggCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGc < 2:590788/150‑1 (MQ=255) tggCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGc < 1:1009440/150‑1 (MQ=255) gggCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTg > 2:1207617/1‑150 (MQ=255) gggCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTg > 2:1249910/1‑150 (MQ=255) gggCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTg > 1:1443068/1‑150 (MQ=255) gCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGAt > 1:1954450/1‑75 (MQ=255) gCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGAt < 2:1954450/75‑1 (MQ=255) aTTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTg > 1:336106/1‑150 (MQ=255) tGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTc < 1:2345595/150‑1 (MQ=255) cGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCgg > 2:803786/1‑150 (MQ=255) gATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCt > 1:1421168/1‑93 (MQ=255) gATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCt < 2:1421168/93‑1 (MQ=255) gATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATAGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGc > 1:927377/1‑150 (MQ=255) ttCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGt < 2:1430441/150‑1 (MQ=255) cGGCGCTGGGCGTGCTCTTCTGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGGGGTGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCa > 2:426387/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCAGc < 2:217573/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCAGcttc < 2:336106/150‑1 (MQ=255) ggCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCAGCTTCTTg < 2:1821970/150‑1 (MQ=255) cGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCACAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCAGCTTCTTGtt < 2:2403301/150‑1 (MQ=255) ttCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCAGCTTCTTGTTCGCctgg < 2:412926/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGACCAGCAGTTGGCGCTGGGGCCCGTGTTGGTGATGGTGGTGCATCACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCAGCTTCTTGTTCGCctggctg < 2:1330437/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGTGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCAc > 2:1090170/1‑81 (MQ=255) ggCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGTGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCAc < 1:1090289/81‑1 (MQ=255) ggCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGTGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCAc > 2:1090289/1‑81 (MQ=255) ggCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGTGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCAc < 1:1090170/81‑1 (MQ=255) gCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCAGCTTCTTGTTCGCctggctgg > 1:1564062/1‑150 (MQ=255) 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ggggACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGt > 2:1631834/1‑89 (MQ=255) ggggACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGt < 1:1631834/89‑1 (MQ=255) ggggACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCAGCTTCTTGTTCGCGTGGCGGGGGTCGATCTTGGCGGTGGGGCt > 2:1229919/1‑150 (MQ=255) cgcgTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCAGCTTCTTGTTCGCCTTGCTGGGGTCGATCTGGGCGGTGGGGCTTGATgc < 1:803786/150‑1 (MQ=255) cgcgTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCAGCTTCTTGTTCGCCTGGCTGGGGTCGATCTGGGCGGTGGGGCTTGATgc > 2:2033929/1‑150 (MQ=255) gcgTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCAGCTTCTTGTTCGCCTGGCTGGGGTCGATCTGGGCGGTGGGGCTTGATgcg > 2:775926/1‑150 (MQ=255) cgTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCAATACAGCCTCGCGGTCGGCGTGCAGCTTCTTGTTCGCCTGGCTGGGGTCGATCTGGGCGGTGGGGCTTGATgcgc > 1:151154/1‑150 (MQ=255) | CTGATGATCGAGTGGTTGTTGTATATCGTGCTGGGCGCAGCCCTAGGCACCATGGGGGGCTTGTTTGGCATTGGTGGCGGGCTGATTGCGATTCCGGCGCTGGGCGTGCTCTTCGGCCTGGACCAGCAGTTGGCGCAGGGGACCGCGTTGGTGATGGTGGTGCCGAACGTGCTGCTGGCGCTGTGGCGGTATCACCAGCGCAACCGCATCGCGTTTCGCCATGCGTTGCCGCTGTCGGCGTGCAGCTTCTTGTTCGCCTGGCTGGGGTCGATCTGGGCGGTGGGGCTTGATGCGC > NC_002947/2083387‑2083681 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |