| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 2,236,224 | A→T | 7.8% | D431V (GAC→GTC) | uvrB → | uvrABC excinuclease protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,236,224 | 0 | A | T | 7.8% | 295.0 / 12.1 | 99 | D431V (GAC→GTC) | uvrB | uvrABC excinuclease protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (47/44); new base T (2/6); total (49/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GGAGGATGTCAGCCCGCAGACCATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACG > NC_002947/2236075‑2236372 | ggaggaTGTCAGCCCGCAGACCATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTcga > 1:999846/1‑150 (MQ=255) gaggaTGTCAGCCCGCAGACCATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTcgac > 1:1450435/1‑150 (MQ=255) gaTGTCAGCCCGCAGACCATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCgacgac < 2:503230/150‑1 (MQ=255) aTGTCAGCCCGCAGACCATTTTTGTTTCGGCCGCTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGAcc < 2:1046372/150‑1 (MQ=255) gTCAGCCCGCAGACCATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACctg > 2:2123539/1‑150 (MQ=255) cAGCCCGCAGACCATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGTCCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACctgct < 2:951724/150‑1 (MQ=255) aGCCCGCAGACCATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGTCGACctgggt < 2:968121/150‑4 (MQ=255) aGCCCGCAGACCATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGTCGACctgggt < 2:1351484/150‑4 (MQ=255) 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aCCATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTcc > 2:543770/1‑144 (MQ=255) aCCATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATc < 1:626668/150‑1 (MQ=255) aCCATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATc < 1:385405/150‑1 (MQ=255) ccATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATcc < 2:1017810/150‑1 (MQ=255) cATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGAGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCg > 1:348934/1‑150 (MQ=255) ttGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGc > 2:46832/1‑150 (MQ=255) tttCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCgtg > 1:2014484/1‑150 (MQ=255) tttCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCgtg > 1:2086130/1‑150 (MQ=255) ggCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTcgc > 1:331339/1‑150 (MQ=255) gCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGTCGACctgggtc > 2:36226/1‑123 (MQ=255) gCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGTCGACctgggtc < 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ggCTGAGCATGCAGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGc < 2:548416/150‑1 (MQ=255) cTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCC‑GCTCTGCCACCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGCGTCGAGGAAGGCAAGCGAGTGCTGTCGa > 1:1354108/1‑150 (MQ=255) cATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACg > 1:1689989/1‑150 (MQ=255) aTGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTcgac < 1:2217591/89‑1 (MQ=255) aTGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTcgac > 2:2217591/1‑89 (MQ=255) cGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGa > 2:886324/1‑149 (MQ=255) cGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGa < 1:886324/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGAc > 2:1926282/1‑150 (MQ=255) cgcgTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGCTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCaaa < 2:1067518/150‑1 (MQ=255) gcgTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAAc < 2:1689989/150‑1 (MQ=255) gtggAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATg > 1:1257453/1‑150 (MQ=255) 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cccGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTg < 2:2267614/121‑1 (MQ=255) cccGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTg > 1:2267614/1‑121 (MQ=255) ggCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCa < 2:1443274/150‑1 (MQ=255) gcTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTAc < 2:1888097/112‑1 (MQ=255) gcTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTAc > 1:1888097/1‑112 (MQ=255) cTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGTTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCg < 1:407512/150‑1 (MQ=255) gAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCa > 2:1367121/1‑120 (MQ=255) gAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCa < 1:1367121/120‑1 (MQ=255) acagcAGGTCGTCGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCgca > 2:795006/5‑148 (MQ=255) ccAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGc < 2:2368111/35‑1 (MQ=255) ccAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGc > 1:2368111/1‑35 (MQ=255) cAGGTCGACGACGTGCTGTCCAACCCCAGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATc < 2:305304/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATc < 1:1926282/150‑1 (MQ=255) aGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCg > 1:2214272/1‑150 (MQ=255) gTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGac > 2:1725116/1‑150 (MQ=255) tCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGaca < 2:1257973/150‑1 (MQ=255) tCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGaca > 1:1119792/1‑150 (MQ=255) gacgacCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTgg < 2:326734/55‑1 (MQ=255) gacgacCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTgg > 1:326734/1‑55 (MQ=255) gacgacCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACg > 1:1338341/1‑150 (MQ=255) gacgacCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACg > 2:1696078/1‑150 (MQ=255) | GGAGGATGTCAGCCCGCAGACCATTTTTGTTTCGGCCACTCCGGGCCCCTACGAGGCTGAGCATGCCGGGCGCGTGGTGGAGCAAGTGGTGCGCCCGACCGGGCTGGTCGACCCGCAGGTAGAGGTGCGCCCGGCGCTGAC‑CCAGGTCGACGACCTGCTGTCCGAGATCCGCAAGCGTGTCGCGGCAGGCGAGCGAGTGCTGGCGACCACGTTGACCAAACGCATGGCCGAGGACCTCAGCGATTACCTGGCCGACCACGACGTGCGGGTACGCTACCTGCACTCGGACATCGACACG > NC_002947/2236075‑2236372 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |