| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,265,717 | G→T | 6.1% | R245L (CGC→CTC) | folC → | bifunctional folypolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,265,717 | 0 | G | T | 6.1% | 253.6 / 3.5 | 80 | R245L (CGC→CTC) | folC | bifunctional folypolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/40); new base T (3/2); total (38/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.64e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
GATCTGGATCCGCCCGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGACCTCCGTAA > NC_002947/2265569‑2265861 | gagcTGGATCCGCCCGGGCCGTTGCGGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGGCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTgcgc < 2:36604/147‑1 (MQ=255) aTCTGGATCCGCCCGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGcgcg > 1:774362/1‑150 (MQ=255) aTCTGGATCCGCCCGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCAAAGAGCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGCTCGACCTgcgca < 1:635573/150‑2 (MQ=255) gtaggctcccGTGCCGTTGTTGGACAAGGCCGCCGAACTGGGCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGTCGCTGATGGGGCGCACGTCGCGCAGCTCGACCt < 2:869956/143‑1 (MQ=255) ggATCCGCCCGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCNACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCt > 1:187817/1‑150 (MQ=255) ccGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGc < 2:457285/150‑1 (MQ=255) cGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCt > 1:2010074/1‑150 (MQ=255) gTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGTGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTgg > 2:1751095/1‑146 (MQ=255) gTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTgg < 1:1751095/146‑1 (MQ=255) ttGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGAc > 2:1264550/1‑147 (MQ=255) ttGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGAc < 1:1264550/147‑1 (MQ=255) ttGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTg > 1:1985042/1‑150 (MQ=255) ggACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCAt < 1:1036338/150‑1 (MQ=255) ggACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCAt < 2:1170638/150‑1 (MQ=255) gACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGTTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATg > 2:749931/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGaaaa < 2:2226051/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCGAACTGGCCGCGCAAGTGTTCGTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTTGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGGGCTCGCGTGGTACCGCCGCTGGTGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGCCGTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGaaaa < 2:187817/150‑1 (MQ=255) ccgAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCa < 1:1465944/150‑1 (MQ=255) tGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCGGGCCAGTGCCGAATGCTGCTGGAGCTGGCGTAGTACTGCCGCTGGTGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTgg > 2:495954/1‑150 (MQ=255) gcgcCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTg < 2:2004676/150‑1 (MQ=255) ccACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGGCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCCGGGCGTGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAg > 1:782224/1‑150 (MQ=255) ccACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAg < 2:852619/150‑1 (MQ=255) cACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAgg > 1:718657/1‑150 (MQ=255) aCTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGc > 2:664419/1‑150 (MQ=255) tGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCtt < 1:1167497/150‑1 (MQ=255) tGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCtt < 1:2402838/150‑1 (MQ=255) ttCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑Tc > 1:464365/1‑150 (MQ=255) tCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑Tcc < 2:774362/150‑1 (MQ=255) ccTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCct < 2:2010074/150‑1 (MQ=255) cTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTg < 2:1822230/132‑1 (MQ=255) cTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTg > 1:1822230/1‑132 (MQ=255) cTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGc > 1:1191895/1‑134 (MQ=255) cTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGc < 2:1191895/134‑1 (MQ=255) cTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCctg > 2:1959158/1‑150 (MQ=255) gggAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGc > 1:1851447/1‑150 (MQ=255) ggAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCt > 2:1185669/1‑150 (MQ=255) aaTTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCctgc < 2:2156119/138‑1 (MQ=255) aaTTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCctgc > 1:2156119/1‑138 (MQ=255) tCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGTTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGt < 1:749931/150‑1 (MQ=255) cGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTg < 1:17472/150‑1 (MQ=255) cGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTg < 2:1315807/150‑1 (MQ=255) gACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTgg > 2:2403513/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGa > 2:835953/1‑150 (MQ=255) ccTGGTCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGaa < 1:25921/150‑1 (MQ=255) cTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAAc > 2:979791/1‑150 (MQ=255) gCCAGTCCCGAAGCCTGCTGGAGCTGCCCTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTTCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAAcgcc < 1:1189903/150‑2 (MQ=255) cAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGTGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACgcggc > 2:2363523/1‑150 (MQ=255) gTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGgcgc > 2:1392581/1‑150 (MQ=255) ctGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGgcgc > 2:1657119/2‑150 (MQ=255) gctgGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAgg < 1:2323977/150‑1 (MQ=255) ctgGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGgc > 2:580753/1‑150 (MQ=255) tgGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGgcg < 1:2019796/150‑1 (MQ=255) ggAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGgcgc > 1:825664/1‑150 (MQ=255) ggAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGgcgc < 2:718657/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCgctgc < 2:2090605/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCCACCTGCCTTGGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCgctgc < 1:1969726/150‑1 (MQ=255) ggCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTgg < 2:1765009/150‑1 (MQ=255) gCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCaa > 2:1635130/1‑130 (MQ=255) gCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCaa < 1:1635130/130‑1 (MQ=255) gCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGa < 1:1392581/150‑1 (MQ=255) tGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCC‑TGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATc > 2:1496942/1‑150 (MQ=255) cTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTg < 2:464365/150‑1 (MQ=255) cTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTg < 1:1077867/150‑1 (MQ=255) cTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTg < 1:664419/150‑1 (MQ=255) cTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCCAACAGGCTTAATACTGGAGAT‑‑GGTTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTg > 1:171923/1‑150 (MQ=255) tGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTgg < 1:835953/150‑1 (MQ=255) aaggcAGGTCGCGCAGCTCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCaa < 2:2323081/106‑1 (MQ=255) aaggcAGGTCGCGCAGCTCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCaa > 1:2323081/4‑109 (MQ=255) aaggcAGGTCGCGCAGCTCGACCTGAAATTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGtct > 1:1873492/4‑150 (MQ=255) gcAGGTCGCGCAGCTCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGa > 2:951684/1‑150 (MQ=255) gcAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCa > 2:1282114/1‑66 (MQ=255) gcAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCa < 1:1282114/66‑1 (MQ=255) gcAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑Tc > 2:604094/1‑73 (MQ=255) gcAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑Tc < 1:604094/73‑1 (MQ=255) gcAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGAt > 1:343053/1‑81 (MQ=255) gcAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGAt < 2:343053/81‑1 (MQ=255) gcAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGa < 1:2403513/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGAc < 2:825664/150‑1 (MQ=255) gTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGACCTc > 2:2076205/1‑150 (MQ=255) gAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCctgct > 2:598573/1‑71 (MQ=255) gAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCctgct < 1:598573/71‑1 (MQ=255) gCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGACCTCCGTaa > 2:1699076/1‑150 (MQ=255) gCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATAACTGGGCGTCTCGACCCCCgaca > 2:373482/1‑147 (MQ=255) cgcgACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATgggg > 1:917587/1‑72 (MQ=255) cgcgACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATgggg < 2:917587/72‑1 (MQ=255) | GATCTGGATCCGCCCGGGCCGTTGCTGGACAAGGCCGCCGAACTGGCCGCGCCACTGTTCCTGCGCGGTCGGGAATTCGACCTGGCCAGTGCCGAAGGCTGCTGGAGCTGGCGTGGTACTGCCGCTGATGGTGCGCAGGTCGAGCTGCGCGACCTGCCTTTGCTGGACCTGCCCATGGAAAACGCCACGCTGGCCTTGCAGGCTT‑‑TCCTGCTGATGGGGCTGCCGTGGAACGCGGCGCAAGTCCGCCAGGCGCTGCTGGATACCCGTATCACTGGGCGTCTCGACCTCCGTAA > NC_002947/2265569‑2265861 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |