Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,141,428 | T→A | 8.6% | L374* (TTG→TAG) ‡ | PP_1897 → | DNA internalization‑related competence protein ComEC/Rec2 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,141,428 | 0 | T | A | 8.6% | 244.6 / 12.8 | 81 | L374* (TTG→TAG) ‡ | PP_1897 | DNA internalization‑related competence protein ComEC/Rec2 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/38); new base A (4/3); total (40/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.12e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.91e-01 |
GCCTGGGTTCTGGCTGTCGTTCGCCGCCGTGGCCACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCAGGTGGCCTGCTG > NC_002947/2141279‑2141576 | gcCTGGGTTCTGGCTGTCGTTCGCCGCCGTGGCCACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCtt > 2:1437632/1‑150 (MQ=255) gcCTGGGTTCTGGCTGTCGTTCGCCGCCGTGGCCACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCtt > 1:817933/1‑150 (MQ=255) gggATCTGGCGGTCGTTCTCCGCCGTGGCCACGCTCATCTATTGCTTGTGGGGGCTGTTGGGGGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACAAGAGCGCAATGGTGGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCTGCTTGCCg > 2:342682/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCTGTCGTTCGCCGCCGTGGCCACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCAAGCCGGTg < 2:1275400/150‑1 (MQ=255) tGGCTGTCGTTCGCCGCCGTGGCCACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACATGAGCGCAATGGATGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGc < 2:1733724/150‑1 (MQ=255) tGGCTGTCGTTCGCCGCCGTGGCCACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGc < 1:1286868/150‑1 (MQ=255) tGGCTGTCGTTCGCCGCCGTGGCCACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTGGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGCTCACCGGCAAGCCGGTggc < 1:310602/150‑3 (MQ=255) gTTCGCCGCCGTGGCCACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTgc > 2:378608/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGCCGTGGCCACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTgcg > 1:1606473/1‑150 (MQ=255) ccgccgTGGCCACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGcgccgc > 1:927809/1‑150 (MQ=255) gccgTGGCCACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTg < 2:110637/150‑1 (MQ=255) ccgTGGCCACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTgg < 1:133465/150‑1 (MQ=255) cACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCt > 1:211294/1‑150 (MQ=255) cACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCAGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCt > 1:1180215/1‑150 (MQ=255) cGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCtt < 2:614807/115‑1 (MQ=255) cGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCtt > 1:614807/1‑115 (MQ=255) cGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTtg < 2:66162/150‑1 (MQ=255) gCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTtgt < 2:817933/150‑1 (MQ=255) tCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTgg < 2:211294/150‑1 (MQ=255) tCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCgg > 2:1225734/1‑150 (MQ=255) attGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGACAGGCATGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCTCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGc < 1:57150/148‑1 (MQ=255) aCTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGc > 1:123767/1‑150 (MQ=255) tGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCtt > 2:2032224/1‑138 (MQ=255) tGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCtt < 1:2032224/138‑1 (MQ=255) tGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACATTGTGACCGTGCCg > 2:1377827/1‑150 (MQ=255) cTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTg > 1:362989/1‑150 (MQ=255) cTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTg > 2:255362/1‑150 (MQ=255) ttCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTgg < 1:255362/150‑1 (MQ=255) ttCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTgg < 2:2223015/150‑1 (MQ=255) tCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTggg < 1:1248116/150‑1 (MQ=255) tCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTggg < 2:1811963/150‑1 (MQ=255) cAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGt > 1:336184/1‑150 (MQ=255) tGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CAAAGGCCTCCCCTGGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAg < 2:593133/150‑1 (MQ=255) gCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGc < 1:1437632/150‑1 (MQ=255) gCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCCCCTCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGc < 1:1998780/150‑1 (MQ=255) ggTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTTGCGGTTCCGTGGGTCAGCCTgg < 2:1835970/150‑1 (MQ=255) ggtgcatGGCGCCCCTGGAAGGCCTGGACACGAGCGCAAGGGGTGGTCGCCGTCGGCTTGCTAGTGGTGTTGCTGGC‑TACAAGGTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGGCGCTGGCGAACCTTGTGGCGGTGCGGTGGGGCAGCCTGGCGATc > 2:500963/7‑150 (MQ=255) gtTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGc < 2:1606473/150‑1 (MQ=255) ttGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGt > 1:2259696/1‑123 (MQ=255) ttGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGt < 2:2259696/123‑1 (MQ=255) gcggcCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGtt < 1:1178122/150‑1 (MQ=255) ggcCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTgg < 2:659288/150‑1 (MQ=255) ggcCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑AACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTgg > 2:2396879/1‑150 (MQ=255) ggcCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTAGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTgg > 1:2048358/1‑150 (MQ=255) gcCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGc > 1:933969/1‑150 (MQ=255) gcCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGc > 2:2044276/1‑150 (MQ=255) tGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGcc < 2:653480/74‑1 (MQ=255) tGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGcc > 1:653480/1‑74 (MQ=255) cAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTg < 1:2169115/150‑1 (MQ=255) aGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGTCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTgg < 1:562233/150‑1 (MQ=255) aGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGGCTGGCAGGCATGCCGTTGGCGTTGCttg > 2:1157595/1‑148 (MQ=255) aGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTgg < 2:480691/150‑1 (MQ=255) ccTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCa > 1:1165296/1‑150 (MQ=255) ggACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGACGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGc < 2:2047801/150‑1 (MQ=255) gACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCt > 2:2134531/1‑150 (MQ=255) gcgcAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGc < 1:1582660/113‑1 (MQ=255) gcgcAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGc > 2:1582660/1‑113 (MQ=255) gcgcAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTg < 2:336184/150‑1 (MQ=255) aaTGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGc > 1:747248/1‑150 (MQ=255) aaTGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGc < 1:342682/150‑1 (MQ=255) aTGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGTCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCt < 2:55043/150‑1 (MQ=255) gTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGt < 1:2341277/60‑1 (MQ=255) gTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGt > 2:2341277/1‑60 (MQ=255) tGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCgg < 1:378608/150‑1 (MQ=255) gCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTGGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGtt > 2:2333749/1‑150 (MQ=255) ggCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAg < 1:2134531/150‑1 (MQ=255) gCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAgg > 2:211281/1‑150 (MQ=255) cTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGc < 2:123767/150‑1 (MQ=255) ttGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGAGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGAGAGGCg > 2:916688/1‑150 (MQ=255) tGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGt > 1:2108252/1‑150 (MQ=255) aCCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGct > 2:1689585/1‑150 (MQ=255) ccGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGctc < 2:747248/150‑1 (MQ=255) gCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCtggctggc > 1:365646/1‑150 (MQ=255) cTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCa < 1:1229366/150‑1 (MQ=255) gctcACCGGCAAGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCAgg > 2:1804524/4‑150 (MQ=255) gC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCAGGt > 2:1377249/1‑150 (MQ=255) tcACCGGCAAGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTg > 2:687575/2‑83 (MQ=255) tcACCGGCAAGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTg < 1:687575/82‑1 (MQ=255) tcACCGGCAAGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCAGGTg > 2:1143618/2‑150 (MQ=255) tcACCGGCAAGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCAGGTg > 1:1614873/2‑150 (MQ=255) cACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGACGTTGGCGGTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCAGGTgg > 1:2332872/1‑150 (MQ=255) cGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCAGGTGGCct > 2:1050696/1‑150 (MQ=255) gCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCAGGt > 2:560002/1‑143 (MQ=255) gCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCAGGt < 1:560002/143‑1 (MQ=255) gCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTAAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCAGGTGGCctgc < 1:500963/150‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCAGGTGGCctgctg > 1:1917306/1‑150 (MQ=255) ttGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCAGGTGGCctgctg < 2:927809/150‑1 (MQ=255) | GCCTGGGTTCTGGCTGTCGTTCGCCGCCGTGGCCACGCTCATCTACTGCTTCAGTGCCCGGTTGGGTGGTTGGCGGCCCTGGCAGGCCTGGACACGAGCGCAATGGGTGATCGCCGTCGGCTTGCTACCGGTGTTGCTGGC‑CACCGGCTTGCCGGTGAGCCTCAGTGCGCCGCTGGCCAACCTTGTGGCGGTGCCGTGGGTCAGCCTGGCGGTCTTGCCGTTGGCGTTGCTGGGCACGCTGATGTTGCCGCTGGCGGGTGTTGGCGAGGCGTTGCTCTGGCTGGCAGGTGGCCTGCTG > NC_002947/2141279‑2141576 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |