Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,134,314 | A→C | 5.1% | intergenic (‑37/+32) | PP_1892 ← / ← fadE | hypothetical protein/medium‑long chain acyl‑CoA dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,134,314 | 0 | A | C | 5.1% | 342.5 / 8.9 | 117 | intergenic (‑37/+32) | PP_1892/fadE | hypothetical protein/medium‑long chain acyl‑CoA dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (62/49); new base C (3/3); total (65/52) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.82e-01 |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
AGGAACAGGGCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTGCAG > NC_002947/2134165‑2134462 | gAACAGGGCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGt > 2:1413612/1‑150 (MQ=255) aCAGGGCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGtat > 1:777082/1‑150 (MQ=255) gggCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCGAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATAcg > 1:1954371/1‑150 (MQ=255) ggCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATAcgc < 1:800044/150‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATAcgc < 1:1413612/150‑1 (MQ=255) ggCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATAcgc < 1:2336003/150‑1 (MQ=255) ggCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGccc < 1:414693/150‑1 (MQ=255) gCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGcccc > 1:1943720/1‑150 (MQ=255) cTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGccccc < 2:1954371/150‑1 (MQ=255) tttCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATGTGTGAGTTGCAGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACTGGGGTCGTAGGATACTCCGcccccc > 1:420460/1‑150 (MQ=255) tttCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGCGTATACTCCGcccccc < 2:1444430/150‑1 (MQ=255) tttCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGcccccc > 1:762825/1‑150 (MQ=255) tttCTACTGGGACATGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATGCGCCAcccccc < 2:1541538/150‑1 (MQ=255) tcttctGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGt < 2:180774/150‑1 (MQ=255) ctGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGACTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTtct > 1:547614/1‑150 (MQ=255) ctGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCAAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTtct > 1:1428517/1‑150 (MQ=255) tGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTtctc > 1:306761/1‑150 (MQ=255) gCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTtc > 1:2246712/1‑146 (MQ=255) gCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTtc < 2:2246712/146‑1 (MQ=255) aCCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGa > 1:811653/1‑150 (MQ=255) ccTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGaa < 1:1687898/150‑1 (MQ=255) ctgctctgctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAg > 1:57463/1‑150 (MQ=255) ctgctctgctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAg > 2:1879608/1‑150 (MQ=255) tgctctgctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAgg < 2:306761/150‑1 (MQ=255) ctgctTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCa < 2:1355165/150‑1 (MQ=255) cACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCAc < 2:1691381/150‑1 (MQ=255) aCCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGAGGTGCTCAGCATACTCCTCCCCCCGAGTCTCGCGAAGGGTCAGCGCAcc > 2:126167/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGCGTATACTCCGcccc > 1:711047/1‑121 (MQ=255) ccAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGCGTATACTCCGcccc < 2:711047/121‑1 (MQ=255) ccAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGcccccc > 2:2061458/1‑123 (MQ=255) ccAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGcccccc < 1:2061458/123‑1 (MQ=255) ccAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCa < 1:1562026/141‑1 (MQ=255) ccAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCa > 2:1562026/1‑141 (MQ=255) gcCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCg > 1:2357173/1‑150 (MQ=255) caccaGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGt < 2:777082/150‑1 (MQ=255) ccaGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCTGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTAc < 1:851261/150‑1 (MQ=255) tctaTGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACgg < 2:1749591/147‑1 (MQ=255) gAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGc < 2:811653/150‑1 (MQ=255) tGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGACGGTGCTATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGACTGGGTCCTCGGT‑ATGGATGACGGTGCCGTGGTAATATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGcaga > 1:1749591/1‑147 (MQ=255) tGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTTGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTTCTCTGTACGGCgtgtaa < 2:150835/150‑6 (MQ=255) cAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAACGCACCTTGCCCGGTACGTCGCGCAACTgc > 2:1084300/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTgcgc < 2:100028/150‑1 (MQ=255) gCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCtt < 1:1911465/150‑1 (MQ=255) tGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGt < 2:2388441/150‑1 (MQ=255) gAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCGGTGGGCCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCg > 1:1933981/1‑150 (MQ=255) gCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAg > 1:1686087/1‑126 (MQ=255) gCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAg > 2:2383290/1‑126 (MQ=255) gCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAg < 2:1686087/126‑1 (MQ=255) gCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAg < 1:2383290/126‑1 (MQ=255) gTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGGCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGcatcgacc > 1:313139/1‑149 (MQ=255) gATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGcatcgacatc > 2:609150/1‑150 (MQ=255) atTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGAt < 1:1879608/150‑1 (MQ=255) ttCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATGGACAGCGATc > 1:110377/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATc > 1:1895632/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATc > 2:1540059/1‑150 (MQ=255) tCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTc > 2:860112/1‑90 (MQ=255) tCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTc < 1:860112/90‑1 (MQ=255) tCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCa > 2:297088/1‑150 (MQ=255) ccAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGTCACGGC‑GAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCAc < 1:126167/150‑1 (MQ=255) cAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCAcc < 1:1084300/150‑1 (MQ=255) gTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTg > 1:1552589/1‑150 (MQ=255) gggTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGcc < 2:1895632/150‑1 (MQ=255) gctgcccATGGAATGGCTCCTTGGT‑ATTGCTGAAACGGCGGGCGAAGTAGACAACGCCCCTCGTTTCGCGCGAAGGCGCAGCGCACCTGGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTCTCGAAGGCATCGACATCCATCACCTTGCGCCGa < 2:110377/145‑1 (MQ=255) gTTGGCCATGGAATGGGTCTCCAGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGa < 2:2359336/150‑1 (MQ=255) gTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAgg < 2:2192382/76‑1 (MQ=255) gTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAgg > 1:2192382/1‑76 (MQ=255) ccATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAg > 1:465142/1‑118 (MQ=255) ccATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTg > 2:473265/1‑150 (MQ=255) cATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGa > 1:1061451/1‑115 (MQ=255) cATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGa < 2:1061451/115‑1 (MQ=255) cATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGt > 2:1603399/1‑150 (MQ=255) gAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCgg < 1:609150/150‑1 (MQ=255) aTGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGaa < 2:958992/110‑1 (MQ=255) aTGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGaa > 1:958992/1‑110 (MQ=255) aTGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGcc < 2:864014/150‑1 (MQ=255) gggTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCt < 1:2312325/140‑1 (MQ=255) gggTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTATCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCt > 2:2312325/1‑140 (MQ=255) gTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGt > 2:289207/1‑150 (MQ=255) ccTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGc > 2:547983/1‑150 (MQ=255) cTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCa > 1:1777591/1‑150 (MQ=255) cTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCa > 1:2313829/1‑150 (MQ=255) gT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCg > 1:1279883/1‑150 (MQ=255) gT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGGACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCg > 1:1279854/1‑150 (MQ=255) tGGCTGAAACGGGGGGCGGAATATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAACGGCTg > 2:1978470/1‑150 (MQ=255) gCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGc > 1:2228832/1‑150 (MQ=255) tGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGaa > 1:1491144/1‑92 (MQ=255) tGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCa > 2:1193845/1‑150 (MQ=255) aaaCGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGc > 2:1431449/1‑73 (MQ=255) aaaCGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGc < 1:1431449/73‑1 (MQ=255) aaaCGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCAtc < 2:547614/150‑1 (MQ=255) aaCGGGGGGCGGCGTATACTCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTgg > 2:2345270/1‑144 (MQ=255) aaCGGGGGGCGGCGTATACTCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTgg < 1:2345270/144‑1 (MQ=255) ggggCGGCGTATACTCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCggg > 1:2212533/1‑150 (MQ=255) ggggCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCggg < 2:57463/150‑1 (MQ=255) gggCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGt < 1:1603399/150‑1 (MQ=255) ggCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGtt > 2:407339/1‑150 (MQ=255) cGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTgc > 2:1157628/1‑150 (MQ=255) cGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTgc < 2:1428517/150‑1 (MQ=255) ggAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTTGCCATCGTCGGGTTgca < 2:1552589/150‑1 (MQ=255) gAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTgtag > 2:402124/1‑150 (MQ=255) | AGGAACAGGGCGTGGCTTTCTTCTGGCACCTGCTCTGCTTCACCCAGCGCCACCAGAATGGTGCGCAGGTGCTGGAGCAGTTGCAGGTGATATTCCAGGTAGGGGTTGGCCATGGAATGGGTCCTCGGT‑ATGGCTGAAACGGGGGGCGGAGTATACGCCGCCCCCCGTTTCTCGCGAAGGGTCAGCGCACCTTGCCCGGTACGGCGAGCAACTGCGCCTTGTCGAAGGCATCGACATCGATCACCTTGCGCCGAGCCTGTTCGGCCTCGTGCAGCCGCTGGCCATCGTCGGGTTGCAG > NC_002947/2134165‑2134462 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |