Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,241,611 | G→C | 9.6% | noncoding (35/76 nt) | PP_t25 → | tRNA‑Ala |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,241,611 | 0 | G | C | 9.6% | 228.7 / 13.8 | 73 | noncoding (35/76 nt) | PP_t25 | tRNA‑Ala |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/35); new base C (4/3); total (35/38) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.03e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.90e-01 |
AATTAGTTTGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTT > NC_002947/2241466‑2241760 | aaTTAGTTTGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTgcatggcatg > 2:2284794/1‑150 (MQ=255) aTTAGTTTGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGc < 1:1559166/150‑1 (MQ=255) tttGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCaggag < 2:767500/150‑1 (MQ=255) aGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGc < 1:134027/150‑1 (MQ=255) aGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGc < 2:1440242/150‑1 (MQ=255) acccTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGAGTTGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCCCACTCCCAGTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCg < 1:540662/149‑1 (MQ=37) cTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAGAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGtt < 2:176427/150‑1 (MQ=255) cTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGtt < 1:2284794/150‑1 (MQ=255) gCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGGGGTTCg > 1:608486/1‑150 (MQ=255) tCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATcc > 2:568321/1‑150 (MQ=255) aaCTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCt < 2:2016451/150‑1 (MQ=255) gcCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCaa > 1:2252617/1‑150 (MQ=255) gcCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCaa > 1:863066/1‑150 (MQ=255) cccGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAAt > 2:2344724/1‑150 (MQ=255) ccGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAAtt < 1:108783/150‑1 (MQ=255) ccGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGACAGAGATTCCGCTGATCGCGACATTGTGAGCCTATATCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAAtt > 1:1499118/1‑150 (MQ=21) tCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCg > 1:335366/1‑150 (MQ=255) acaGCGATGAACGAAAACTAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTTTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCtt > 2:10514/1‑150 (MQ=255) aacgaaaacgaaACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTaa < 2:866827/150‑1 (MQ=255) gaaaacgaaaCGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGc > 1:1677137/1‑150 (MQ=255) actgaaacgCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGa > 2:1030945/4‑150 (MQ=255) gaaacgCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATaa > 2:2101640/1‑150 (MQ=255) gaaacgACAGGCCCCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATaa < 2:891328/150‑1 (MQ=255) aacgCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTa < 1:242335/111‑1 (MQ=255) aacgCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTa > 2:242335/1‑111 (MQ=255) cgCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCaa < 2:1517864/150‑1 (MQ=255) gCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGt < 2:1683209/95‑1 (MQ=255) gCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGt > 1:1683209/1‑95 (MQ=255) aGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGtt > 1:1711505/1‑93 (MQ=255) aGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGtt < 2:1711505/93‑1 (MQ=255) aGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGAcc < 1:2101640/150‑1 (MQ=255) gCAGCCAGCCAGGGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATACCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCgg < 2:1938216/150‑1 (MQ=255) gCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCgg < 2:863066/150‑1 (MQ=255) cACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTTCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCggg < 1:2344724/150‑1 (MQ=255) aCCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCgg > 2:789504/1‑148 (MQ=255) aCCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCgg < 1:789504/148‑1 (MQ=255) aCCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGt < 2:335366/150‑1 (MQ=255) ccagccagCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGc > 1:1128496/1‑130 (MQ=255) ccagccagCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGc < 2:1128496/130‑1 (MQ=255) agccagcGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAg < 2:1499118/150‑1 (MQ=255) cagcGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTagcag < 2:906121/118‑1 (MQ=255) cagcGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTagcag > 1:906121/1‑118 (MQ=255) tCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTc < 1:1030945/150‑1 (MQ=255) aGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTc > 2:1207741/1‑99 (MQ=255) aGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTc < 1:1207741/99‑1 (MQ=255) aGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCCCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCtt > 2:74433/1‑150 (MQ=255) ttCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCACGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGa > 2:2001080/1‑150 (MQ=255) tgctaaGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTagca < 1:740485/102‑1 (MQ=255) tgctaaGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTagca > 2:740485/5‑106 (MQ=255) aTTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAgg > 1:788185/1‑150 (MQ=255) cTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCggg > 1:1901425/1‑118 (MQ=255) cTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCggg < 2:1901425/118‑1 (MQ=255) tGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTgg > 2:1673782/1‑150 (MQ=255) tGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTgg > 1:1590462/1‑150 (MQ=255) ggAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGAcc < 1:2036419/94‑1 (MQ=255) ggAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGAcc > 2:2036419/1‑94 (MQ=255) gagCGCCTGCCTGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAg < 1:1573461/150‑1 (MQ=255) gagCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAg < 1:568321/150‑1 (MQ=255) agCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAg > 1:1094161/1‑141 (MQ=255) agCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAg < 2:1094161/141‑1 (MQ=255) ctccTGCATGCCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCtt < 1:1201227/106‑1 (MQ=255) ctccTGCATGCCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCtt > 2:1201227/3‑108 (MQ=255) ctccTGCATGCCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGac > 2:627337/3‑150 (MQ=255) cgcCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTcccc < 1:799780/130‑1 (MQ=255) cgcCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTcccc > 2:799780/1‑130 (MQ=255) tccTGCATGCCATGCAGGCGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTaagaag < 1:1119981/118‑1 (MQ=255) tccTGCATGCCATGCAGGCGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTaagaag > 2:1119981/2‑119 (MQ=255) ccTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGacac > 2:1620771/1‑150 (MQ=255) cTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAgg < 2:366842/70‑1 (MQ=255) cTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAgg > 1:366842/1‑70 (MQ=255) cTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACAcc > 1:731961/1‑150 (MQ=255) cTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACAcc < 1:1620771/150‑1 (MQ=255) cTGCATGCCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCa < 1:732725/92‑1 (MQ=255) cTGCATGCCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCa > 2:732725/1‑92 (MQ=255) gcatgccatgCAGGCGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGc > 1:1577329/1‑150 (MQ=255) ggcatgCAGGAGGTCAGCGGTTCGCGCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCAGATAAGGAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCtt > 2:2046290/1‑150 (MQ=255) gcatgCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCttt < 2:788185/150‑1 (MQ=255) | AATTAGTTTGACAGCCCTGCAATCCGAACTTAATATGCGCCCCGTCCACAGCGATGAACGAAAACGAAACGCCAGGCACCCAGCCAGCGATTCAGTTCAAAGCGACATTGTGGGGCTATAGCTCAGCTGGGAGAGCGCCTGCATGGCATGCAGGAGGTCAGCGGTTCGATCCCGCTTAGCTCCACCAAATTCCGCTTAGCAGCTAAGGCTGATAAGCAAGACCGGGTCCAGCAACCGGGTCTTGAAGGTAAGAAGGTTCGTCCCCTTCGTCTAGTGGCCTAGGACACCGCCCTTT > NC_002947/2241466‑2241760 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |